Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G185500.3,Sobic.005G185500.2,Sobic.005G185500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PTD2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.005G185500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G389600 transcription regulator, putative, expressed -
2 Sobic.003G385300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G093600 - -
4 Sobic.007G039200 MYB family transcription factor, putative, expressed -
5 Sobic.006G001100 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G225500 expressed protein -
7 Sobic.002G102300 - -
8 Sobic.006G162500 - -
9 Sobic.003G402800 DUF647 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G074800 - -
11 Sobic.008G136601 - -
12 Sobic.001G384200 glycosyl transferase, family 8, putative, expressed K13648: alpha-1,4-galacturonosyltransferase
13 Sobic.010G255900 DNL zinc finger domain containing protein, putative, expressed K17808: ZIM17, DNLZ, mitochondrial protein import protein ZIM17
14 Sobic.003G236000 CGMC_MAPKCMGC_2.5 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K04371: ERK, mitogen-activated protein kinase 1/3
15 Sobic.003G024100 MRH1, putative, expressed -
16 Sobic.007G101600 - -
17 Sobic.001G340800 exocyst complex component 6, putative, expressed -
18 Sobic.005G135100 expressed protein -
19 Sobic.006G134500 calcium-binding mitochondrial protein anon-60Da, putative, expressed K17800: LETM1, LETM1 and EF-hand domain-containing protein 1, mitochondrial
20 Sobic.010G202200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G185500 Sobic005G185500 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic005G185500--Sobic002G389600 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic005G185500--Sobic003G385300 Sobic006G093600 Sobic006G093600 Sobic005G185500--Sobic006G093600 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic005G185500--Sobic007G039200 Sobic006G001100 Sobic006G001100 Sobic005G185500--Sobic006G001100 Sobic005G225500 Sobic005G225500 Sobic005G185500--Sobic005G225500 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic005G185500--Sobic002G102300 Sobic006G162500 Sobic006G162500 Sobic005G185500--Sobic006G162500 Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic005G185500--Sobic003G402800 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic002G389600--Sobic008G136601 Sobic008G148600 Sobic008G148600 Sobic002G389600--Sobic008G148600 Sobic006G069766 Sobic006G069766 Sobic002G389600--Sobic006G069766 Sobic009G061500 Sobic009G061500 Sobic002G389600--Sobic009G061500 Sobic001G340800 Sobic001G340800 Sobic002G389600--Sobic001G340800 Sobic003G304600 Sobic003G304600 Sobic002G389600--Sobic003G304600 Sobic006G105100 Sobic006G105100 Sobic002G389600--Sobic006G105100 Sobic004G358000 Sobic004G358000 Sobic002G389600--Sobic004G358000 Sobic002G380300 Sobic002G380300 Sobic002G389600--Sobic002G380300 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic003G385300--Sobic001G149000 Sobic003G385300--Sobic003G402800 Sobic004G077300 Sobic004G077300 Sobic003G385300--Sobic004G077300 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic003G385300--Sobic004G064200 Sobic004G176200 Sobic004G176200 Sobic003G385300--Sobic004G176200 Sobic001G257800 Sobic001G257800 Sobic003G385300--Sobic001G257800 Sobic003G385300--Sobic005G225500 Sobic003G385300--Sobic007G039200 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic003G385300--Sobic002G074800 Sobic010G242600 Sobic010G242600 Sobic006G093600--Sobic010G242600 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic006G093600--Sobic001G029300 