Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G202300.1
Synonym Sb07g026970
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RAS3
Pfam -
Panther DB PTHR33115 PTHR33115:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06210 : ARM repeat superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g43110.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G166550 - -
2 Sobic.002G244200 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
3 Sobic.001G000300 - -
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9 Sobic.007G185300 - -
10 Sobic.009G101800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peptide transporter PTR3-A, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
11 Sobic.003G190100 vacuolar-processing enzyme precursor, putative, expressed K01369: legumain
12 Sobic.003G127001 - -
13 Sobic.002G115050 - -
14 Sobic.008G084300 - -
15 Sobic.005G095000 -(PubMedID : 22050783)@-(PubMedID : 25928459)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
16 Sobic.002G431500 - -
17 Sobic.005G133600 - -
18 Sobic.001G227900 -(PubMedID : 21930910)@-(PubMedID : 24884377)@two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
19 Sobic.003G160100 - -
20 Sobic.007G090403 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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