Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G402800.1
Synonym Sb03g043876, RUS1
Functional annotation DUF647 domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q7T9
Pfam PF04884
Panther DB PTHR12770 PTHR12770:SF7
NCBI CDD KOG4249; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G45890 : Protein of unknown function, DUF647
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g22360.1 : DUF647 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026283
Brachypodium KQJ82046
Barley HORVU2Hr1G065800.1 , HORVU2Hr1G065800.3 , HORVU2Hr1G065800.2
Wheat TraesCS2D02G269400 , TraesCS2A02G270300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G385300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G257800 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
3 Sobic.008G055500 Protein-tyrosine phosphatase domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G074800 - -
5 Sobic.005G048500 serine esterase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G185500 - -
7 Sobic.004G064200 STE_PAK_Ste20_STLK.1 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K08835: OXSR1, serine/threonine-protein kinase OSR1/STK39
8 Sobic.009G046900 N-acetylglucosaminyltransferase, putative, expressed -
9 Sobic.001G149000 FAR1 family protein, expressed -
10 Sobic.008G152700 expressed protein K07541: GPI mannosyltransferase 1 subunit X
11 Sobic.004G350700 kelch repeat protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G117800 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
13 Sobic.002G180800 puromycin-sensitive aminopeptidase, putative, expressed K08776: puromycin-sensitive aminopeptidase
14 Sobic.004G176200 SacI homology domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G103800 rab GDP dissociation inhibitor alpha, putative, expressed K17255: Rab GDP dissociation inhibitor
16 Sobic.007G099900 - -
17 Sobic.009G178400 oxidoreductase, putative, expressed K00472: prolyl 4-hydroxylase
18 Sobic.003G236000 CGMC_MAPKCMGC_2.5 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K04371: ERK, mitogen-activated protein kinase 1/3
19 Sobic.006G001100 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G057400 expressed protein K16586: HAUS augmin-like complex subunit 3


Gene co-expression network
sample Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic003G402800--Sobic003G385300 Sobic001G257800 Sobic001G257800 Sobic003G402800--Sobic001G257800 Sobic008G055500 Sobic008G055500 Sobic003G402800--Sobic008G055500 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic003G402800--Sobic002G074800 Sobic005G048500 Sobic005G048500 Sobic003G402800--Sobic005G048500 Sobic005G185500 Sobic005G185500 Sobic003G402800--Sobic005G185500 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic003G402800--Sobic004G064200 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic003G402800--Sobic009G046900 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic003G402800--Sobic001G149000 Sobic003G385300--Sobic001G149000 Sobic003G385300--Sobic003G402800 Sobic004G077300 Sobic004G077300 Sobic003G385300--Sobic004G077300 Sobic003G385300--Sobic004G064200 Sobic004G176200 Sobic004G176200 Sobic003G385300--Sobic004G176200 Sobic003G385300--Sobic001G257800 Sobic005G225500 Sobic005G225500 Sobic003G385300--Sobic005G225500 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic003G385300--Sobic007G039200 Sobic003G385300--Sobic002G074800 Sobic001G257800--Sobic003G402800 Sobic001G257800--Sobic003G385300 Sobic010G134650 Sobic010G134650 Sobic001G257800--Sobic010G134650 Sobic001G257800--Sobic004G064200 Sobic010G024400 Sobic010G024400 Sobic001G257800--Sobic010G024400 Sobic001G257800--Sobic004G176200 Sobic001G257800--Sobic002G074800 Sobic004G261700 Sobic004G261700 Sobic001G257800--Sobic004G261700 Sobic008G152700 Sobic008G152700 Sobic001G257800--Sobic008G152700 Sobic008G055500--Sobic003G402800 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic008G055500--Sobic006G060000 Sobic004G350700 Sobic004G350700 Sobic008G055500--Sobic004G350700 Sobic008G055500--Sobic003G385300 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic008G055500--Sobic003G117800 Sobic008G055500--Sobic001G257800 Sobic008G055500--Sobic008G152700 Sobic008G055500--Sobic004G176200 Sobic001G501900 Sobic001G501900 Sobic008G055500--Sobic001G501900 Sobic002G074800--Sobic004G064200 Sobic006G001100 Sobic006G001100 Sobic002G074800--Sobic006G001100 Sobic006G204400 Sobic006G204400 Sobic002G074800--Sobic006G204400 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic002G074800--Sobic008G136601 Sobic010G114200 Sobic010G114200 Sobic002G074800--Sobic010G114200 Sobic006G143900 Sobic006G143900 Sobic002G074800--Sobic006G143900 Sobic004G228300 Sobic004G228300 Sobic002G074800--Sobic004G228300 Sobic002G074800--Sobic005G048500 Sobic008G136700 Sobic008G136700 Sobic002G074800--Sobic008G136700 Sobic009G206100 Sobic009G206100 Sobic005G048500--Sobic009G206100 Sobic006G150300 Sobic006G150300 Sobic005G048500--Sobic006G150300 Sobic005G048500--Sobic006G001100 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic005G048500--Sobic009G229400 Sobic006G193400 Sobic006G193400 Sobic005G048500--Sobic006G193400 Sobic005G048500--Sobic002G074800 Sobic005G048500--Sobic006G143900 Sobic005G048500--Sobic006G204400 Sobic005G048500--Sobic010G114200 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic005G185500--Sobic002G389600 Sobic005G185500--Sobic003G385300 Sobic006G093600 Sobic006G093600 Sobic005G185500--Sobic006G093600 Sobic005G185500--Sobic007G039200 Sobic005G185500--Sobic006G001100 Sobic005G185500--Sobic005G225500 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic005G185500--Sobic002G102300 Sobic006G162500 Sobic006G162500 Sobic005G185500--Sobic006G162500 Sobic005G185500--Sobic003G402800 Sobic004G064200--Sobic010G114200 Sobic003G014200 Sobic003G014200 Sobic004G064200--Sobic003G014200 Sobic004G064200--Sobic006G143900 Sobic010G179600 Sobic010G179600 Sobic004G064200--Sobic010G179600 Sobic009G068400 Sobic009G068400 Sobic004G064200--Sobic009G068400 Sobic001G117100 Sobic001G117100 Sobic004G064200--Sobic001G117100 Sobic001G225800 Sobic001G225800 Sobic004G064200--Sobic001G225800 Sobic009G152000 Sobic009G152000 Sobic004G064200--Sobic009G152000 Sobic008G036100 Sobic008G036100 Sobic004G064200--Sobic008G036100 Sobic009G046900--Sobic001G149000 Sobic009G178400 Sobic009G178400 Sobic009G046900--Sobic009G178400 Sobic002G233600 Sobic002G233600 Sobic009G046900--Sobic002G233600 Sobic006G134500 Sobic006G134500 Sobic009G046900--Sobic006G134500 Sobic009G046900--Sobic002G074800 Sobic009G046900--Sobic003G385300 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic009G046900--Sobic001G384200 Sobic009G046900--Sobic006G193400 Sobic003G358600 Sobic003G358600 Sobic009G046900--Sobic003G358600 Sobic001G149000--Sobic004G077300 Sobic001G149000--Sobic008G152700 Sobic001G149000--Sobic003G385300 Sobic001G149000--Sobic009G046900 Sobic001G149000--Sobic001G384200 Sobic001G149000--Sobic009G178400 Sobic001G280500 Sobic001G280500 Sobic001G149000--Sobic001G280500 Sobic008G166100 Sobic008G166100 Sobic001G149000--Sobic008G166100 Sobic001G387300 Sobic001G387300 Sobic001G149000--Sobic001G387300
Octagon: transcription factors


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