Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G145500.2,Sobic.010G145500.1,Sobic.010G145500.4,Sobic.010G145500.5,Sobic.010G145500.3
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VT38 , C6JRU2 , C6JRT4 , C6JRZ6 , C6JRK2 , A0A1W0VT64 , A0A1W0VT26 , C6JRK1 , A0A1W0VT56 , B3VTC4 , A0A1W0VT52 , C6JS14 , C6JSR3
Pfam PF03004
Panther DB PTHR33063
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g14500.1,LOC_Os08g17020.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G145500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G223550 - -
2 Sobic.001G233300 - -
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7 Sobic.001G459600 expressed protein -
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9 Sobic.001G517800 NIN, putative, expressed -
10 Sobic.008G166550 - -
11 Sobic.004G034600 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
12 Sobic.008G187632 - -
13 Sobic.005G093800 NB-ARC domain containing protein, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
14 Sobic.002G124600 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
15 Sobic.003G416000 - -
16 Sobic.006G036700 - -
17 Sobic.001G000501 - -
18 Sobic.002G249300 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
19 Sobic.002G171101 - -
20 Sobic.010G020800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K14270: aminotransferase


Gene co-expression network
sample Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic010G145500--Sobic001G223550 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic010G145500--Sobic001G233300 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic010G145500--Sobic005G089400 Sobic010G271901 Sobic010G271901 Sobic010G145500--Sobic010G271901 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic010G145500--Sobic008G101100 Sobic010G121200 Sobic010G121200 Sobic010G145500--Sobic010G121200 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic010G145500--Sobic001G459600 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic010G145500--Sobic003G160100 Sobic001G517800 Sobic001G517800 Sobic010G145500--Sobic001G517800 Sobic001G223550--Sobic010G145500 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G223550--Sobic004G034600 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic001G223550--Sobic002G249300 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic001G223550--Sobic005G133600 Sobic001G223550--Sobic008G101100 Sobic001G223550--Sobic005G089400 Sobic001G223550--Sobic001G233300 Sobic008G081800 Sobic008G081800 Sobic001G223550--Sobic008G081800 Sobic001G223550--Sobic001G459600 Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic001G233300--Sobic002G153200 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic001G233300--Sobic002G143766 Sobic001G233300--Sobic001G223550 Sobic001G233300--Sobic002G249300 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic001G233300--Sobic001G542150 Sobic001G233300--Sobic010G145500 Sobic001G233300--Sobic004G034600 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic001G233300--Sobic005G149700 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic001G233300--Sobic001G000501 Sobic005G089400--Sobic001G000501 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic005G089400--Sobic004G253700 Sobic005G089400--Sobic001G223550 Sobic005G089400--Sobic008G101100 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic005G089400--Sobic003G416000 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic005G089400--Sobic007G010700 Sobic005G089400--Sobic001G459600 Sobic005G089400--Sobic010G145500 Sobic008G122100 Sobic008G122100 Sobic005G089400--Sobic008G122100 Sobic006G036700 Sobic006G036700 Sobic010G271901--Sobic006G036700 Sobic006G177900 Sobic006G177900 Sobic010G271901--Sobic006G177900 Sobic002G077400 Sobic002G077400 Sobic010G271901--Sobic002G077400 Sobic010G271901--Sobic010G145500 Sobic005G211600 Sobic005G211600 Sobic010G271901--Sobic005G211600 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic010G271901--Sobic005G093800 Sobic001G268000 Sobic001G268000 Sobic010G271901--Sobic001G268000 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic010G271901--Sobic003G190100 Sobic004G053800 Sobic004G053800 Sobic010G271901--Sobic004G053800 Sobic008G101100--Sobic003G416000 Sobic008G101100--Sobic004G253700 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic008G101100--Sobic008G166550 Sobic008G101100--Sobic001G223550 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic008G101100--Sobic007G202300 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic008G101100--Sobic009G248801 Sobic008G101100--Sobic005G133600 Sobic008G101100--Sobic005G089400 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic008G101100--Sobic002G017500 Sobic010G121200--Sobic005G093800 Sobic010G121200--Sobic008G166550 Sobic010G223200 Sobic010G223200 Sobic010G121200--Sobic010G223200 Sobic010G121200--Sobic008G101100 Sobic010G121200--Sobic010G145500 Sobic002G171101 Sobic002G171101 Sobic010G121200--Sobic002G171101 Sobic002G431500 Sobic002G431500 Sobic010G121200--Sobic002G431500 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic010G121200--Sobic002G115050 Sobic010G272800 Sobic010G272800 Sobic010G121200--Sobic010G272800 Sobic001G459600--Sobic001G517800 Sobic001G459600--Sobic001G000501 Sobic001G459600--Sobic004G034600 Sobic001G000700 Sobic001G000700 Sobic001G459600--Sobic001G000700 Sobic002G418800 Sobic002G418800 Sobic001G459600--Sobic002G418800 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic001G459600--Sobic008G084300 Sobic001G459600--Sobic008G166550 Sobic001G459600--Sobic001G223550 Sobic001G459600--Sobic005G133600 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic003G160100--Sobic005G095000 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic003G160100--Sobic004G086150 Sobic004G006800 Sobic004G006800 Sobic003G160100--Sobic004G006800 Sobic003G160100--Sobic009G248801 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic003G160100--Sobic002G244200 Sobic002G379750 Sobic002G379750 Sobic003G160100--Sobic002G379750 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic003G160100--Sobic007G090403 Sobic003G160100--Sobic005G133600 Sobic007G133000 Sobic007G133000 Sobic003G160100--Sobic007G133000 Sobic001G517800--Sobic001G459600 Sobic003G301900 Sobic003G301900 Sobic001G517800--Sobic003G301900 Sobic001G517800--Sobic004G034600 Sobic010G020800 Sobic010G020800 Sobic001G517800--Sobic010G020800 Sobic009G011600 Sobic009G011600 Sobic001G517800--Sobic009G011600 Sobic005G149200 Sobic005G149200 Sobic001G517800--Sobic005G149200 Sobic003G320700 Sobic003G320700 Sobic001G517800--Sobic003G320700 Sobic003G322700 Sobic003G322700 Sobic001G517800--Sobic003G322700 Sobic002G146300 Sobic002G146300 Sobic001G517800--Sobic002G146300
Octagon: transcription factors


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