Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G133600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PS99
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.005G133600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G223550 - -
2 Sobic.009G248801 - -
3 Sobic.008G101100 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
4 Sobic.004G253700 - -
5 Sobic.003G160100 - -
6 Sobic.007G185300 - -
7 Sobic.007G090403 - -
8 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
9 Sobic.005G095000 -(PubMedID : 22050783)@-(PubMedID : 25928459)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
10 Sobic.001G459600 expressed protein -
11 Sobic.008G105366 - -
12 Sobic.002G244200 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
13 Sobic.001G000501 - -
14 Sobic.001G053200 expressed protein -
15 Sobic.004G070500 expressed protein -
16 Sobic.003G416000 - -
17 Sobic.008G166550 - -
18 Sobic.001G519900 ribonuclease protein, putative, expressed K12585: DIS3, exosome complex exonuclease DIS3/RRP44
19 Sobic.002G321800 60S ribosomal protein L44, putative, expressed K02929: RP-L44e, large subunit ribosomal protein L44e
20 Sobic.004G034600 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic005G133600--Sobic001G223550 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic005G133600--Sobic009G248801 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic005G133600--Sobic008G101100 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic005G133600--Sobic004G253700 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic005G133600--Sobic003G160100 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic005G133600--Sobic007G185300 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic005G133600--Sobic007G090403 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic005G133600--Sobic007G010700 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic005G133600--Sobic005G095000 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic001G223550--Sobic010G145500 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G223550--Sobic004G034600 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic001G223550--Sobic002G249300 Sobic001G223550--Sobic005G133600 Sobic001G223550--Sobic008G101100 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic001G223550--Sobic005G089400 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic001G223550--Sobic001G233300 Sobic008G081800 Sobic008G081800 Sobic001G223550--Sobic008G081800 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic001G223550--Sobic001G459600 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic009G248801--Sobic004G086150 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic009G248801--Sobic002G244200 Sobic009G248801--Sobic003G160100 Sobic009G248801--Sobic005G095000 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic009G248801--Sobic007G202300 Sobic009G248801--Sobic005G133600 Sobic009G248801--Sobic008G101100 Sobic009G248801--Sobic007G090403 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic009G248801--Sobic008G166550 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic008G101100--Sobic003G416000 Sobic008G101100--Sobic004G253700 Sobic008G101100--Sobic008G166550 Sobic008G101100--Sobic001G223550 Sobic008G101100--Sobic007G202300 Sobic008G101100--Sobic009G248801 Sobic008G101100--Sobic005G133600 Sobic008G101100--Sobic005G089400 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic008G101100--Sobic002G017500 Sobic004G253700--Sobic008G101100 Sobic004G253700--Sobic005G089400 Sobic008G122100 Sobic008G122100 Sobic004G253700--Sobic008G122100 Sobic004G253700--Sobic005G133600 Sobic004G253700--Sobic007G010700 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic004G253700--Sobic001G000501 Sobic004G253700--Sobic009G248801 Sobic004G253700--Sobic003G416000 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic004G253700--Sobic008G105366 Sobic003G160100--Sobic005G095000 Sobic003G160100--Sobic004G086150 Sobic004G006800 Sobic004G006800 Sobic003G160100--Sobic004G006800 Sobic003G160100--Sobic009G248801 Sobic003G160100--Sobic002G244200 Sobic002G379750 Sobic002G379750 Sobic003G160100--Sobic002G379750 Sobic003G160100--Sobic007G090403 Sobic003G160100--Sobic005G133600 Sobic007G133000 Sobic007G133000 Sobic003G160100--Sobic007G133000 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic007G185300--Sobic003G179350 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic007G185300--Sobic002G173100 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic007G185300--Sobic003G190100 Sobic003G306600 Sobic003G306600 Sobic007G185300--Sobic003G306600 Sobic007G185300--Sobic002G244200 Sobic008G081900 Sobic008G081900 Sobic007G185300--Sobic008G081900 Sobic007G185300--Sobic007G090403 Sobic007G185300--Sobic005G133600 Sobic002G424700 Sobic002G424700 Sobic007G185300--Sobic002G424700 Sobic005G068700 Sobic005G068700 Sobic007G090403--Sobic005G068700 Sobic007G090403--Sobic002G244200 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic007G090403--Sobic006G219600 Sobic001G062900 Sobic001G062900 Sobic007G090403--Sobic001G062900 Sobic005G149200 Sobic005G149200 Sobic007G090403--Sobic005G149200 Sobic001G133000 Sobic001G133000 Sobic007G090403--Sobic001G133000 Sobic009G123900 Sobic009G123900 Sobic007G090403--Sobic009G123900 Sobic006G065100 Sobic006G065100 Sobic007G090403--Sobic006G065100 Sobic009G215500 Sobic009G215500 Sobic007G090403--Sobic009G215500 Sobic004G070500 Sobic004G070500 Sobic007G010700--Sobic004G070500 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic007G010700--Sobic005G053200 Sobic007G010700--Sobic001G000501 Sobic007G010700--Sobic004G253700 Sobic007G010700--Sobic004G034600 Sobic007G010700--Sobic005G133600 Sobic003G061200 Sobic003G061200 Sobic007G010700--Sobic003G061200 Sobic007G010700--Sobic002G249300 Sobic007G010700--Sobic005G089400 Sobic009G194500 Sobic009G194500 Sobic005G095000--Sobic009G194500 Sobic010G131700 Sobic010G131700 Sobic005G095000--Sobic010G131700 Sobic005G095000--Sobic003G160100 Sobic002G119100 Sobic002G119100 Sobic005G095000--Sobic002G119100 Sobic006G235300 Sobic006G235300 Sobic005G095000--Sobic006G235300 Sobic005G095000--Sobic002G244200 Sobic004G127800 Sobic004G127800 Sobic005G095000--Sobic004G127800 Sobic009G100700 Sobic009G100700 Sobic005G095000--Sobic009G100700 Sobic005G095000--Sobic004G086150
Octagon: transcription factors


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