Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G166550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R743
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF602
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14460 : LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g49380.4 : NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ84790 , KQJ84750
Barley HORVU2Hr1G000560.7 , HORVU2Hr1G000560.5 , HORVU2Hr1G000560.4 , HORVU2Hr1G000560.3 , HORVU2Hr1G000560.2 , HORVU2Hr1G000560.1 , HORVU2Hr1G000560.9 , HORVU2Hr1G000560.8 , HORVU2Hr1G000560.19 , HORVU2Hr1G000560.16 , HORVU2Hr1G000560.15 , HORVU2Hr1G000560.14 , HORVU2Hr1G000560.13 , HORVU2Hr1G000560.12 , HORVU2Hr1G000560.11 , HORVU2Hr1G000560.10 , HORVU2Hr1G000560.18 , HORVU2Hr1G000560.6
Wheat TraesCS2B02G471100 , TraesCS2A02G003900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G431500 - -
2 Sobic.007G202300 expressed protein -
3 Sobic.002G244200 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
4 Sobic.003G416000 - -
5 Sobic.008G101100 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
6 Sobic.005G095000 -(PubMedID : 22050783)@-(PubMedID : 25928459)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
7 Sobic.002G017500 expressed protein -
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10 Sobic.010G121200 - -
11 Sobic.008G084300 - -
12 Sobic.003G160100 - -
13 Sobic.001G459600 expressed protein -
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15 Sobic.009G101800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peptide transporter PTR3-A, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
16 Sobic.009G248801 - -
17 Sobic.008G184900 resistance protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G517800 NIN, putative, expressed -
19 Sobic.008G185200 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G133600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic002G431500 Sobic002G431500 Sobic008G166550--Sobic002G431500 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic008G166550--Sobic007G202300 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic008G166550--Sobic002G244200 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic008G166550--Sobic003G416000 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic008G166550--Sobic008G101100 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic008G166550--Sobic005G095000 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic008G166550--Sobic002G017500 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic008G166550--Sobic002G115050 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic008G166550--Sobic005G093800 Sobic002G431500--Sobic008G166550 Sobic002G129400 Sobic002G129400 Sobic002G431500--Sobic002G129400 Sobic010G223200 Sobic010G223200 Sobic002G431500--Sobic010G223200 Sobic003G301500 Sobic003G301500 Sobic002G431500--Sobic003G301500 Sobic007G166200 Sobic007G166200 Sobic002G431500--Sobic007G166200 Sobic001G243200 Sobic001G243200 Sobic002G431500--Sobic001G243200 Sobic004G338000 Sobic004G338000 Sobic002G431500--Sobic004G338000 Sobic006G235300 Sobic006G235300 Sobic002G431500--Sobic006G235300 Sobic004G127800 Sobic004G127800 Sobic002G431500--Sobic004G127800 Sobic007G202300--Sobic008G166550 Sobic007G202300--Sobic002G244200 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic007G202300--Sobic001G000300 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic007G202300--Sobic009G248801 Sobic007G202300--Sobic008G101100 Sobic007G202300--Sobic002G017500 Sobic007G202300--Sobic003G416000 Sobic007G202300--Sobic005G093800 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic007G202300--Sobic007G185300 Sobic002G244200--Sobic009G248801 Sobic002G244200--Sobic005G095000 Sobic002G244200--Sobic008G166550 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic002G244200--Sobic007G090403 Sobic007G133000 Sobic007G133000 Sobic002G244200--Sobic007G133000 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic002G244200--Sobic003G160100 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic002G244200--Sobic004G086150 Sobic002G244200--Sobic007G202300 Sobic002G244200--Sobic003G416000 Sobic003G416000--Sobic002G017500 Sobic003G416000--Sobic008G101100 Sobic003G416000--Sobic008G166550 Sobic003G416000--Sobic002G244200 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic003G416000--Sobic005G089400 Sobic001G227900 Sobic001G227900 Sobic003G416000--Sobic001G227900 Sobic003G416000--Sobic007G202300 Sobic003G080700 Sobic003G080700 Sobic003G416000--Sobic003G080700 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic003G416000--Sobic005G133600 Sobic008G101100--Sobic003G416000 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic008G101100--Sobic004G253700 Sobic008G101100--Sobic008G166550 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic008G101100--Sobic001G223550 Sobic008G101100--Sobic007G202300 Sobic008G101100--Sobic009G248801 Sobic008G101100--Sobic005G133600 Sobic008G101100--Sobic005G089400 Sobic008G101100--Sobic002G017500 Sobic009G194500 Sobic009G194500 Sobic005G095000--Sobic009G194500 Sobic010G131700 Sobic010G131700 Sobic005G095000--Sobic010G131700 Sobic005G095000--Sobic003G160100 Sobic002G119100 Sobic002G119100 Sobic005G095000--Sobic002G119100 Sobic005G095000--Sobic006G235300 Sobic005G095000--Sobic002G244200 Sobic005G095000--Sobic004G127800 Sobic009G100700 Sobic009G100700 Sobic005G095000--Sobic009G100700 Sobic005G095000--Sobic004G086150 Sobic002G017500--Sobic003G416000 Sobic002G017500--Sobic003G080700 Sobic002G017500--Sobic008G166550 Sobic002G017500--Sobic002G244200 Sobic002G017500--Sobic008G101100 Sobic002G017500--Sobic007G202300 Sobic002G017500--Sobic007G090403 Sobic002G017500--Sobic003G160100 Sobic001G413000 Sobic001G413000 Sobic002G017500--Sobic001G413000 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic002G115050--Sobic005G075100 Sobic010G141966 Sobic010G141966 Sobic002G115050--Sobic010G141966 Sobic002G115050--Sobic005G093800 Sobic002G115050--Sobic008G166550 Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic002G115050--Sobic002G097700 Sobic002G115075 Sobic002G115075 Sobic002G115050--Sobic002G115075 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic002G115050--Sobic004G038800 Sobic004G181600 Sobic004G181600 Sobic002G115050--Sobic004G181600 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic002G115050--Sobic003G127001 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic005G093800--Sobic003G190100 Sobic006G177900 Sobic006G177900 Sobic005G093800--Sobic006G177900 Sobic004G271600 Sobic004G271600 Sobic005G093800--Sobic004G271600 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic005G093800--Sobic002G173100 Sobic002G077400 Sobic002G077400 Sobic005G093800--Sobic002G077400 Sobic010G121200 Sobic010G121200 Sobic005G093800--Sobic010G121200 Sobic005G093800--Sobic002G115050 Sobic005G093800--Sobic008G166550 Sobic001G492600 Sobic001G492600 Sobic005G093800--Sobic001G492600
Octagon: transcription factors


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