Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G185900.2
Synonym Sb05g024365
Functional annotation expressed protein
UniProt Q9XE71 , A0A1Z5RJB9
Pfam -
Panther DB PTHR35166
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g12000.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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16 Sobic.003G445300 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
17 Sobic.005G006400 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
18 Sobic.010G090200 OsMADS63 - MADS-box family gene with MIKC , type-box, expressed -
19 Sobic.003G133000 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
20 Sobic.007G095333 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G185900 Sobic005G185900 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic005G185900--Sobic008G125801 Sobic004G094400 Sobic004G094400 Sobic005G185900--Sobic004G094400 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic005G185900--Sobic003G351100 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic005G185900--Sobic007G160501 Sobic006G020400 Sobic006G020400 Sobic005G185900--Sobic006G020400 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic005G185900--Sobic002G194300 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic005G185900--Sobic001G246001 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic005G185900--Sobic005G214800 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic005G185900--Sobic009G110800 Sobic008G125801--Sobic007G160501 Sobic008G125801--Sobic006G020400 Sobic008G125801--Sobic003G351100 Sobic008G125801--Sobic001G246001 Sobic008G125801--Sobic005G214800 Sobic008G125801--Sobic009G110800 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic008G125801--Sobic010G215000 Sobic008G125801--Sobic002G194300 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic008G125801--Sobic002G414000 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic004G094400--Sobic007G035200 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic004G094400--Sobic005G006400 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic004G094400--Sobic003G007650 Sobic004G094400--Sobic006G020400 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic004G094400--Sobic007G134501 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic004G094400--Sobic008G086500 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic004G094400--Sobic002G194201 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic004G094400--Sobic010G240300 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic004G094400--Sobic005G006100 Sobic003G351100--Sobic007G160501 Sobic003G351100--Sobic002G194300 Sobic003G351100--Sobic010G215000 Sobic003G351100--Sobic008G125801 Sobic003G351100--Sobic001G246001 Sobic003G351100--Sobic005G214800 Sobic003G351100--Sobic009G110800 Sobic010G090200 Sobic010G090200 Sobic003G351100--Sobic010G090200 Sobic003G351100--Sobic005G006400 Sobic007G160501--Sobic003G351100 Sobic007G160501--Sobic001G246001 Sobic007G160501--Sobic005G214800 Sobic007G160501--Sobic009G110800 Sobic007G160501--Sobic010G215000 Sobic007G160501--Sobic008G125801 Sobic007G160501--Sobic002G194300 Sobic007G160501--Sobic002G414000 Sobic006G043101 Sobic006G043101 Sobic007G160501--Sobic006G043101 Sobic006G020400--Sobic008G125801 Sobic006G020400--Sobic003G351100 Sobic006G020400--Sobic007G160501 Sobic006G020400--Sobic002G194300 Sobic006G020400--Sobic010G215000 Sobic006G020400--Sobic001G246001 Sobic006G020400--Sobic005G214800 Sobic006G020400--Sobic009G110800 Sobic006G020400--Sobic002G414000 Sobic002G194300--Sobic003G351100 Sobic002G194300--Sobic010G215000 Sobic002G194300--Sobic007G160501 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic002G194300--Sobic007G095333 Sobic002G194300--Sobic008G086500 Sobic002G194300--Sobic008G125801 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic002G194300--Sobic010G216100 Sobic002G194300--Sobic010G240300 Sobic002G194300--Sobic009G110800 Sobic001G246001--Sobic001G246001 Sobic001G246001--Sobic002G414000 Sobic001G246001--Sobic007G160501 Sobic001G246001--Sobic006G043101 Sobic001G246001--Sobic009G110800 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic001G246001--Sobic003G445300 Sobic005G220400 Sobic005G220400 Sobic001G246001--Sobic005G220400 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic001G246001--Sobic005G220500 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic001G246001--Sobic001G269200 Sobic005G214800--Sobic001G246001 Sobic005G214800--Sobic002G414000 Sobic005G214800--Sobic007G160501 Sobic005G214800--Sobic006G043101 Sobic005G214800--Sobic009G110800 Sobic005G214800--Sobic003G445300 Sobic005G214800--Sobic005G220400 Sobic005G214800--Sobic005G220500 Sobic005G214800--Sobic001G269200 Sobic009G110800--Sobic001G246001 Sobic009G110800--Sobic005G214800 Sobic009G110800--Sobic007G160501 Sobic009G110800--Sobic002G414000 Sobic009G110800--Sobic006G043101 Sobic009G110800--Sobic003G351100 Sobic009G110800--Sobic003G445300 Sobic009G110800--Sobic005G220400 Sobic009G110800--Sobic008G125801
Octagon: transcription factors


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