Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G233300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QKI2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G153200 - -
2 Sobic.002G143766 - -
3 Sobic.001G223550 - -
4 Sobic.002G249300 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
5 Sobic.001G542150 - -
6 Sobic.010G145500 expressed protein -
7 Sobic.004G034600 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G149700 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
9 Sobic.001G000501 - -
10 Sobic.001G459600 expressed protein -
11 Sobic.001G504900 pheophorbide a oxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed K13071: PAO, pheophorbide a oxygenase
12 Sobic.005G133600 - -
13 Sobic.001G000700 glutathione S-transferase, N-terminal domain containing protein, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
14 Sobic.008G101100 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
15 Sobic.003G174301 - -
16 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
17 Sobic.004G261900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@diacylglycerol O-acyltransferase, putative, expressed K14457: MOGAT2, 2-acylglycerol O-acyltransferase 2
18 Sobic.001G053200 expressed protein -
19 Sobic.005G089400 - -
20 Sobic.004G070500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic001G233300--Sobic002G153200 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic001G233300--Sobic002G143766 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic001G233300--Sobic001G223550 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic001G233300--Sobic002G249300 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic001G233300--Sobic001G542150 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic001G233300--Sobic010G145500 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G233300--Sobic004G034600 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic001G233300--Sobic005G149700 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic001G233300--Sobic001G000501 Sobic002G153200--Sobic002G143766 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic002G153200--Sobic009G007200 Sobic002G153200--Sobic001G233300 Sobic002G153200--Sobic001G542150 Sobic005G077300 Sobic005G077300 Sobic002G153200--Sobic005G077300 Sobic002G153200--Sobic001G000501 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic002G153200--Sobic004G161501 Sobic004G150700 Sobic004G150700 Sobic002G153200--Sobic004G150700 Sobic004G154532 Sobic004G154532 Sobic002G153200--Sobic004G154532 Sobic002G143766--Sobic002G153200 Sobic002G143766--Sobic001G233300 Sobic002G143766--Sobic009G007200 Sobic002G143766--Sobic001G542150 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic002G143766--Sobic003G180600 Sobic002G143766--Sobic005G077300 Sobic002G143766--Sobic001G000501 Sobic002G143766--Sobic004G154532 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic002G143766--Sobic007G095300 Sobic001G223550--Sobic010G145500 Sobic001G223550--Sobic004G034600 Sobic001G223550--Sobic002G249300 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic001G223550--Sobic005G133600 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic001G223550--Sobic008G101100 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic001G223550--Sobic005G089400 Sobic001G223550--Sobic001G233300 Sobic008G081800 Sobic008G081800 Sobic001G223550--Sobic008G081800 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic001G223550--Sobic001G459600 Sobic002G249300--Sobic004G034600 Sobic003G174301 Sobic003G174301 Sobic002G249300--Sobic003G174301 Sobic002G249300--Sobic001G223550 Sobic002G249300--Sobic005G149700 Sobic009G011600 Sobic009G011600 Sobic002G249300--Sobic009G011600 Sobic002G249300--Sobic001G233300 Sobic001G252000 Sobic001G252000 Sobic002G249300--Sobic001G252000 Sobic001G496100 Sobic001G496100 Sobic002G249300--Sobic001G496100 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic002G249300--Sobic007G010700 Sobic001G542150--Sobic001G233300 Sobic001G542150--Sobic002G153200 Sobic001G542150--Sobic002G143766 Sobic001G542150--Sobic009G007200 Sobic001G176501 Sobic001G176501 Sobic001G542150--Sobic001G176501 Sobic003G174400 Sobic003G174400 Sobic001G542150--Sobic003G174400 Sobic001G542150--Sobic002G249300 Sobic004G057500 Sobic004G057500 Sobic001G542150--Sobic004G057500 Sobic005G150400 Sobic005G150400 Sobic001G542150--Sobic005G150400 Sobic010G145500--Sobic001G223550 Sobic010G145500--Sobic001G233300 Sobic010G145500--Sobic005G089400 Sobic010G271901 Sobic010G271901 Sobic010G145500--Sobic010G271901 Sobic010G145500--Sobic008G101100 Sobic010G121200 Sobic010G121200 Sobic010G145500--Sobic010G121200 Sobic010G145500--Sobic001G459600 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic010G145500--Sobic003G160100 Sobic001G517800 Sobic001G517800 Sobic010G145500--Sobic001G517800 Sobic004G034600--Sobic005G149700 Sobic004G034600--Sobic002G249300 Sobic004G034600--Sobic001G517800 Sobic004G034600--Sobic009G011600 Sobic002G266000 Sobic002G266000 Sobic004G034600--Sobic002G266000 Sobic004G034600--Sobic001G459600 Sobic003G322700 Sobic003G322700 Sobic004G034600--Sobic003G322700 Sobic004G034600--Sobic001G223550 Sobic004G261900 Sobic004G261900 Sobic004G034600--Sobic004G261900 Sobic005G149700--Sobic004G034600 Sobic001G504900 Sobic001G504900 Sobic005G149700--Sobic001G504900 Sobic005G149700--Sobic002G266000 Sobic002G128200 Sobic002G128200 Sobic005G149700--Sobic002G128200 Sobic006G104600 Sobic006G104600 Sobic005G149700--Sobic006G104600 Sobic005G149700--Sobic009G011600 Sobic009G207600 Sobic009G207600 Sobic005G149700--Sobic009G207600 Sobic005G149700--Sobic003G174301 Sobic003G398100 Sobic003G398100 Sobic005G149700--Sobic003G398100 Sobic001G000501--Sobic001G459600 Sobic001G000700 Sobic001G000700 Sobic001G000501--Sobic001G000700 Sobic001G000501--Sobic005G089400 Sobic001G000501--Sobic007G010700 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic001G000501--Sobic008G084300 Sobic001G000501--Sobic005G149700 Sobic001G000501--Sobic004G034600 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic001G000501--Sobic005G053200 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic001G000501--Sobic004G253700
Octagon: transcription factors


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