Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G055500.1
Synonym ATPTP1, PTP1, Sb08g004710
Functional annotation Protein-tyrosine phosphatase domain containing protein, expressed
UniProt C5YSR9
Pfam PF13350
Panther DB PTHR19134 PTHR19134:SF317
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71860 : protein tyrosine phosphatase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07590.2 : Protein-tyrosine phosphatase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025719 , Zm00025a012797
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G018440.4 , HORVU4Hr1G018440.3 , HORVU4Hr1G018440.1 , HORVU2Hr1G041630.12 , HORVU0Hr1G003440.1 , HORVU2Hr1G041630.9 , HORVU2Hr1G041630.1 , HORVU2Hr1G041630.2 , HORVU2Hr1G041630.3 , HORVU2Hr1G041630.4 , HORVU2Hr1G041630.5 , HORVU2Hr1G041630.6 , HORVU2Hr1G041630.8
Wheat TraesCS2D02G214800 , TraesCS2B02G234600 , TraesCS2A02G208000 , TraesCS4D02G092700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G055500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.002G074800 - -
19 Sobic.006G115100 expressed protein -
20 Sobic.001G424800 myosin heavy chain-related, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G055500 Sobic008G055500 Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic008G055500--Sobic003G402800 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic008G055500--Sobic006G060000 Sobic004G350700 Sobic004G350700 Sobic008G055500--Sobic004G350700 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic008G055500--Sobic003G385300 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic008G055500--Sobic003G117800 Sobic001G257800 Sobic001G257800 Sobic008G055500--Sobic001G257800 Sobic008G152700 Sobic008G152700 Sobic008G055500--Sobic008G152700 Sobic004G176200 Sobic004G176200 Sobic008G055500--Sobic004G176200 Sobic001G501900 Sobic001G501900 Sobic008G055500--Sobic001G501900 Sobic003G402800--Sobic003G385300 Sobic003G402800--Sobic001G257800 Sobic003G402800--Sobic008G055500 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic003G402800--Sobic002G074800 Sobic005G048500 Sobic005G048500 Sobic003G402800--Sobic005G048500 Sobic005G185500 Sobic005G185500 Sobic003G402800--Sobic005G185500 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic003G402800--Sobic004G064200 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic003G402800--Sobic009G046900 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic003G402800--Sobic001G149000 Sobic006G060000--Sobic008G055500 Sobic006G060000--Sobic004G350700 Sobic007G172700 Sobic007G172700 Sobic006G060000--Sobic007G172700 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic006G060000--Sobic001G114200 Sobic003G394500 Sobic003G394500 Sobic006G060000--Sobic003G394500 Sobic001G389200 Sobic001G389200 Sobic006G060000--Sobic001G389200 Sobic004G263500 Sobic004G263500 Sobic006G060000--Sobic004G263500 Sobic006G060000--Sobic003G117800 Sobic001G490900 Sobic001G490900 Sobic006G060000--Sobic001G490900 Sobic004G350700--Sobic008G055500 Sobic004G350700--Sobic003G394500 Sobic004G350700--Sobic003G385300 Sobic001G424800 Sobic001G424800 Sobic004G350700--Sobic001G424800 Sobic004G350700--Sobic006G060000 Sobic004G350700--Sobic001G149000 Sobic004G350700--Sobic007G172700 Sobic004G350700--Sobic001G114200 Sobic004G350700--Sobic003G117800 Sobic003G385300--Sobic001G149000 Sobic003G385300--Sobic003G402800 Sobic004G077300 Sobic004G077300 Sobic003G385300--Sobic004G077300 Sobic003G385300--Sobic004G064200 Sobic003G385300--Sobic004G176200 Sobic003G385300--Sobic001G257800 Sobic005G225500 Sobic005G225500 Sobic003G385300--Sobic005G225500 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic003G385300--Sobic007G039200 Sobic003G385300--Sobic002G074800 Sobic003G117800--Sobic001G424800 Sobic003G117800--Sobic003G385300 Sobic003G117800--Sobic003G394500 Sobic001G057400 Sobic001G057400 Sobic003G117800--Sobic001G057400 Sobic003G117800--Sobic008G152700 Sobic003G117800--Sobic001G149000 Sobic001G356200 Sobic001G356200 Sobic003G117800--Sobic001G356200 Sobic001G385000 Sobic001G385000 Sobic003G117800--Sobic001G385000 Sobic003G117800--Sobic009G046900 Sobic001G257800--Sobic003G402800 Sobic001G257800--Sobic003G385300 Sobic010G134650 Sobic010G134650 Sobic001G257800--Sobic010G134650 Sobic001G257800--Sobic004G064200 Sobic010G024400 Sobic010G024400 Sobic001G257800--Sobic010G024400 Sobic001G257800--Sobic004G176200 Sobic001G257800--Sobic002G074800 Sobic004G261700 Sobic004G261700 Sobic001G257800--Sobic004G261700 Sobic001G257800--Sobic008G152700 Sobic008G152700--Sobic001G149000 Sobic008G152700--Sobic003G385300 Sobic008G152700--Sobic003G117800 Sobic008G152700--Sobic004G077300 Sobic008G152700--Sobic009G046900 Sobic008G152700--Sobic007G172700 Sobic003G428000 Sobic003G428000 Sobic008G152700--Sobic003G428000 Sobic008G152700--Sobic003G394500 Sobic008G152700--Sobic001G385000 Sobic004G176200--Sobic003G385300 Sobic002G103800 Sobic002G103800 Sobic004G176200--Sobic002G103800 Sobic007G004300 Sobic007G004300 Sobic004G176200--Sobic007G004300 Sobic004G176200--Sobic004G077300 Sobic004G176200--Sobic004G064200 Sobic004G176200--Sobic001G257800 Sobic002G180800 Sobic002G180800 Sobic004G176200--Sobic002G180800 Sobic004G176200--Sobic001G356200 Sobic006G080700 Sobic006G080700 Sobic004G176200--Sobic006G080700 Sobic001G501900--Sobic004G350700 Sobic001G501900--Sobic003G385300 Sobic001G501900--Sobic008G055500 Sobic002G304700 Sobic002G304700 Sobic001G501900--Sobic002G304700 Sobic010G160300 Sobic010G160300 Sobic001G501900--Sobic010G160300 Sobic001G501900--Sobic004G077300 Sobic001G501900--Sobic001G424800 Sobic001G501900--Sobic008G152700 Sobic001G501900--Sobic003G117800
Octagon: transcription factors


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