Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G135100.1
Synonym Sb05g019880
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y3E0
Pfam -
Panther DB PTHR31447
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G48080 : oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g33320.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037015 , Zm00025a043640
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G106600 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
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11 Sobic.007G160501 - -
12 Sobic.003G351100 - -
13 Sobic.001G246001 - K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.005G214800 - -
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16 Sobic.002G194300 expressed protein -
17 Sobic.008G125801 - -
18 Sobic.002G414000 - -
19 Sobic.010G215000 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G043101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G135100 Sobic005G135100 Sobic002G106600 Sobic002G106600 Sobic005G135100--Sobic002G106600 Sobic002G257001 Sobic002G257001 Sobic005G135100--Sobic002G257001 Sobic007G176900 Sobic007G176900 Sobic005G135100--Sobic007G176900 Sobic004G042501 Sobic004G042501 Sobic005G135100--Sobic004G042501 Sobic007G070900 Sobic007G070900 Sobic005G135100--Sobic007G070900 Sobic007G112500 Sobic007G112500 Sobic005G135100--Sobic007G112500 Sobic001G333700 Sobic001G333700 Sobic005G135100--Sobic001G333700 Sobic005G003700 Sobic005G003700 Sobic005G135100--Sobic005G003700 Sobic004G308800 Sobic004G308800 Sobic005G135100--Sobic004G308800 Sobic001G337100 Sobic001G337100 Sobic002G106600--Sobic001G337100 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic002G106600--Sobic008G086500 Sobic002G106600--Sobic007G070900 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic002G106600--Sobic002G194201 Sobic006G042600 Sobic006G042600 Sobic002G106600--Sobic006G042600 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic002G106600--Sobic010G216100 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic002G106600--Sobic005G006400 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic002G106600--Sobic010G240300 Sobic002G106600--Sobic004G308800 Sobic002G257001--Sobic001G333700 Sobic002G257001--Sobic002G106600 Sobic002G257001--Sobic007G070900 Sobic002G257001--Sobic005G135100 Sobic002G257001--Sobic004G042501 Sobic005G049850 Sobic005G049850 Sobic002G257001--Sobic005G049850 Sobic002G257001--Sobic001G337100 Sobic002G257001--Sobic007G112500 Sobic005G207700 Sobic005G207700 Sobic002G257001--Sobic005G207700 Sobic006G205400 Sobic006G205400 Sobic007G176900--Sobic006G205400 Sobic003G333100 Sobic003G333100 Sobic007G176900--Sobic003G333100 Sobic001G212500 Sobic001G212500 Sobic007G176900--Sobic001G212500 Sobic010G144700 Sobic010G144700 Sobic007G176900--Sobic010G144700 Sobic007G176900--Sobic001G333700 Sobic001G093100 Sobic001G093100 Sobic007G176900--Sobic001G093100 Sobic005G040700 Sobic005G040700 Sobic007G176900--Sobic005G040700 Sobic010G051000 Sobic010G051000 Sobic007G176900--Sobic010G051000 Sobic001G288400 Sobic001G288400 Sobic007G176900--Sobic001G288400 Sobic001G488950 Sobic001G488950 Sobic004G042501--Sobic001G488950 Sobic004G042501--Sobic001G333700 Sobic001G094700 Sobic001G094700 Sobic004G042501--Sobic001G094700 Sobic007G070900--Sobic002G106600 Sobic007G070900--Sobic005G049850 Sobic007G070900--Sobic001G337100 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic007G070900--Sobic004G168200 Sobic001G357400 Sobic001G357400 Sobic007G070900--Sobic001G357400 Sobic001G143700 Sobic001G143700 Sobic007G070900--Sobic001G143700 Sobic005G148000 Sobic005G148000 Sobic007G070900--Sobic005G148000 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic007G070900--Sobic002G006200 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic007G070900--Sobic005G189100 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic007G112500--Sobic005G043300 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic007G112500--Sobic003G351100 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic007G112500--Sobic007G035200 Sobic006G020400 Sobic006G020400 Sobic007G112500--Sobic006G020400 Sobic007G112500--Sobic005G006400 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic007G112500--Sobic008G125801 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic007G112500--Sobic002G194300 Sobic007G112500--Sobic010G240300 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic007G112500--Sobic003G007650 Sobic004G293300 Sobic004G293300 Sobic001G333700--Sobic004G293300 Sobic009G203900 Sobic009G203900 Sobic001G333700--Sobic009G203900 Sobic007G222100 Sobic007G222100 Sobic001G333700--Sobic007G222100 Sobic001G024900 Sobic001G024900 Sobic001G333700--Sobic001G024900 Sobic002G053800 Sobic002G053800 Sobic001G333700--Sobic002G053800 Sobic001G269800 Sobic001G269800 Sobic001G333700--Sobic001G269800 Sobic001G306400 Sobic001G306400 Sobic001G333700--Sobic001G306400 Sobic001G306500 Sobic001G306500 Sobic001G333700--Sobic001G306500 Sobic010G091800 Sobic010G091800 Sobic001G333700--Sobic010G091800 Sobic008G043200 Sobic008G043200 Sobic005G003700--Sobic008G043200 Sobic001G089400 Sobic001G089400 Sobic005G003700--Sobic001G089400 Sobic007G215200 Sobic007G215200 Sobic005G003700--Sobic007G215200 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic005G003700--Sobic003G420500 Sobic010G207800 Sobic010G207800 Sobic005G003700--Sobic010G207800 Sobic001G332000 Sobic001G332000 Sobic005G003700--Sobic001G332000 Sobic009G175400 Sobic009G175400 Sobic005G003700--Sobic009G175400 Sobic010G040400 Sobic010G040400 Sobic005G003700--Sobic010G040400 Sobic004G192600 Sobic004G192600 Sobic005G003700--Sobic004G192600 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic004G308800--Sobic009G110700 Sobic003G245300 Sobic003G245300 Sobic004G308800--Sobic003G245300 Sobic007G145500 Sobic007G145500 Sobic004G308800--Sobic007G145500 Sobic004G308800--Sobic002G194300 Sobic004G308800--Sobic010G216100 Sobic004G308800--Sobic003G351100 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic004G308800--Sobic007G095333 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic004G308800--Sobic010G215000 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic004G308800--Sobic007G160501
Octagon: transcription factors


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