Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G069300.2,Sobic.008G069300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PC34 , A0A1B6PC66
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G046900 N-acetylglucosaminyltransferase, putative, expressed -
2 Sobic.002G074800 - -
3 Sobic.003G428000 expressed protein -
4 Sobic.009G148600 DUF803 domain containing, putative, expressed -
5 Sobic.010G109800 - -
6 Sobic.009G229400 60S acidic ribosomal protein P0, putative, expressed K02941: RP-LP0, large subunit ribosomal protein LP0
7 Sobic.003G198900 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
8 Sobic.009G156800 expressed protein -
9 Sobic.006G270000 expressed protein -
10 Sobic.006G204400 maltose excess protein 1-like, chloroplast precursor, putative, expressed -
11 Sobic.008G136700 expressed protein -
12 Sobic.005G048500 serine esterase family protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G130601 - -
14 Sobic.003G178800 - -
15 Sobic.010G145100 - -
16 Sobic.006G193400 regulatory protein, putative, expressed -
17 Sobic.005G185500 - -
18 Sobic.009G178400 oxidoreductase, putative, expressed K00472: prolyl 4-hydroxylase
19 Sobic.005G174750 - -
20 Sobic.001G257200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transcription initiation factor IIE subunit beta, putative, expressed K03137: TFIIE2, GTF2E2, transcription initiation factor TFIIE subunit beta


Gene co-expression network
sample Sobic008G069300 Sobic008G069300 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic008G069300--Sobic009G046900 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic008G069300--Sobic002G074800 Sobic003G428000 Sobic003G428000 Sobic008G069300--Sobic003G428000 Sobic009G148600 Sobic009G148600 Sobic008G069300--Sobic009G148600 Sobic010G109800 Sobic010G109800 Sobic008G069300--Sobic010G109800 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic008G069300--Sobic009G229400 Sobic003G198900 Sobic003G198900 Sobic008G069300--Sobic003G198900 Sobic009G156800 Sobic009G156800 Sobic008G069300--Sobic009G156800 Sobic006G270000 Sobic006G270000 Sobic008G069300--Sobic006G270000 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic009G046900--Sobic001G149000 Sobic009G178400 Sobic009G178400 Sobic009G046900--Sobic009G178400 Sobic002G233600 Sobic002G233600 Sobic009G046900--Sobic002G233600 Sobic006G134500 Sobic006G134500 Sobic009G046900--Sobic006G134500 Sobic009G046900--Sobic002G074800 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic009G046900--Sobic003G385300 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic009G046900--Sobic001G384200 Sobic006G193400 Sobic006G193400 Sobic009G046900--Sobic006G193400 Sobic003G358600 Sobic003G358600 Sobic009G046900--Sobic003G358600 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic002G074800--Sobic004G064200 Sobic006G001100 Sobic006G001100 Sobic002G074800--Sobic006G001100 Sobic006G204400 Sobic006G204400 Sobic002G074800--Sobic006G204400 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic002G074800--Sobic008G136601 Sobic010G114200 Sobic010G114200 Sobic002G074800--Sobic010G114200 Sobic006G143900 Sobic006G143900 Sobic002G074800--Sobic006G143900 Sobic004G228300 Sobic004G228300 Sobic002G074800--Sobic004G228300 Sobic005G048500 Sobic005G048500 Sobic002G074800--Sobic005G048500 Sobic008G136700 Sobic008G136700 Sobic002G074800--Sobic008G136700 Sobic003G428000--Sobic001G149000 Sobic003G428000--Sobic009G046900 Sobic004G194400 Sobic004G194400 Sobic003G428000--Sobic004G194400 Sobic008G152700 Sobic008G152700 Sobic003G428000--Sobic008G152700 Sobic010G274800 Sobic010G274800 Sobic003G428000--Sobic010G274800 Sobic009G252300 Sobic009G252300 Sobic003G428000--Sobic009G252300 Sobic003G428000--Sobic003G385300 Sobic004G082800 Sobic004G082800 Sobic003G428000--Sobic004G082800 Sobic003G428000--Sobic002G074800 Sobic009G148600--Sobic006G193400 Sobic004G298200 Sobic004G298200 Sobic009G148600--Sobic004G298200 Sobic007G212500 Sobic007G212500 Sobic009G148600--Sobic007G212500 Sobic003G024400 Sobic003G024400 Sobic009G148600--Sobic003G024400 Sobic003G244400 Sobic003G244400 Sobic009G148600--Sobic003G244400 Sobic002G192800 Sobic002G192800 Sobic009G148600--Sobic002G192800 Sobic009G148600--Sobic006G204400 Sobic009G148600--Sobic009G178400 Sobic009G148600--Sobic006G143900 Sobic001G307500 Sobic001G307500 Sobic010G109800--Sobic001G307500 Sobic001G257200 Sobic001G257200 Sobic010G109800--Sobic001G257200 Sobic006G079800 Sobic006G079800 Sobic010G109800--Sobic006G079800 Sobic005G076800 Sobic005G076800 Sobic010G109800--Sobic005G076800 Sobic010G109800--Sobic003G024400 Sobic001G106800 Sobic001G106800 Sobic010G109800--Sobic001G106800 Sobic010G109800--Sobic006G204400 Sobic002G095600 Sobic002G095600 Sobic010G109800--Sobic002G095600 Sobic010G109800--Sobic002G192800 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic009G229400--Sobic008G029800 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic009G229400--Sobic010G266600 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic009G229400--Sobic010G038300 Sobic009G229400--Sobic002G192800 Sobic009G229400--Sobic006G204400 Sobic008G071800 Sobic008G071800 Sobic009G229400--Sobic008G071800 Sobic005G174750 Sobic005G174750 Sobic009G229400--Sobic005G174750 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic009G229400--Sobic006G070032 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic009G229400--Sobic002G060101 Sobic003G250400 Sobic003G250400 Sobic003G198900--Sobic003G250400 Sobic004G302800 Sobic004G302800 Sobic003G198900--Sobic004G302800 Sobic003G198900--Sobic006G270000 Sobic001G257800 Sobic001G257800 Sobic003G198900--Sobic001G257800 Sobic003G198900--Sobic003G024400 Sobic003G198900--Sobic002G074800 Sobic003G198900--Sobic001G257200 Sobic003G198900--Sobic008G069300 Sobic004G213300 Sobic004G213300 Sobic003G198900--Sobic004G213300 Sobic009G156800--Sobic009G046900 Sobic002G213900 Sobic002G213900 Sobic009G156800--Sobic002G213900 Sobic009G156800--Sobic002G074800 Sobic009G156800--Sobic009G178400 Sobic009G156800--Sobic003G385300 Sobic001G539400 Sobic001G539400 Sobic009G156800--Sobic001G539400 Sobic009G156800--Sobic002G233600 Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic009G156800--Sobic003G402800 Sobic009G156800--Sobic001G149000 Sobic006G270000--Sobic003G024400 Sobic006G270000--Sobic009G148600 Sobic006G270000--Sobic005G048500 Sobic006G270000--Sobic002G074800 Sobic006G270000--Sobic006G204400 Sobic006G270000--Sobic006G193400 Sobic010G149800 Sobic010G149800 Sobic006G270000--Sobic010G149800 Sobic006G270000--Sobic004G228300 Sobic006G270000--Sobic003G198900
Octagon: transcription factors


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