Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G202200.1,Sobic.010G202200.3,Sobic.010G202200.2,Sobic.010G202200.4,Sobic.010G202200.5
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YLH2 , A0A194YKD5 , A0A194YKD3 , A0A194YKH0 , A0A194YKG9
Pfam -
Panther DB -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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1 Sobic.009G230800 Up-regulation in phyB-1 mutant(PubMedID : 26893475)@inhibiting the nuclear localization of BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 2(PubMedID : 28273925)@decreased the cell proliferation rates(PubMedID : 27329702)@gibberellin 2-beta-dioxygenase, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
2 Sobic.006G269101 - -
3 Sobic.008G148600 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G136601 - -
5 Sobic.001G340800 exocyst complex component 6, putative, expressed -
6 Sobic.006G027601 - -
7 Sobic.005G110424 - -
8 Sobic.003G156900 expressed protein -
9 Sobic.008G097966 - -
10 Sobic.004G052600 - -
11 Sobic.009G061500 - -
12 Sobic.007G007700 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.005G185900 expressed protein -
14 Sobic.005G003700 - -
15 Sobic.008G020800 GASR10 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
16 Sobic.001G143700 cupin domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G000900 OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.006G001100 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed -
19 Sobic.008G036100 expressed protein -
20 Sobic.003G420500 Ca ATPase 3(PubMedID : 22196357)@calcium-transporting ATPase, plasma membrane-type, putative, expressed K01537: P-type Ca2+ transporter type 2C


Gene co-expression network
sample Sobic010G202200 Sobic010G202200 Sobic009G230800 Sobic009G230800 Sobic010G202200--Sobic009G230800 Sobic006G269101 Sobic006G269101 Sobic010G202200--Sobic006G269101 Sobic008G148600 Sobic008G148600 Sobic010G202200--Sobic008G148600 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic010G202200--Sobic008G136601 Sobic001G340800 Sobic001G340800 Sobic010G202200--Sobic001G340800 Sobic006G027601 Sobic006G027601 Sobic010G202200--Sobic006G027601 Sobic005G110424 Sobic005G110424 Sobic010G202200--Sobic005G110424 Sobic003G156900 Sobic003G156900 Sobic010G202200--Sobic003G156900 Sobic008G097966 Sobic008G097966 Sobic010G202200--Sobic008G097966 Sobic009G230800--Sobic010G202200 Sobic009G230800--Sobic006G269101 Sobic004G052600 Sobic004G052600 Sobic009G230800--Sobic004G052600 Sobic009G230800--Sobic008G136601 Sobic009G230800--Sobic001G340800 Sobic004G328500 Sobic004G328500 Sobic009G230800--Sobic004G328500 Sobic009G230800--Sobic008G148600 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic009G230800--Sobic005G000900 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic009G230800--Sobic005G221675 Sobic006G269101--Sobic008G148600 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic006G269101--Sobic007G160501 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic006G269101--Sobic003G351100 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic006G269101--Sobic001G246001 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic006G269101--Sobic005G214800 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic006G269101--Sobic002G194300 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic006G269101--Sobic009G110800 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic006G269101--Sobic008G125801 Sobic002G126400 Sobic002G126400 Sobic006G269101--Sobic002G126400 Sobic008G148600--Sobic006G269101 Sobic001G232600 Sobic001G232600 Sobic008G148600--Sobic001G232600 Sobic008G148600--Sobic008G136601 Sobic001G248700 Sobic001G248700 Sobic008G148600--Sobic001G248700 Sobic001G094700 Sobic001G094700 Sobic008G148600--Sobic001G094700 Sobic006G001100 Sobic006G001100 Sobic008G136601--Sobic006G001100 Sobic008G136601--Sobic006G269101 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic008G136601--Sobic009G061601 Sobic001G212500 Sobic001G212500 Sobic008G136601--Sobic001G212500 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic008G136601--Sobic005G043300 Sobic001G165700 Sobic001G165700 Sobic008G136601--Sobic001G165700 Sobic008G136601--Sobic002G126400 Sobic007G131000 Sobic007G131000 Sobic008G136601--Sobic007G131000 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic008G136601--Sobic003G445300 Sobic001G370400 Sobic001G370400 Sobic001G340800--Sobic001G370400 Sobic001G340800--Sobic009G061601 Sobic001G340800--Sobic008G136601 Sobic004G290600 Sobic004G290600 Sobic001G340800--Sobic004G290600 Sobic009G061500 Sobic009G061500 Sobic001G340800--Sobic009G061500 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic001G340800--Sobic008G020800 Sobic001G294500 Sobic001G294500 Sobic001G340800--Sobic001G294500 Sobic001G340800--Sobic007G131000 Sobic003G093100 Sobic003G093100 Sobic001G340800--Sobic003G093100 Sobic003G175000 Sobic003G175000 Sobic006G027601--Sobic003G175000 Sobic003G333100 Sobic003G333100 Sobic006G027601--Sobic003G333100 Sobic002G254700 Sobic002G254700 Sobic006G027601--Sobic002G254700 Sobic005G003700 Sobic005G003700 Sobic006G027601--Sobic005G003700 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic006G027601--Sobic003G420500 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic006G027601--Sobic010G276100 Sobic009G175400 Sobic009G175400 Sobic006G027601--Sobic009G175400 Sobic006G027601--Sobic002G126400 Sobic010G040400 Sobic010G040400 Sobic006G027601--Sobic010G040400 Sobic005G110424--Sobic003G156900 Sobic005G185900 Sobic005G185900 Sobic005G110424--Sobic005G185900 Sobic005G110424--Sobic008G148600 Sobic005G110424--Sobic009G061500 Sobic005G110424--Sobic006G027601 Sobic005G054401 Sobic005G054401 Sobic005G110424--Sobic005G054401 Sobic005G110424--Sobic003G175000 Sobic005G110424--Sobic008G136601 Sobic005G110424--Sobic001G094700 Sobic003G156900--Sobic003G175000 Sobic007G091400 Sobic007G091400 Sobic003G156900--Sobic007G091400 Sobic003G156900--Sobic002G254700 Sobic003G156900--Sobic001G232600 Sobic009G102700 Sobic009G102700 Sobic003G156900--Sobic009G102700 Sobic003G400000 Sobic003G400000 Sobic003G156900--Sobic003G400000 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic003G156900--Sobic001G228000 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic003G156900--Sobic002G106800 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic003G156900--Sobic009G096700 Sobic010G188500 Sobic010G188500 Sobic008G097966--Sobic010G188500 Sobic006G042600 Sobic006G042600 Sobic008G097966--Sobic006G042600 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic008G097966--Sobic002G194201 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic008G097966--Sobic007G122600 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic008G097966--Sobic008G086500 Sobic005G040100 Sobic005G040100 Sobic008G097966--Sobic005G040100 Sobic001G143700 Sobic001G143700 Sobic008G097966--Sobic001G143700 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic008G097966--Sobic002G006200 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic008G097966--Sobic007G134501
Octagon: transcription factors


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