Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G153200.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W439
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G143766 - -
2 Sobic.009G007200 expressed protein -
3 Sobic.001G233300 - -
4 Sobic.001G542150 - -
5 Sobic.005G077300 - -
6 Sobic.001G000501 - -
7 Sobic.004G161501 - -
8 Sobic.004G150700 - -
9 Sobic.004G154532 - -
10 Sobic.003G180600 - -
11 Sobic.006G035400 - -
12 Sobic.005G149700 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
13 Sobic.002G171101 - -
14 Sobic.010G145500 expressed protein -
15 Sobic.008G187632 - -
16 Sobic.009G003300 expressed protein -
17 Sobic.002G124600 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
18 Sobic.007G095300 cbbY protein-related, putative, expressed -
19 Sobic.002G249300 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
20 Sobic.002G190300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic002G153200--Sobic002G143766 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic002G153200--Sobic009G007200 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic002G153200--Sobic001G233300 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic002G153200--Sobic001G542150 Sobic005G077300 Sobic005G077300 Sobic002G153200--Sobic005G077300 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic002G153200--Sobic001G000501 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic002G153200--Sobic004G161501 Sobic004G150700 Sobic004G150700 Sobic002G153200--Sobic004G150700 Sobic004G154532 Sobic004G154532 Sobic002G153200--Sobic004G154532 Sobic002G143766--Sobic002G153200 Sobic002G143766--Sobic001G233300 Sobic002G143766--Sobic009G007200 Sobic002G143766--Sobic001G542150 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic002G143766--Sobic003G180600 Sobic002G143766--Sobic005G077300 Sobic002G143766--Sobic001G000501 Sobic002G143766--Sobic004G154532 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic002G143766--Sobic007G095300 Sobic009G007200--Sobic003G180600 Sobic009G007200--Sobic002G153200 Sobic009G007200--Sobic002G143766 Sobic009G007200--Sobic004G154532 Sobic009G007200--Sobic005G077300 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic009G007200--Sobic003G232001 Sobic005G077200 Sobic005G077200 Sobic009G007200--Sobic005G077200 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic009G007200--Sobic005G081900 Sobic009G007200--Sobic007G095300 Sobic001G233300--Sobic002G153200 Sobic001G233300--Sobic002G143766 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic001G233300--Sobic001G223550 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic001G233300--Sobic002G249300 Sobic001G233300--Sobic001G542150 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic001G233300--Sobic010G145500 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G233300--Sobic004G034600 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic001G233300--Sobic005G149700 Sobic001G233300--Sobic001G000501 Sobic001G542150--Sobic001G233300 Sobic001G542150--Sobic002G153200 Sobic001G542150--Sobic002G143766 Sobic001G542150--Sobic009G007200 Sobic001G176501 Sobic001G176501 Sobic001G542150--Sobic001G176501 Sobic003G174400 Sobic003G174400 Sobic001G542150--Sobic003G174400 Sobic001G542150--Sobic002G249300 Sobic004G057500 Sobic004G057500 Sobic001G542150--Sobic004G057500 Sobic005G150400 Sobic005G150400 Sobic001G542150--Sobic005G150400 Sobic005G077300--Sobic002G153200 Sobic005G077300--Sobic009G007200 Sobic005G077300--Sobic002G143766 Sobic005G077300--Sobic003G180600 Sobic005G077300--Sobic005G077200 Sobic004G284001 Sobic004G284001 Sobic005G077300--Sobic004G284001 Sobic005G077300--Sobic005G081900 Sobic006G037900 Sobic006G037900 Sobic005G077300--Sobic006G037900 Sobic005G077300--Sobic001G542150 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic001G000501--Sobic001G459600 Sobic001G000700 Sobic001G000700 Sobic001G000501--Sobic001G000700 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic001G000501--Sobic005G089400 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic001G000501--Sobic007G010700 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic001G000501--Sobic008G084300 Sobic001G000501--Sobic005G149700 Sobic001G000501--Sobic004G034600 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic001G000501--Sobic005G053200 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic001G000501--Sobic004G253700 Sobic008G003800 Sobic008G003800 Sobic004G161501--Sobic008G003800 Sobic006G035400 Sobic006G035400 Sobic004G161501--Sobic006G035400 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic004G161501--Sobic010G060800 Sobic004G161501--Sobic002G153200 Sobic004G338701 Sobic004G338701 Sobic004G161501--Sobic004G338701 Sobic004G161501--Sobic009G007200 SobicK010300 SobicK010300 Sobic004G161501--SobicK010300 Sobic002G162450 Sobic002G162450 Sobic004G161501--Sobic002G162450 Sobic004G161501--Sobic002G143766 Sobic004G150700--Sobic002G153200 Sobic004G150700--Sobic004G338701 Sobic004G150700--SobicK010300 Sobic004G150700--Sobic004G161501 Sobic004G150700--Sobic002G143766 Sobic004G150700--Sobic009G007200 Sobic004G150700--Sobic001G233300 Sobic001G504900 Sobic001G504900 Sobic004G150700--Sobic001G504900 Sobic004G150700--Sobic004G154532 Sobic003G227501 Sobic003G227501 Sobic004G154532--Sobic003G227501 Sobic004G154466 Sobic004G154466 Sobic004G154532--Sobic004G154466 Sobic002G171101 Sobic002G171101 Sobic004G154532--Sobic002G171101 Sobic006G036700 Sobic006G036700 Sobic004G154532--Sobic006G036700 Sobic004G154532--Sobic009G007200 Sobic004G092350 Sobic004G092350 Sobic004G154532--Sobic004G092350 Sobic003G348000 Sobic003G348000 Sobic004G154532--Sobic003G348000 Sobic004G154532--Sobic005G077200 Sobic004G154532--Sobic002G153200
Octagon: transcription factors


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