Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G076500.1
Synonym KAPP, RAG1, Sb02g006370
Functional annotation protein Kinase-associated protein phosphatase, putative, expressed
UniProt C5XDB2
Pfam PF00498 PF00481
Panther DB PTHR13832 PTHR13832:SF224
NCBI CDD KOG0698; Serine/threonine protein phosphatase
KEGG Orthology K01090; protein phosphatase
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0003824catalytic activity GO:0006470protein dephosphorylation GO:0004722protein serine/threonine phosphatase activity GO:0004721phosphoprotein phosphatase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19280 : kinase associated protein phosphatase
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g11010.1 : protein Kinase-associated protein phosphatase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013408 , Zm00025a045394
Brachypodium KQK20371 , PNT76827
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G076500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G153500 metal cation transporter, putative, expressed K14713: SLC39A7, KE4, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 7
2 Sobic.008G116700 expressed protein -
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16 Sobic.002G398700 tim44-like domain containing protein, expressed K17426: large subunit ribosomal protein L45
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19 Sobic.001G340300 tentative name(PubMedID : 31536532)@expressed protein -
20 Sobic.003G113300 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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