Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G111700.2,Sobic.005G111700.1
Synonym Sb05g013190, ZFN1
Functional annotation zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed
UniProt A0A1Z5RII6 , A0A1Z5RI56
Pfam PF00642
Panther DB PTHR12506 PTHR12506:SF25
NCBI CDD KOG1677; CCCH-type Zn-finger protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G02830 : zinc finger protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g28270.1 : zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012638 , Zm00025a029763
Brachypodium KQJ88508
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G111700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.007G076400 expressed protein -
19 Sobic.002G079000 expressed protein -
20 Sobic.002G181600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G111700 Sobic005G111700 Sobic001G116500 Sobic001G116500 Sobic005G111700--Sobic001G116500 Sobic001G095000 Sobic001G095000 Sobic005G111700--Sobic001G095000 Sobic005G150600 Sobic005G150600 Sobic005G111700--Sobic005G150600 Sobic002G388000 Sobic002G388000 Sobic005G111700--Sobic002G388000 Sobic001G201900 Sobic001G201900 Sobic005G111700--Sobic001G201900 Sobic003G402000 Sobic003G402000 Sobic005G111700--Sobic003G402000 Sobic002G335000 Sobic002G335000 Sobic005G111700--Sobic002G335000 Sobic003G403300 Sobic003G403300 Sobic005G111700--Sobic003G403300 Sobic004G320700 Sobic004G320700 Sobic005G111700--Sobic004G320700 Sobic004G094700 Sobic004G094700 Sobic001G116500--Sobic004G094700 Sobic001G537100 Sobic001G537100 Sobic001G116500--Sobic001G537100 Sobic001G116500--Sobic005G111700 Sobic006G039400 Sobic006G039400 Sobic001G116500--Sobic006G039400 Sobic001G178100 Sobic001G178100 Sobic001G116500--Sobic001G178100 Sobic003G279200 Sobic003G279200 Sobic001G116500--Sobic003G279200 Sobic004G018000 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Octagon: transcription factors


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