Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G185300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PIG8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G179350 - -
2 Sobic.002G173100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
3 Sobic.003G190100 vacuolar-processing enzyme precursor, putative, expressed K01369: legumain
4 Sobic.003G306600 acetamidase, putative, expressed K01455: formamidase
5 Sobic.002G244200 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
6 Sobic.008G081900 ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA homolog,chloroplast precursor, putative, expressed K03696: ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC
7 Sobic.007G090403 - -
8 Sobic.005G133600 - -
9 Sobic.002G424700 ATPOT1, putative, expressed -
10 Sobic.009G219100 expressed high in San Chi San (an efficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@"serine/threonine-protein kinase SNT7, chloroplast precursor"("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@serine/threonine-protein kinase SNT7, chloroplast precursor, putative, expressed -
11 Sobic.009G093100 OsAGSW1(Ortholog in rice:Li and Li 2015)(PubMedID : 31659923)@ ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G129400 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G026500 expressed protein -
14 Sobic.004G111300 - -
15 Sobic.007G202300 expressed protein -
16 Sobic.004G092900 puromycin-sensitive aminopeptidase, putative, expressed K08776: puromycin-sensitive aminopeptidase
17 Sobic.001G243200 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase protein, putative, expressed K08967: mtnD, mtnZ, 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase
18 Sobic.003G203300 stress regulated protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G166200 PPDK(PubMedID : 19549309)@NADP-malete dehydrogenase(PubMedID : 26904072)@NADP-malate dehydrogenase (NADP-MDH)(PubMedID : 16243851)@lactate/malate dehydrogenase, putative, expressed K00051: malate dehydrogenase (NADP+)
20 Sobic.001G219700 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic007G185300--Sobic003G179350 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic007G185300--Sobic002G173100 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic007G185300--Sobic003G190100 Sobic003G306600 Sobic003G306600 Sobic007G185300--Sobic003G306600 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic007G185300--Sobic002G244200 Sobic008G081900 Sobic008G081900 Sobic007G185300--Sobic008G081900 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic007G185300--Sobic007G090403 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic007G185300--Sobic005G133600 Sobic002G424700 Sobic002G424700 Sobic007G185300--Sobic002G424700 Sobic009G219100 Sobic009G219100 Sobic003G179350--Sobic009G219100 Sobic003G179350--Sobic003G306600 Sobic003G179350--Sobic007G185300 Sobic004G154400 Sobic004G154400 Sobic003G179350--Sobic004G154400 Sobic009G038701 Sobic009G038701 Sobic003G179350--Sobic009G038701 Sobic009G093100 Sobic009G093100 Sobic003G179350--Sobic009G093100 Sobic001G536700 Sobic001G536700 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Octagon: transcription factors


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