Sobic002G190750 Sobic002G190750 Sobic006G093600--Sobic002G190750 Sobic001G163666 Sobic001G163666 Sobic006G093600--Sobic001G163666 Sobic002G101600 Sobic002G101600 Sobic006G093600--Sobic002G101600 Sobic009G207700 Sobic009G207700 Sobic006G093600--Sobic009G207700 Sobic006G074150 Sobic006G074150 Sobic006G093600--Sobic006G074150 Sobic002G015900 Sobic002G015900 Sobic006G093600--Sobic002G015900 Sobic001G068066 Sobic001G068066 Sobic006G093600--Sobic001G068066 Sobic007G039200--Sobic001G340800 Sobic007G039200--Sobic002G389600 Sobic007G039200--Sobic009G061500 Sobic007G039200--Sobic008G136601 Sobic009G230800 Sobic009G230800 Sobic007G039200--Sobic009G230800 Sobic004G290600 Sobic004G290600 Sobic007G039200--Sobic004G290600 Sobic008G166100 Sobic008G166100 Sobic007G039200--Sobic008G166100 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic007G039200--Sobic001G384200 Sobic008G159701 Sobic008G159701 Sobic007G039200--Sobic008G159701 Sobic006G001100--Sobic008G136601 Sobic007G176900 Sobic007G176900 Sobic006G001100--Sobic007G176900 Sobic006G027601 Sobic006G027601 Sobic006G001100--Sobic006G027601 Sobic003G333100 Sobic003G333100 Sobic006G001100--Sobic003G333100 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic006G001100--Sobic009G061601 Sobic006G205400 Sobic006G205400 Sobic006G001100--Sobic006G205400 Sobic002G295800 Sobic002G295800 Sobic006G001100--Sobic002G295800 Sobic003G175000 Sobic003G175000 Sobic006G001100--Sobic003G175000 Sobic002G254700 Sobic002G254700 Sobic006G001100--Sobic002G254700 Sobic005G225500--Sobic006G001100 Sobic005G225500--Sobic008G159701 Sobic002G106600 Sobic002G106600 Sobic005G225500--Sobic002G106600 Sobic005G003700 Sobic005G003700 Sobic005G225500--Sobic005G003700 Sobic007G070900 Sobic007G070900 Sobic005G225500--Sobic007G070900 Sobic005G225500--Sobic004G290600 Sobic004G308800 Sobic004G308800 Sobic005G225500--Sobic004G308800 Sobic005G225500--Sobic007G176900 Sobic005G225500--Sobic006G205400 Sobic010G006800 Sobic010G006800 Sobic002G102300--Sobic010G006800 Sobic007G101600 Sobic007G101600 Sobic002G102300--Sobic007G101600 Sobic003G238250 Sobic003G238250 Sobic002G102300--Sobic003G238250 Sobic001G490950 Sobic001G490950 Sobic002G102300--Sobic001G490950 Sobic004G074900 Sobic004G074900 Sobic002G102300--Sobic004G074900 Sobic003G392275 Sobic003G392275 Sobic002G102300--Sobic003G392275 Sobic004G140400 Sobic004G140400 Sobic002G102300--Sobic004G140400 Sobic001G286900 Sobic001G286900 Sobic002G102300--Sobic001G286900 Sobic007G138000 Sobic007G138000 Sobic002G102300--Sobic007G138000 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic006G162500--Sobic002G418300 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic006G162500--Sobic004G203150 Sobic007G109301 Sobic007G109301 Sobic006G162500--Sobic007G109301 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic006G162500--Sobic007G094700 Sobic006G162500--Sobic001G029300 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic006G162500--Sobic002G189500 Sobic003G133600 Sobic003G133600 Sobic006G162500--Sobic003G133600 Sobic006G162500--Sobic001G163666 Sobic006G162500--Sobic010G242600 Sobic003G402800--Sobic003G385300 Sobic003G402800--Sobic001G257800 Sobic008G055500 Sobic008G055500 Sobic003G402800--Sobic008G055500 Sobic003G402800--Sobic002G074800 Sobic005G048500 Sobic005G048500 Sobic003G402800--Sobic005G048500 Sobic003G402800--Sobic005G185500 Sobic003G402800--Sobic004G064200 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic003G402800--Sobic009G046900 Sobic003G402800--Sobic001G149000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.