Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G150700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPT6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G153200 - -
2 Sobic.004G338701 - -
3 Sobic.K010300 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -
4 Sobic.004G161501 - -
5 Sobic.002G143766 - -
6 Sobic.009G007200 expressed protein -
7 Sobic.001G233300 - -
8 Sobic.001G504900 pheophorbide a oxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed K13071: PAO, pheophorbide a oxygenase
9 Sobic.004G154532 - -
10 Sobic.003G227501 - -
11 Sobic.005G221000 hypothetical protein -
12 Sobic.002G130000 dehydrodolichyl diphosphate synthase, putative, expressed K11778: DHDDS, RER2, ditrans,polycis-polyprenyl diphosphate synthase
13 Sobic.007G163901 - -
14 Sobic.001G000501 - -
15 Sobic.006G035400 - -
16 Sobic.001G542150 - -
17 Sobic.004G172300 OsFBX252 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G442601 - K03123: TFIIA2, GTF2A2, transcription initiation factor TFIIA small subunit
19 Sobic.001G316400 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
20 Sobic.010G145500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G150700 Sobic004G150700 Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic004G150700--Sobic002G153200 Sobic004G338701 Sobic004G338701 Sobic004G150700--Sobic004G338701 SobicK010300 SobicK010300 Sobic004G150700--SobicK010300 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic004G150700--Sobic004G161501 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic004G150700--Sobic002G143766 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic004G150700--Sobic009G007200 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic004G150700--Sobic001G233300 Sobic001G504900 Sobic001G504900 Sobic004G150700--Sobic001G504900 Sobic004G154532 Sobic004G154532 Sobic004G150700--Sobic004G154532 Sobic002G153200--Sobic002G143766 Sobic002G153200--Sobic009G007200 Sobic002G153200--Sobic001G233300 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic002G153200--Sobic001G542150 Sobic005G077300 Sobic005G077300 Sobic002G153200--Sobic005G077300 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic002G153200--Sobic001G000501 Sobic002G153200--Sobic004G161501 Sobic002G153200--Sobic004G150700 Sobic002G153200--Sobic004G154532 Sobic004G338701--SobicK010300 Sobic004G338701--Sobic004G161501 Sobic004G338701--Sobic004G150700 Sobic004G338701--Sobic002G153200 Sobic004G338701--Sobic009G007200 Sobic004G102750 Sobic004G102750 Sobic004G338701--Sobic004G102750 Sobic006G035400 Sobic006G035400 Sobic004G338701--Sobic006G035400 Sobic003G442601 Sobic003G442601 Sobic004G338701--Sobic003G442601 Sobic004G338701--Sobic001G504900 SobicK010300--Sobic004G338701 SobicK010300--Sobic004G161501 SobicK010300--Sobic004G150700 SobicK010300--Sobic006G035400 SobicK010300--Sobic002G153200 Sobic002G162450 Sobic002G162450 SobicK010300--Sobic002G162450 Sobic003G227501 Sobic003G227501 SobicK010300--Sobic003G227501 Sobic006G036700 Sobic006G036700 SobicK010300--Sobic006G036700 SobicK010300--Sobic009G007200 Sobic008G003800 Sobic008G003800 Sobic004G161501--Sobic008G003800 Sobic004G161501--Sobic006G035400 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic004G161501--Sobic010G060800 Sobic004G161501--Sobic002G153200 Sobic004G161501--Sobic004G338701 Sobic004G161501--Sobic009G007200 Sobic004G161501--SobicK010300 Sobic004G161501--Sobic002G162450 Sobic004G161501--Sobic002G143766 Sobic002G143766--Sobic002G153200 Sobic002G143766--Sobic001G233300 Sobic002G143766--Sobic009G007200 Sobic002G143766--Sobic001G542150 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic002G143766--Sobic003G180600 Sobic002G143766--Sobic005G077300 Sobic002G143766--Sobic001G000501 Sobic002G143766--Sobic004G154532 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic002G143766--Sobic007G095300 Sobic009G007200--Sobic003G180600 Sobic009G007200--Sobic002G153200 Sobic009G007200--Sobic002G143766 Sobic009G007200--Sobic004G154532 Sobic009G007200--Sobic005G077300 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic009G007200--Sobic003G232001 Sobic005G077200 Sobic005G077200 Sobic009G007200--Sobic005G077200 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic009G007200--Sobic005G081900 Sobic009G007200--Sobic007G095300 Sobic001G233300--Sobic002G153200 Sobic001G233300--Sobic002G143766 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic001G233300--Sobic001G223550 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic001G233300--Sobic002G249300 Sobic001G233300--Sobic001G542150 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic001G233300--Sobic010G145500 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G233300--Sobic004G034600 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic001G233300--Sobic005G149700 Sobic001G233300--Sobic001G000501 Sobic009G207600 Sobic009G207600 Sobic001G504900--Sobic009G207600 Sobic003G398100 Sobic003G398100 Sobic001G504900--Sobic003G398100 Sobic004G261900 Sobic004G261900 Sobic001G504900--Sobic004G261900 Sobic001G504900--Sobic005G149700 Sobic002G266000 Sobic002G266000 Sobic001G504900--Sobic002G266000 Sobic002G338100 Sobic002G338100 Sobic001G504900--Sobic002G338100 Sobic001G069900 Sobic001G069900 Sobic001G504900--Sobic001G069900 Sobic006G181300 Sobic006G181300 Sobic001G504900--Sobic006G181300 Sobic001G015500 Sobic001G015500 Sobic001G504900--Sobic001G015500 Sobic004G154532--Sobic003G227501 Sobic004G154466 Sobic004G154466 Sobic004G154532--Sobic004G154466 Sobic002G171101 Sobic002G171101 Sobic004G154532--Sobic002G171101 Sobic004G154532--Sobic006G036700 Sobic004G154532--Sobic009G007200 Sobic004G092350 Sobic004G092350 Sobic004G154532--Sobic004G092350 Sobic003G348000 Sobic003G348000 Sobic004G154532--Sobic003G348000 Sobic004G154532--Sobic005G077200 Sobic004G154532--Sobic002G153200
Octagon: transcription factors


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