Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G184500.1
Synonym Sb01g016030, SbSAUR5, small auxin up RNA
Functional annotation "domain confirmed by Pfam database, expression not supported" (PubMedID : 20499123)
OsSAUR55 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
UniProt C5WUB6
Pfam PF02519
Panther DB PTHR31175 PTHR31175:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009733; response to auxin


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G29500 : SAUR-like auxin-responsive protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g37500.1 : OsSAUR55 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047989 , Zm00025a014498 , Zm00025a014496
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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