Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G053200.4
Synonym Sb01g004880
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QHF4
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33086 PTHR33086:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g23900.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G053200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G034600 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G133600 - -
3 Sobic.001G223550 - -
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7 Sobic.005G149700 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
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9 Sobic.003G160100 - -
10 Sobic.007G084300 kelch repeat protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G413000 ABC transporter family protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G118101 - -
13 Sobic.010G262500 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00134: GAPDH, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase
14 Sobic.003G061200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G070500 expressed protein -
16 Sobic.010G196500 zinc-binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G298700 - -
18 Sobic.010G020800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K14270: aminotransferase
19 Sobic.001G233300 - -
20 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G053200 Sobic001G053200 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G053200--Sobic004G034600 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic001G053200--Sobic005G133600 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic001G053200--Sobic001G223550 Sobic003G174301 Sobic003G174301 Sobic001G053200--Sobic003G174301 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic001G053200--Sobic002G249300 Sobic002G321800 Sobic002G321800 Sobic001G053200--Sobic002G321800 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic001G053200--Sobic005G149700 Sobic006G175800 Sobic006G175800 Sobic001G053200--Sobic006G175800 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic001G053200--Sobic003G160100 Sobic004G034600--Sobic005G149700 Sobic004G034600--Sobic002G249300 Sobic001G517800 Sobic001G517800 Sobic004G034600--Sobic001G517800 Sobic009G011600 Sobic009G011600 Sobic004G034600--Sobic009G011600 Sobic002G266000 Sobic002G266000 Sobic004G034600--Sobic002G266000 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic004G034600--Sobic001G459600 Sobic003G322700 Sobic003G322700 Sobic004G034600--Sobic003G322700 Sobic004G034600--Sobic001G223550 Sobic004G261900 Sobic004G261900 Sobic004G034600--Sobic004G261900 Sobic005G133600--Sobic001G223550 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic005G133600--Sobic009G248801 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic005G133600--Sobic008G101100 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic005G133600--Sobic004G253700 Sobic005G133600--Sobic003G160100 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic005G133600--Sobic007G185300 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic005G133600--Sobic007G090403 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic005G133600--Sobic007G010700 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic005G133600--Sobic005G095000 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic001G223550--Sobic010G145500 Sobic001G223550--Sobic004G034600 Sobic001G223550--Sobic002G249300 Sobic001G223550--Sobic005G133600 Sobic001G223550--Sobic008G101100 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic001G223550--Sobic005G089400 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic001G223550--Sobic001G233300 Sobic008G081800 Sobic008G081800 Sobic001G223550--Sobic008G081800 Sobic001G223550--Sobic001G459600 Sobic003G174301--Sobic002G249300 Sobic003G174301--Sobic004G034600 Sobic003G174301--Sobic005G149700 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic003G174301--Sobic005G053200 Sobic003G174301--Sobic009G011600 Sobic003G174301--Sobic001G053200 Sobic004G070500 Sobic004G070500 Sobic003G174301--Sobic004G070500 Sobic001G252000 Sobic001G252000 Sobic003G174301--Sobic001G252000 Sobic001G176501 Sobic001G176501 Sobic003G174301--Sobic001G176501 Sobic002G249300--Sobic004G034600 Sobic002G249300--Sobic003G174301 Sobic002G249300--Sobic001G223550 Sobic002G249300--Sobic005G149700 Sobic002G249300--Sobic009G011600 Sobic002G249300--Sobic001G233300 Sobic002G249300--Sobic001G252000 Sobic001G496100 Sobic001G496100 Sobic002G249300--Sobic001G496100 Sobic002G249300--Sobic007G010700 Sobic002G321800--Sobic005G133600 Sobic002G321800--Sobic001G053200 Sobic002G321800--Sobic009G248801 Sobic002G118101 Sobic002G118101 Sobic002G321800--Sobic002G118101 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic002G321800--Sobic004G086150 Sobic002G321800--Sobic003G160100 Sobic002G321800--Sobic004G253700 Sobic008G122100 Sobic008G122100 Sobic002G321800--Sobic008G122100 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic002G321800--Sobic001G000501 Sobic005G149700--Sobic004G034600 Sobic001G504900 Sobic001G504900 Sobic005G149700--Sobic001G504900 Sobic005G149700--Sobic002G266000 Sobic002G128200 Sobic002G128200 Sobic005G149700--Sobic002G128200 Sobic006G104600 Sobic006G104600 Sobic005G149700--Sobic006G104600 Sobic005G149700--Sobic009G011600 Sobic009G207600 Sobic009G207600 Sobic005G149700--Sobic009G207600 Sobic005G149700--Sobic003G174301 Sobic003G398100 Sobic003G398100 Sobic005G149700--Sobic003G398100 Sobic010G262500 Sobic010G262500 Sobic006G175800--Sobic010G262500 Sobic004G169000 Sobic004G169000 Sobic006G175800--Sobic004G169000 Sobic002G305000 Sobic002G305000 Sobic006G175800--Sobic002G305000 Sobic002G187700 Sobic002G187700 Sobic006G175800--Sobic002G187700 Sobic001G488700 Sobic001G488700 Sobic006G175800--Sobic001G488700 Sobic003G190400 Sobic003G190400 Sobic006G175800--Sobic003G190400 Sobic003G043300 Sobic003G043300 Sobic006G175800--Sobic003G043300 Sobic001G500800 Sobic001G500800 Sobic006G175800--Sobic001G500800 Sobic010G196500 Sobic010G196500 Sobic006G175800--Sobic010G196500 Sobic003G160100--Sobic005G095000 Sobic003G160100--Sobic004G086150 Sobic004G006800 Sobic004G006800 Sobic003G160100--Sobic004G006800 Sobic003G160100--Sobic009G248801 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic003G160100--Sobic002G244200 Sobic002G379750 Sobic002G379750 Sobic003G160100--Sobic002G379750 Sobic003G160100--Sobic007G090403 Sobic003G160100--Sobic005G133600 Sobic007G133000 Sobic007G133000 Sobic003G160100--Sobic007G133000
Octagon: transcription factors


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