Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G097700.2
Synonym Sb02g008060
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W339
Pfam PF08224
Panther DB PTHR33377 PTHR33377:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02970.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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13 Sobic.005G110300 - -
14 Sobic.008G166550 - -
15 Sobic.002G124600 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
16 Sobic.006G133900 NIN, putative, expressed -
17 Sobic.002G379750 - -
18 Sobic.002G117500 sterol 3-beta-glucosyltransferase, putative, expressed K05841: sterol 3beta-glucosyltransferase
19 Sobic.002G073250 - -
20 Sobic.006G065100 ERD1 protein, chloroplast precursor, putative, expressed K03696: ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC


Gene co-expression network
sample Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic010G153201 Sobic010G153201 Sobic002G097700--Sobic010G153201 Sobic008G184900 Sobic008G184900 Sobic002G097700--Sobic008G184900 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic002G097700--Sobic002G115050 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic002G097700--Sobic005G075100 Sobic010G141966 Sobic010G141966 Sobic002G097700--Sobic010G141966 Sobic010G100516 Sobic010G100516 Sobic002G097700--Sobic010G100516 Sobic005G118400 Sobic005G118400 Sobic002G097700--Sobic005G118400 Sobic004G181600 Sobic004G181600 Sobic002G097700--Sobic004G181600 Sobic001G038601 Sobic001G038601 Sobic002G097700--Sobic001G038601 Sobic010G153201--Sobic002G097700 Sobic010G153201--Sobic005G118400 Sobic001G540600 Sobic001G540600 Sobic010G153201--Sobic001G540600 Sobic001G530900 Sobic001G530900 Sobic010G153201--Sobic001G530900 Sobic002G073250 Sobic002G073250 Sobic010G153201--Sobic002G073250 Sobic001G378100 Sobic001G378100 Sobic010G153201--Sobic001G378100 Sobic004G179400 Sobic004G179400 Sobic010G153201--Sobic004G179400 Sobic010G002700 Sobic010G002700 Sobic010G153201--Sobic010G002700 Sobic007G185700 Sobic007G185700 Sobic010G153201--Sobic007G185700 Sobic008G185200 Sobic008G185200 Sobic008G184900--Sobic008G185200 Sobic008G184900--Sobic002G097700 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic008G184900--Sobic008G166550 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic008G184900--Sobic005G095000 Sobic008G184900--Sobic002G115050 Sobic002G379750 Sobic002G379750 Sobic008G184900--Sobic002G379750 Sobic009G194500 Sobic009G194500 Sobic008G184900--Sobic009G194500 Sobic002G431500 Sobic002G431500 Sobic008G184900--Sobic002G431500 Sobic001G251800 Sobic001G251800 Sobic008G184900--Sobic001G251800 Sobic002G115050--Sobic005G075100 Sobic002G115050--Sobic010G141966 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic002G115050--Sobic005G093800 Sobic002G115050--Sobic008G166550 Sobic002G115050--Sobic002G097700 Sobic002G115075 Sobic002G115075 Sobic002G115050--Sobic002G115075 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic002G115050--Sobic004G038800 Sobic002G115050--Sobic004G181600 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic002G115050--Sobic003G127001 Sobic005G075100--Sobic002G115050 Sobic005G075100--Sobic004G181600 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic005G075100--Sobic002G173100 Sobic002G345700 Sobic002G345700 Sobic005G075100--Sobic002G345700 Sobic003G190000 Sobic003G190000 Sobic005G075100--Sobic003G190000 Sobic005G075100--Sobic010G141966 Sobic006G133900 Sobic006G133900 Sobic005G075100--Sobic006G133900 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic005G075100--Sobic006G219600 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic005G075100--Sobic009G097200 Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic010G141966--Sobic010G141800 Sobic010G141966--Sobic002G115050 Sobic010G141966--Sobic005G075100 Sobic009G161550 Sobic009G161550 Sobic010G141966--Sobic009G161550 Sobic010G141966--Sobic002G097700 Sobic010G141966--Sobic006G133900 Sobic010G141966--Sobic010G100516 Sobic010G239600 Sobic010G239600 Sobic010G141966--Sobic010G239600 Sobic002G169400 Sobic002G169400 Sobic010G141966--Sobic002G169400 Sobic008G082100 Sobic008G082100 Sobic010G100516--Sobic008G082100 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic010G100516--Sobic004G263600 Sobic001G072500 Sobic001G072500 Sobic010G100516--Sobic001G072500 Sobic006G036566 Sobic006G036566 Sobic010G100516--Sobic006G036566 Sobic007G111400 Sobic007G111400 Sobic010G100516--Sobic007G111400 Sobic010G100516--Sobic010G153201 Sobic004G025800 Sobic004G025800 Sobic010G100516--Sobic004G025800 Sobic006G055200 Sobic006G055200 Sobic010G100516--Sobic006G055200 Sobic010G100516--Sobic002G097700 Sobic005G118400--Sobic010G002700 Sobic005G068700 Sobic005G068700 Sobic005G118400--Sobic005G068700 Sobic005G118400--Sobic001G378100 Sobic005G118400--Sobic001G540600 Sobic003G185900 Sobic003G185900 Sobic005G118400--Sobic003G185900 Sobic001G504400 Sobic001G504400 Sobic005G118400--Sobic001G504400 Sobic008G033000 Sobic008G033000 Sobic005G118400--Sobic008G033000 Sobic005G118400--Sobic001G530900 Sobic002G056500 Sobic002G056500 Sobic005G118400--Sobic002G056500 Sobic004G181600--Sobic006G133900 Sobic006G065600 Sobic006G065600 Sobic004G181600--Sobic006G065600 Sobic002G104100 Sobic002G104100 Sobic004G181600--Sobic002G104100 Sobic004G181600--Sobic005G075100 Sobic007G167100 Sobic007G167100 Sobic004G181600--Sobic007G167100 Sobic008G130100 Sobic008G130100 Sobic004G181600--Sobic008G130100 Sobic004G181600--Sobic006G219600 Sobic003G155100 Sobic003G155100 Sobic004G181600--Sobic003G155100 Sobic004G178500 Sobic004G178500 Sobic004G181600--Sobic004G178500 Sobic002G117500 Sobic002G117500 Sobic001G038601--Sobic002G117500 Sobic002G124600 Sobic002G124600 Sobic001G038601--Sobic002G124600 Sobic008G166400 Sobic008G166400 Sobic001G038601--Sobic008G166400 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic001G038601--Sobic007G095300 Sobic001G038601--Sobic002G097700 Sobic001G038601--Sobic010G153201 Sobic003G203300 Sobic003G203300 Sobic001G038601--Sobic003G203300 Sobic003G409000 Sobic003G409000 Sobic001G038601--Sobic003G409000 Sobic001G038601--Sobic005G118400
Octagon: transcription factors


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