Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G150600.3
Synonym Sb05g021450
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y8K2
Pfam -
Panther DB PTHR35512
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G43680 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g34950.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034094
Brachypodium PNT63475
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G150600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G172500 expressed protein -
2 Sobic.010G244900 auxin efflux carrier, putative, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
3 Sobic.002G076500 protein Kinase-associated protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
4 Sobic.006G141600 dehydrogenase, putative, expressed K00031: IDH1, IDH2, isocitrate dehydrogenase
5 Sobic.007G153500 metal cation transporter, putative, expressed K14713: SLC39A7, KE4, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 7
6 Sobic.002G292900 protein binding protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G213800 expressed protein -
8 Sobic.004G030400 expressed protein -
9 Sobic.009G112300 kinase, pfkB family, putative, expressed -
10 Sobic.002G343200 homeodomain-like, putative, expressed -
11 Sobic.005G111700 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
12 Sobic.001G025700 protein phosphatase 2C, putative, expressed K01102: pyruvate dehydrogenase phosphatase
13 Sobic.001G250700 expressed protein -
14 Sobic.004G320700 CCR4-NOT transcription factor, putative, expressed K12605: CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2
15 Sobic.001G116500 phosphoglucomutase, putative, expressed K01835: phosphoglucomutase
16 Sobic.001G237600 transcription factor Dp, putative, expressed K04683: transcription factor Dp-1
17 Sobic.009G113100 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@RNA recognition motif containing protein, expressed K12890: SFRS1, ASF, splicing factor, arginine/serine-rich 1
18 Sobic.010G071100 expressed protein -
19 Sobic.002G369701 - K06877: DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein
20 Sobic.008G152000 biotin--protein ligase, putative, expressed K03801: lipoyl(octanoyl) transferase


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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