Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G388000.4,Sobic.002G388000.3
Synonym Sb02g040420
Functional annotation SNARE associated Golgi protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0W7I5 , A0A1W0W7M7
Pfam PF09335
Panther DB PTHR12677 PTHR12677:SF28
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02370 : SNARE associated Golgi protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g44020.1 : SNARE associated Golgi protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048880
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G388000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic002G388000 Sobic002G388000 Sobic009G156100 Sobic009G156100 Sobic002G388000--Sobic009G156100 Sobic005G023800 Sobic005G023800 Sobic002G388000--Sobic005G023800 Sobic008G011300 Sobic008G011300 Sobic002G388000--Sobic008G011300 Sobic008G116700 Sobic008G116700 Sobic002G388000--Sobic008G116700 Sobic005G111700 Sobic005G111700 Sobic002G388000--Sobic005G111700 Sobic003G272700 Sobic003G272700 Sobic002G388000--Sobic003G272700 Sobic009G107300 Sobic009G107300 Sobic002G388000--Sobic009G107300 Sobic001G464400 Sobic001G464400 Sobic002G388000--Sobic001G464400 Sobic010G068700 Sobic010G068700 Sobic002G388000--Sobic010G068700 Sobic003G377500 Sobic003G377500 Sobic009G156100--Sobic003G377500 Sobic004G068100 Sobic004G068100 Sobic009G156100--Sobic004G068100 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic009G156100--Sobic001G114200 Sobic009G156100--Sobic008G116700 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic009G156100--Sobic006G060000 Sobic007G076400 Sobic007G076400 Sobic009G156100--Sobic007G076400 Sobic003G181700 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Sobic010G068700--Sobic001G049400 Sobic010G068700--Sobic006G039400 Sobic001G014200 Sobic001G014200 Sobic010G068700--Sobic001G014200 Sobic006G174850 Sobic006G174850 Sobic010G068700--Sobic006G174850
Octagon: transcription factors


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