Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G435400.1
Synonym Sb03g046616
Functional annotation OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed
UniProt A0A1B6Q8D1
Pfam -
Panther DB PTHR18868 PTHR18868:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g04750.1 : OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G199700 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
2 Sobic.001G414100 expressed protein -
3 Sobic.006G096800 expressed protein -
4 Sobic.002G290100 expressed protein K08739: DNA mismatch repair protein MLH3
5 Sobic.004G098800 - -
6 Sobic.002G373600 von Willebrand factor type A domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G392275 - -
8 Sobic.010G134700 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@peptidyl-prolyl isomerase, putative, expressed K09571: FK506-binding protein 4/5
9 Sobic.003G223800 transmembrane amino acid transporter protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G040800 ZOS2-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
11 Sobic.003G385000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@serine/threonine protein kinase, putative, expressed -
12 Sobic.003G342500 methyltransferase, putative, expressed -
13 Sobic.004G043600 expressed protein -
14 Sobic.003G369600 CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G141600 - -
16 Sobic.005G017200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K00967: ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase
17 Sobic.002G019750 - -
18 Sobic.001G284425 - -
19 Sobic.008G041450 - -
20 Sobic.004G278700 microtubule-binding protein TANGLED1, putative, expressed K18636: microtubule-binding protein TANGLED1


Gene co-expression network
sample Sobic003G435400 Sobic003G435400 Sobic006G199700 Sobic006G199700 Sobic003G435400--Sobic006G199700 Sobic001G414100 Sobic001G414100 Sobic003G435400--Sobic001G414100 Sobic006G096800 Sobic006G096800 Sobic003G435400--Sobic006G096800 Sobic002G290100 Sobic002G290100 Sobic003G435400--Sobic002G290100 Sobic004G098800 Sobic004G098800 Sobic003G435400--Sobic004G098800 Sobic002G373600 Sobic002G373600 Sobic003G435400--Sobic002G373600 Sobic003G392275 Sobic003G392275 Sobic003G435400--Sobic003G392275 Sobic010G134700 Sobic010G134700 Sobic003G435400--Sobic010G134700 Sobic003G223800 Sobic003G223800 Sobic003G435400--Sobic003G223800 Sobic006G199700--Sobic003G435400 Sobic006G199700--Sobic002G373600 Sobic003G385000 Sobic003G385000 Sobic006G199700--Sobic003G385000 Sobic001G284425 Sobic001G284425 Sobic006G199700--Sobic001G284425 Sobic006G069200 Sobic006G069200 Sobic006G199700--Sobic006G069200 Sobic006G199700--Sobic003G223800 Sobic008G010900 Sobic008G010900 Sobic006G199700--Sobic008G010900 Sobic006G199700--Sobic004G098800 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic006G199700--Sobic002G019750 Sobic001G414100--Sobic003G392275 Sobic003G342500 Sobic003G342500 Sobic001G414100--Sobic003G342500 Sobic001G414100--Sobic004G098800 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic001G414100--Sobic002G102300 Sobic006G219900 Sobic006G219900 Sobic001G414100--Sobic006G219900 Sobic003G141600 Sobic003G141600 Sobic001G414100--Sobic003G141600 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic001G414100--Sobic003G117800 Sobic001G414100--Sobic003G435400 Sobic002G106200 Sobic002G106200 Sobic001G414100--Sobic002G106200 Sobic006G096800--Sobic003G342500 Sobic002G151500 Sobic002G151500 Sobic006G096800--Sobic002G151500 Sobic006G156400 Sobic006G156400 Sobic006G096800--Sobic006G156400 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic006G096800--Sobic004G298600 Sobic005G048600 Sobic005G048600 Sobic006G096800--Sobic005G048600 Sobic009G201000 Sobic009G201000 Sobic006G096800--Sobic009G201000 Sobic010G057600 Sobic010G057600 Sobic006G096800--Sobic010G057600 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic006G096800--Sobic003G352900 Sobic001G073700 Sobic001G073700 Sobic006G096800--Sobic001G073700 Sobic001G356100 Sobic001G356100 Sobic002G290100--Sobic001G356100 Sobic003G314300 Sobic003G314300 Sobic002G290100--Sobic003G314300 Sobic009G128500 Sobic009G128500 Sobic002G290100--Sobic009G128500 Sobic005G017200 Sobic005G017200 Sobic002G290100--Sobic005G017200 Sobic002G290100--Sobic003G435400 Sobic006G112500 Sobic006G112500 Sobic002G290100--Sobic006G112500 Sobic005G087300 Sobic005G087300 Sobic002G290100--Sobic005G087300 Sobic004G049200 Sobic004G049200 Sobic002G290100--Sobic004G049200 Sobic009G116900 Sobic009G116900 Sobic002G290100--Sobic009G116900 Sobic004G098800--Sobic010G134700 Sobic008G041450 Sobic008G041450 Sobic004G098800--Sobic008G041450 Sobic004G098800--Sobic003G392275 Sobic004G098800--Sobic003G385000 Sobic010G006800 Sobic010G006800 Sobic004G098800--Sobic010G006800 Sobic004G098800--Sobic003G141600 Sobic001G490950 Sobic001G490950 Sobic004G098800--Sobic001G490950 Sobic004G098800--Sobic002G102300 Sobic004G032600 Sobic004G032600 Sobic004G098800--Sobic004G032600 Sobic001G284400 Sobic001G284400 Sobic002G373600--Sobic001G284400 Sobic002G373600--Sobic001G284425 Sobic002G373600--Sobic003G385000 Sobic002G373600--Sobic006G199700 Sobic010G252900 Sobic010G252900 Sobic002G373600--Sobic010G252900 Sobic002G373600--Sobic003G435400 Sobic002G373600--Sobic010G134700 Sobic010G220400 Sobic010G220400 Sobic002G373600--Sobic010G220400 Sobic003G327600 Sobic003G327600 Sobic002G373600--Sobic003G327600 Sobic003G392275--Sobic002G102300 Sobic001G226900 Sobic001G226900 Sobic003G392275--Sobic001G226900 Sobic003G392275--Sobic001G490950 Sobic003G392275--Sobic010G006800 Sobic007G101600 Sobic007G101600 Sobic003G392275--Sobic007G101600 Sobic004G074900 Sobic004G074900 Sobic003G392275--Sobic004G074900 Sobic003G238250 Sobic003G238250 Sobic003G392275--Sobic003G238250 Sobic003G392275--Sobic004G098800 Sobic008G057600 Sobic008G057600 Sobic003G392275--Sobic008G057600 Sobic010G134700--Sobic004G098800 Sobic010G134700--Sobic003G385000 Sobic002G368100 Sobic002G368100 Sobic010G134700--Sobic002G368100 Sobic010G134700--Sobic010G006800 Sobic008G141600 Sobic008G141600 Sobic010G134700--Sobic008G141600 Sobic010G134700--Sobic004G074900 Sobic010G134700--Sobic003G238250 Sobic010G134700--Sobic003G392275 Sobic004G178700 Sobic004G178700 Sobic010G134700--Sobic004G178700 Sobic003G223800--Sobic003G385000 Sobic003G223800--Sobic006G199700 Sobic003G223800--Sobic004G098800 Sobic003G223800--Sobic010G134700 Sobic003G223800--Sobic003G435400 Sobic003G223800--Sobic001G284425 Sobic003G223800--Sobic010G220400 Sobic003G223800--Sobic008G041450 Sobic003G223800--Sobic002G373600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.