Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G019200.2
Synonym
Functional annotation rp3 protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RG93
Pfam PF13855 PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF455
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14460 : LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g35254.1 : transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G010800 - -
2 Sobic.009G184700 zinc finger C3HC4 type family protein, putative, expressed K10695: E3 ubiquitin-protein ligase RNF1/2
3 Sobic.009G042700 -(PubMedID : 29751546)@transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -
4 Sobic.001G373200 lipase precursor, putative, expressed -
5 Sobic.006G051700 WRKY123, expressed -
6 Sobic.004G002100 G-protein alpha subunit, putative, expressed -
7 Sobic.010G148501 - -
8 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.007G047700 no apical meristem protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G400900 expressed protein -
11 Sobic.001G095500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transcription factor(PubMedID : 30367619)@WRKY121, expressed -
12 Sobic.009G121100 expressed protein -
13 Sobic.004G092100 - -
14 Sobic.003G195500 SEY1, putative, expressed -
15 Sobic.001G443900 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
16 Sobic.004G012000 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G358400 callose synthase-like enzyme(PubMedID : 25311645)@1,3-beta-glucan synthase component domain containing protein, expressed K11000: callose synthase
18 Sobic.007G041500 diacylglycerol kinase, putative, expressed -
19 Sobic.008G123500 auxilin, putative, expressed -
20 Sobic.001G281100 START domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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