Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G156900.1
Synonym Sb03g013670
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XJU2
Pfam PF05553
Panther DB PTHR36378
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g23880.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024474
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G175000 respiratory burst oxidase, putative, expressed -
2 Sobic.007G091400 diacylglycerol kinase catalytic domain family protein, expressed K00901: dgkA, diacylglycerol kinase (ATP)
3 Sobic.002G254700 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G232600 - -
5 Sobic.009G102700 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
6 Sobic.003G400000 signal peptide peptidase-like 2B, putative, expressed -
7 Sobic.001G228000 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G106800 expressed protein -
9 Sobic.009G096700 Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.20 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
10 Sobic.001G002200 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
11 Sobic.004G137200 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G093600 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
13 Sobic.009G089532 - -
14 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -
16 Sobic.008G028300 pollen allergen, putative, expressed -
17 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G027800 pollen allergen, putative, expressed -
19 Sobic.004G166100 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
20 Sobic.007G100800 CSLD3 - cellulose synthase-like family D, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G156900 Sobic003G156900 Sobic003G175000 Sobic003G175000 Sobic003G156900--Sobic003G175000 Sobic007G091400 Sobic007G091400 Sobic003G156900--Sobic007G091400 Sobic002G254700 Sobic002G254700 Sobic003G156900--Sobic002G254700 Sobic001G232600 Sobic001G232600 Sobic003G156900--Sobic001G232600 Sobic009G102700 Sobic009G102700 Sobic003G156900--Sobic009G102700 Sobic003G400000 Sobic003G400000 Sobic003G156900--Sobic003G400000 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic003G156900--Sobic001G228000 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic003G156900--Sobic002G106800 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic003G156900--Sobic009G096700 Sobic003G175000--Sobic002G254700 Sobic001G528700 Sobic001G528700 Sobic003G175000--Sobic001G528700 Sobic003G175000--Sobic009G102700 Sobic007G222500 Sobic007G222500 Sobic003G175000--Sobic007G222500 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic003G175000--Sobic004G166100 Sobic001G252900 Sobic001G252900 Sobic003G175000--Sobic001G252900 Sobic001G348600 Sobic001G348600 Sobic003G175000--Sobic001G348600 Sobic010G252600 Sobic010G252600 Sobic003G175000--Sobic010G252600 Sobic007G057600 Sobic007G057600 Sobic003G175000--Sobic007G057600 Sobic004G070600 Sobic004G070600 Sobic007G091400--Sobic004G070600 Sobic007G091400--Sobic009G102700 Sobic007G091400--Sobic010G252600 Sobic007G091400--Sobic002G254700 Sobic007G091400--Sobic001G528700 Sobic002G295800 Sobic002G295800 Sobic007G091400--Sobic002G295800 Sobic001G452500 Sobic001G452500 Sobic007G091400--Sobic001G452500 Sobic009G105100 Sobic009G105100 Sobic007G091400--Sobic009G105100 Sobic006G026200 Sobic006G026200 Sobic007G091400--Sobic006G026200 Sobic009G175400 Sobic009G175400 Sobic002G254700--Sobic009G175400 Sobic009G082900 Sobic009G082900 Sobic002G254700--Sobic009G082900 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic002G254700--Sobic010G276100 Sobic010G144700 Sobic010G144700 Sobic002G254700--Sobic010G144700 Sobic002G254700--Sobic001G252900 Sobic004G002800 Sobic004G002800 Sobic002G254700--Sobic004G002800 Sobic003G073540 Sobic003G073540 Sobic002G254700--Sobic003G073540 Sobic002G254700--Sobic010G252600 Sobic002G254700--Sobic001G528700 Sobic001G094700 Sobic001G094700 Sobic001G232600--Sobic001G094700 Sobic009G102700--Sobic004G166100 Sobic009G102700--Sobic001G528700 Sobic004G024000 Sobic004G024000 Sobic009G102700--Sobic004G024000 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic009G102700--Sobic004G025500 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G102700--Sobic001G539700 Sobic009G102700--Sobic007G057600 Sobic009G102700--Sobic010G252600 Sobic009G102700--Sobic007G222500 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic009G102700--Sobic007G222400 Sobic004G029032 Sobic004G029032 Sobic003G400000--Sobic004G029032 Sobic009G091600 Sobic009G091600 Sobic003G400000--Sobic009G091600 Sobic008G027900 Sobic008G027900 Sobic003G400000--Sobic008G027900 Sobic005G023700 Sobic005G023700 Sobic003G400000--Sobic005G023700 Sobic002G066300 Sobic002G066300 Sobic003G400000--Sobic002G066300 Sobic001G024800 Sobic001G024800 Sobic003G400000--Sobic001G024800 Sobic006G263500 Sobic006G263500 Sobic003G400000--Sobic006G263500 Sobic010G006900 Sobic010G006900 Sobic003G400000--Sobic010G006900 Sobic006G171500 Sobic006G171500 Sobic003G400000--Sobic006G171500 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic001G228000--Sobic001G002200 Sobic001G228000--Sobic001G348600 Sobic003G164700 Sobic003G164700 Sobic001G228000--Sobic003G164700 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic001G228000--Sobic002G197900 Sobic002G140500 Sobic002G140500 Sobic001G228000--Sobic002G140500 Sobic008G027800 Sobic008G027800 Sobic001G228000--Sobic008G027800 Sobic001G228000--Sobic007G057600 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic001G228000--Sobic008G028300 Sobic001G228000--Sobic004G024000 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic002G106800--Sobic003G173800 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic002G106800--Sobic005G010000 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic002G106800--Sobic009G098900 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic002G091200 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic002G106800--Sobic004G137200 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic001G540000 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic002G106800--Sobic010G161400 Sobic002G106800--Sobic004G025500 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic002G106800--Sobic008G186900 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic009G096700--Sobic010G093600 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic009G096700--Sobic008G028100 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic009G096700--Sobic009G089532 Sobic009G096700--Sobic001G539700 Sobic009G096700--Sobic008G027800 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic009G096700--Sobic009G016700 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic009G096700--Sobic002G002600 Sobic009G096700--Sobic001G002200 Sobic009G096700--Sobic008G028300
Octagon: transcription factors


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