Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G097966.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R6Y0
Pfam PF00118
Panther DB PTHR11353 PTHR11353:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005524; ATP binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G03960 : TCP-1/cpn60 chaperonin family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g59020.1 : T-complex protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033884 , Zm00025a015792
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G040660.2 , HORVU4Hr1G040660.3 , HORVU4Hr1G040660.1 , HORVU4Hr1G040660.4
Wheat TraesCS4A02G164900 , TraesCS4A02G164900 , TraesCS4B02G165400 , TraesCS4D02G157300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G188500 OsSub50 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
2 Sobic.006G042600 - -
3 Sobic.002G194201 - -
4 Sobic.007G122600 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expression induced by BR treatment"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G086500 - -
6 Sobic.005G040100 expressed protein -
7 Sobic.001G143700 cupin domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G006200 - -
9 Sobic.007G134501 - -
10 Sobic.005G006100 hypothetical protein -
11 Sobic.005G148000 - -
12 Sobic.007G133800 - -
13 Sobic.010G240300 Os12bglu38 - beta-glucosidase/beta-mannosidase/exoglucanase homologue, expressed K05350: beta-glucosidase
14 Sobic.003G245300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G097300 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G007650 - -
17 Sobic.005G006400 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
18 Sobic.010G216100 leaf senescence related protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G047100 GEX1, putative, expressed -
20 Sobic.005G189100 transcription factor Dp, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G097966 Sobic008G097966 Sobic010G188500 Sobic010G188500 Sobic008G097966--Sobic010G188500 Sobic006G042600 Sobic006G042600 Sobic008G097966--Sobic006G042600 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic008G097966--Sobic002G194201 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic008G097966--Sobic007G122600 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic008G097966--Sobic008G086500 Sobic005G040100 Sobic005G040100 Sobic008G097966--Sobic005G040100 Sobic001G143700 Sobic001G143700 Sobic008G097966--Sobic001G143700 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic008G097966--Sobic002G006200 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic008G097966--Sobic007G134501 Sobic010G188500--Sobic006G042600 Sobic010G188500--Sobic007G122600 Sobic010G188500--Sobic008G086500 Sobic010G188500--Sobic002G194201 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic010G188500--Sobic005G006100 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic010G188500--Sobic010G240300 Sobic010G207800 Sobic010G207800 Sobic010G188500--Sobic010G207800 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic010G188500--Sobic010G216100 Sobic007G014000 Sobic007G014000 Sobic010G188500--Sobic007G014000 Sobic006G042600--Sobic010G188500 Sobic006G042600--Sobic002G194201 Sobic006G042600--Sobic007G122600 Sobic006G042600--Sobic005G040100 Sobic006G042600--Sobic008G086500 Sobic006G042600--Sobic001G143700 Sobic005G148000 Sobic005G148000 Sobic006G042600--Sobic005G148000 Sobic006G042600--Sobic007G134501 Sobic006G042600--Sobic002G006200 Sobic002G194201--Sobic007G134501 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic002G194201--Sobic003G007650 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic002G194201--Sobic005G006400 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic002G194201--Sobic007G035200 Sobic002G194201--Sobic007G122600 Sobic002G194201--Sobic005G040100 Sobic002G194201--Sobic008G086500 Sobic002G194201--Sobic005G006100 Sobic002G194201--Sobic010G240300 Sobic007G122600--Sobic005G006100 Sobic007G122600--Sobic002G194201 Sobic007G122600--Sobic007G134501 Sobic007G122600--Sobic005G040100 Sobic007G122600--Sobic003G007650 Sobic003G245300 Sobic003G245300 Sobic007G122600--Sobic003G245300 Sobic007G122600--Sobic005G006400 Sobic007G122600--Sobic010G240300 Sobic007G122600--Sobic007G035200 Sobic008G086500--Sobic005G006400 Sobic008G086500--Sobic010G240300 Sobic008G086500--Sobic007G035200 Sobic008G086500--Sobic003G007650 Sobic008G086500--Sobic002G194201 Sobic008G086500--Sobic010G216100 Sobic008G086500--Sobic007G014000 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic008G086500--Sobic002G194300 Sobic008G086500--Sobic007G134501 Sobic005G040100--Sobic005G148000 Sobic005G040100--Sobic007G134501 Sobic005G040100--Sobic002G194201 Sobic005G040100--Sobic007G122600 Sobic005G040100--Sobic001G143700 Sobic005G040100--Sobic003G007650 Sobic005G040100--Sobic005G006100 Sobic005G040100--Sobic002G006200 Sobic005G040100--Sobic003G245300 Sobic001G143700--Sobic005G148000 Sobic001G143700--Sobic002G006200 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic001G143700--Sobic005G189100 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic001G143700--Sobic002G097300 Sobic001G143700--Sobic005G040100 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic001G143700--Sobic008G138400 Sobic001G089300 Sobic001G089300 Sobic001G143700--Sobic001G089300 Sobic009G234900 Sobic009G234900 Sobic001G143700--Sobic009G234900 Sobic001G143700--Sobic007G122600 Sobic002G006200--Sobic005G189100 Sobic002G006200--Sobic001G143700 Sobic002G006200--Sobic002G097300 Sobic002G006200--Sobic008G138400 Sobic002G006200--Sobic001G089300 Sobic002G006200--Sobic005G148000 Sobic002G006200--Sobic009G234900 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic002G006200--Sobic008G024200 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic002G006200--Sobic009G047100 Sobic007G134501--Sobic003G007650 Sobic007G134501--Sobic002G194201 Sobic007G134501--Sobic005G040100 Sobic007G134501--Sobic007G035200 Sobic007G134501--Sobic005G006400 Sobic007G134501--Sobic007G122600 Sobic007G134501--Sobic005G006100 Sobic007G134501--Sobic008G086500 Sobic007G134501--Sobic010G240300
Octagon: transcription factors


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