Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G057400.1,Sobic.002G057400.2
Synonym Sb02g004820
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q9E8 , C5XB68
Pfam PF14932
Panther DB PTHR19378 PTHR19378:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology K16586; HAUS augmin-like complex subunit 3
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G48520 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g08810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039939 , Zm00025a045215
Brachypodium PNT76878 , KQK20535
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G402800 DUF647 domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G304700 RFT1, putative, expressed K06316: oligosaccharide translocation protein RFT1
3 Sobic.005G225100 expressed protein -
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5 Sobic.010G160300 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
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8 Sobic.005G063200 expressed protein -
9 Sobic.001G501900 appr-1-p processing enzyme family protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G095100 RNA-binding region RNP-1, putative, expressed -
11 Sobic.001G257800 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
12 Sobic.003G411300 expressed protein -
13 Sobic.007G142600 DUF593 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G074800 - -
15 Sobic.004G350700 kelch repeat protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G048500 serine esterase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G117800 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
18 Sobic.004G176200 SacI homology domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G077300 guanine nucleotide exchange family protein, putative, expressed K18442: ARFGEF, brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein
20 Sobic.002G106200 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G057400 Sobic002G057400 Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic002G057400--Sobic003G402800 Sobic002G304700 Sobic002G304700 Sobic002G057400--Sobic002G304700 Sobic005G225100 Sobic005G225100 Sobic002G057400--Sobic005G225100 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic002G057400--Sobic003G385300 Sobic010G160300 Sobic010G160300 Sobic002G057400--Sobic010G160300 Sobic008G055500 Sobic008G055500 Sobic002G057400--Sobic008G055500 Sobic002G007800 Sobic002G007800 Sobic002G057400--Sobic002G007800 Sobic005G063200 Sobic005G063200 Sobic002G057400--Sobic005G063200 Sobic001G501900 Sobic001G501900 Sobic002G057400--Sobic001G501900 Sobic003G402800--Sobic003G385300 Sobic001G257800 Sobic001G257800 Sobic003G402800--Sobic001G257800 Sobic003G402800--Sobic008G055500 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic003G402800--Sobic002G074800 Sobic005G048500 Sobic005G048500 Sobic003G402800--Sobic005G048500 Sobic005G185500 Sobic005G185500 Sobic003G402800--Sobic005G185500 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic003G402800--Sobic004G064200 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic003G402800--Sobic009G046900 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic003G402800--Sobic001G149000 Sobic002G304700--Sobic010G160300 Sobic006G156400 Sobic006G156400 Sobic002G304700--Sobic006G156400 Sobic001G280500 Sobic001G280500 Sobic002G304700--Sobic001G280500 Sobic002G304700--Sobic003G385300 Sobic002G304700--Sobic001G149000 Sobic004G077300 Sobic004G077300 Sobic002G304700--Sobic004G077300 Sobic002G304700--Sobic002G007800 Sobic009G106700 Sobic009G106700 Sobic002G304700--Sobic009G106700 Sobic002G304700--Sobic005G063200 Sobic003G411300 Sobic003G411300 Sobic005G225100--Sobic003G411300 Sobic005G225100--Sobic002G057400 Sobic005G225100--Sobic003G402800 Sobic005G225100--Sobic002G007800 Sobic005G225100--Sobic005G063200 Sobic005G225100--Sobic003G385300 Sobic003G353700 Sobic003G353700 Sobic005G225100--Sobic003G353700 Sobic005G225100--Sobic009G106700 Sobic003G211800 Sobic003G211800 Sobic005G225100--Sobic003G211800 Sobic003G385300--Sobic001G149000 Sobic003G385300--Sobic003G402800 Sobic003G385300--Sobic004G077300 Sobic003G385300--Sobic004G064200 Sobic004G176200 Sobic004G176200 Sobic003G385300--Sobic004G176200 Sobic003G385300--Sobic001G257800 Sobic005G225500 Sobic005G225500 Sobic003G385300--Sobic005G225500 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic003G385300--Sobic007G039200 Sobic003G385300--Sobic002G074800 Sobic010G160300--Sobic002G304700 Sobic010G160300--Sobic001G280500 Sobic010G160300--Sobic005G063200 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic010G160300--Sobic001G114200 Sobic010G160300--Sobic001G501900 Sobic004G350700 Sobic004G350700 Sobic010G160300--Sobic004G350700 Sobic010G160300--Sobic002G007800 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic010G160300--Sobic003G117800 Sobic010G160300--Sobic001G149000 Sobic008G055500--Sobic003G402800 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic008G055500--Sobic006G060000 Sobic008G055500--Sobic004G350700 Sobic008G055500--Sobic003G385300 Sobic008G055500--Sobic003G117800 Sobic008G055500--Sobic001G257800 Sobic008G152700 Sobic008G152700 Sobic008G055500--Sobic008G152700 Sobic008G055500--Sobic004G176200 Sobic008G055500--Sobic001G501900 Sobic002G007800--Sobic002G304700 Sobic002G007800--Sobic009G106700 Sobic002G007800--Sobic010G160300 Sobic010G095400 Sobic010G095400 Sobic002G007800--Sobic010G095400 Sobic006G166400 Sobic006G166400 Sobic002G007800--Sobic006G166400 Sobic002G007800--Sobic001G501900 Sobic002G007800--Sobic002G057400 Sobic002G007800--Sobic003G211800 Sobic002G007800--Sobic003G385300 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic005G063200--Sobic001G384200 Sobic005G063200--Sobic001G280500 Sobic008G166100 Sobic008G166100 Sobic005G063200--Sobic008G166100 Sobic005G063200--Sobic003G211800 Sobic005G063200--Sobic001G149000 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic005G063200--Sobic001G076600 Sobic002G097200 Sobic002G097200 Sobic005G063200--Sobic002G097200 Sobic005G063200--Sobic003G385300 Sobic005G063200--Sobic009G106700 Sobic001G501900--Sobic004G350700 Sobic001G501900--Sobic003G385300 Sobic001G501900--Sobic008G055500 Sobic001G501900--Sobic002G304700 Sobic001G501900--Sobic010G160300 Sobic001G501900--Sobic004G077300 Sobic001G424800 Sobic001G424800 Sobic001G501900--Sobic001G424800 Sobic001G501900--Sobic008G152700 Sobic001G501900--Sobic003G117800
Octagon: transcription factors


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