Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G112500.1
Synonym
Functional annotation ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PH69
Pfam -
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g24954.1 : ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G043300 - -
2 Sobic.003G351100 - -
3 Sobic.007G035200 - -
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9 Sobic.003G007650 - -
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16 Sobic.002G194201 - -
17 Sobic.010G216100 leaf senescence related protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G246001 - K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.005G214800 - -
20 Sobic.009G110800 OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G112500 Sobic007G112500 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic007G112500--Sobic005G043300 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic007G112500--Sobic003G351100 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic007G112500--Sobic007G035200 Sobic006G020400 Sobic006G020400 Sobic007G112500--Sobic006G020400 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic007G112500--Sobic005G006400 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic007G112500--Sobic008G125801 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic007G112500--Sobic002G194300 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic007G112500--Sobic010G240300 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic007G112500--Sobic003G007650 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic005G043300--Sobic007G160501 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic005G043300--Sobic001G246001 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic005G043300--Sobic005G214800 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic005G043300--Sobic003G445300 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic005G043300--Sobic002G414000 Sobic005G043300--Sobic003G351100 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic005G043300--Sobic009G110800 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic005G043300--Sobic010G215000 Sobic005G043300--Sobic008G125801 Sobic003G351100--Sobic007G160501 Sobic003G351100--Sobic002G194300 Sobic003G351100--Sobic010G215000 Sobic003G351100--Sobic008G125801 Sobic003G351100--Sobic001G246001 Sobic003G351100--Sobic005G214800 Sobic003G351100--Sobic009G110800 Sobic010G090200 Sobic010G090200 Sobic003G351100--Sobic010G090200 Sobic003G351100--Sobic005G006400 Sobic007G035200--Sobic005G006400 Sobic007G035200--Sobic003G007650 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic007G035200--Sobic008G086500 Sobic007G035200--Sobic010G240300 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic007G035200--Sobic007G134501 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic007G035200--Sobic002G194201 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic007G035200--Sobic005G006100 Sobic007G014000 Sobic007G014000 Sobic007G035200--Sobic007G014000 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic007G035200--Sobic010G216100 Sobic006G020400--Sobic008G125801 Sobic006G020400--Sobic003G351100 Sobic006G020400--Sobic007G160501 Sobic006G020400--Sobic002G194300 Sobic006G020400--Sobic010G215000 Sobic006G020400--Sobic001G246001 Sobic006G020400--Sobic005G214800 Sobic006G020400--Sobic009G110800 Sobic006G020400--Sobic002G414000 Sobic005G006400--Sobic007G035200 Sobic005G006400--Sobic003G007650 Sobic005G006400--Sobic010G240300 Sobic005G006400--Sobic008G086500 Sobic005G006400--Sobic002G194201 Sobic005G006400--Sobic007G134501 Sobic005G006400--Sobic005G006100 Sobic005G006400--Sobic007G014000 Sobic005G006400--Sobic010G216100 Sobic008G125801--Sobic007G160501 Sobic008G125801--Sobic006G020400 Sobic008G125801--Sobic003G351100 Sobic008G125801--Sobic001G246001 Sobic008G125801--Sobic005G214800 Sobic008G125801--Sobic009G110800 Sobic008G125801--Sobic010G215000 Sobic008G125801--Sobic002G194300 Sobic008G125801--Sobic002G414000 Sobic002G194300--Sobic003G351100 Sobic002G194300--Sobic010G215000 Sobic002G194300--Sobic007G160501 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic002G194300--Sobic007G095333 Sobic002G194300--Sobic008G086500 Sobic002G194300--Sobic008G125801 Sobic002G194300--Sobic010G216100 Sobic002G194300--Sobic010G240300 Sobic002G194300--Sobic009G110800 Sobic010G240300--Sobic005G006400 Sobic010G240300--Sobic007G014000 Sobic010G240300--Sobic008G086500 Sobic010G240300--Sobic010G216100 Sobic010G240300--Sobic007G035200 Sobic010G240300--Sobic010G090200 Sobic010G240300--Sobic003G007650 Sobic010G240300--Sobic005G006100 Sobic010G240300--Sobic002G194201 Sobic003G007650--Sobic007G035200 Sobic003G007650--Sobic007G134501 Sobic003G007650--Sobic005G006400 Sobic003G007650--Sobic002G194201 Sobic003G007650--Sobic008G086500 Sobic003G007650--Sobic010G240300 Sobic003G007650--Sobic005G006100 Sobic005G040100 Sobic005G040100 Sobic003G007650--Sobic005G040100 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic003G007650--Sobic007G122600
Octagon: transcription factors


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