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Transcriptome id Sobic.005G182000.4
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PTB7
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cDNA sequences
Sobic.005G182000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G161550 - -
2 Sobic.009G139000 - -
3 Sobic.010G141800 expressed protein -
4 Sobic.002G427050 - -
5 Sobic.001G262700 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G481900 SAC domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G427000 - -
8 Sobic.004G091100 nuclear protein ZAP-related, putative, expressed K17602: YLP motif-containing protein 1
9 Sobic.003G247300 protein of unknown function DUF1296 domain containing protein, expressed -
10 Sobic.004G306500 OsMADS22 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
11 Sobic.001G050200 expressed protein -
12 Sobic.008G087866 - -
13 Sobic.003G139900 "Highest expression level in embryo, up-regulation in roots in response to exogenous ABA and PEG"(PubMedID : 27501690)@OsSPL1 - SBP-box gene family member, expressed -
14 Sobic.001G474600 calmodulin-binding transcription activator, putative, expressed -
15 Sobic.002G034100 D-alanine--D-alanine ligase family, putative, expressed -
16 Sobic.003G086900 C2 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G372500 DUF803 domain containing, putative, expressed -
18 Sobic.004G174200 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
19 Sobic.003G313500 MATH domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G010600 retinoblastoma-related protein-like, putative, expressed K04681: retinoblastoma-like protein 1


Gene co-expression network
sample Sobic005G182000 Sobic005G182000 Sobic009G161550 Sobic009G161550 Sobic005G182000--Sobic009G161550 Sobic009G139000 Sobic009G139000 Sobic005G182000--Sobic009G139000 Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic005G182000--Sobic010G141800 Sobic002G427050 Sobic002G427050 Sobic005G182000--Sobic002G427050 Sobic001G262700 Sobic001G262700 Sobic005G182000--Sobic001G262700 Sobic001G481900 Sobic001G481900 Sobic005G182000--Sobic001G481900 Sobic002G427000 Sobic002G427000 Sobic005G182000--Sobic002G427000 Sobic004G091100 Sobic004G091100 Sobic005G182000--Sobic004G091100 Sobic003G247300 Sobic003G247300 Sobic005G182000--Sobic003G247300 Sobic009G161550--Sobic009G139000 Sobic004G174200 Sobic004G174200 Sobic009G161550--Sobic004G174200 Sobic009G161550--Sobic010G141800 Sobic009G161550--Sobic005G182000 Sobic009G161550--Sobic004G091100 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic009G161550--Sobic004G263600 Sobic002G034100 Sobic002G034100 Sobic009G161550--Sobic002G034100 Sobic001G365900 Sobic001G365900 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Octagon: transcription factors


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