Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G225500.1
Synonym Sb05g027415
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RKT6
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33074 PTHR33074:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g39710.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G001100 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed -
2 Sobic.008G159701 - -
3 Sobic.002G106600 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G003700 - -
5 Sobic.007G070900 OsFBL43 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
6 Sobic.004G290600 beige/BEACH domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G308800 expressed protein -
8 Sobic.007G176900 beta-galactosidase precursor, putative, expressed -
9 Sobic.006G205400 villin protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G242600 OsFBDUF52 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
11 Sobic.006G027601 - -
12 Sobic.005G135100 expressed protein -
13 Sobic.008G136601 - -
14 Sobic.009G152000 Yip1 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G337100 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
16 Sobic.004G042501 - -
17 Sobic.001G333700 ZOS3-10 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.009G068400 SSRP1-like FACT complex subunit, putative, expressed K09272: structure-specific recognition protein 1
19 Sobic.001G212500 vacuolar protein sorting-associated protein 52, putative, expressed -
20 Sobic.003G333100 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G225500 Sobic005G225500 Sobic006G001100 Sobic006G001100 Sobic005G225500--Sobic006G001100 Sobic008G159701 Sobic008G159701 Sobic005G225500--Sobic008G159701 Sobic002G106600 Sobic002G106600 Sobic005G225500--Sobic002G106600 Sobic005G003700 Sobic005G003700 Sobic005G225500--Sobic005G003700 Sobic007G070900 Sobic007G070900 Sobic005G225500--Sobic007G070900 Sobic004G290600 Sobic004G290600 Sobic005G225500--Sobic004G290600 Sobic004G308800 Sobic004G308800 Sobic005G225500--Sobic004G308800 Sobic007G176900 Sobic007G176900 Sobic005G225500--Sobic007G176900 Sobic006G205400 Sobic006G205400 Sobic005G225500--Sobic006G205400 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic006G001100--Sobic008G136601 Sobic006G001100--Sobic007G176900 Sobic006G027601 Sobic006G027601 Sobic006G001100--Sobic006G027601 Sobic003G333100 Sobic003G333100 Sobic006G001100--Sobic003G333100 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic006G001100--Sobic009G061601 Sobic006G001100--Sobic006G205400 Sobic002G295800 Sobic002G295800 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Sobic010G276100 Sobic006G205400--Sobic010G276100 Sobic006G205400--Sobic007G215200 Sobic006G205400--Sobic010G040400
Octagon: transcription factors


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