Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G227501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VYJ0
Pfam -
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g44640.1 : ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G154532 - -
2 Sobic.006G036700 - -
3 Sobic.004G154466 - -
4 Sobic.003G348000 SAC3/GANP family protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G035400 - -
6 Sobic.002G171101 - -
7 Sobic.004G102750 - -
8 Sobic.010G145500 expressed protein -
9 Sobic.005G205200 - -
10 Sobic.003G442601 - K03123: TFIIA2, GTF2A2, transcription initiation factor TFIIA small subunit
11 Sobic.004G217500 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.004G338000 PPCK(PubMedID : 19549309)@PEP carboxylase kinase(PubMedID : 20410319)@-(PubMedID : 26976818)@phosphorylation of leaf PEPC during C4 photosynthesis.(PubMedID : 16925599)@calcium-dependent protein kinase isoform AK1, putative, expressed -
13 Sobic.010G271901 - -
14 Sobic.007G006200 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G007200 expressed protein -
16 Sobic.004G239700 - -
17 Sobic.004G161501 - -
18 Sobic.004G092350 - -
19 Sobic.010G223200 OsFtsH2 FtsH protease, homologue of AtFtsH2/8, expressed K03798: ftsH, cell division protease FtsH
20 Sobic.010G272800 OsFtsH1 FtsH protease, homologue of AtFtsH1/5, expressed K03798: ftsH, cell division protease FtsH


Gene co-expression network
sample Sobic003G227501 Sobic003G227501 Sobic004G154532 Sobic004G154532 Sobic003G227501--Sobic004G154532 Sobic006G036700 Sobic006G036700 Sobic003G227501--Sobic006G036700 Sobic004G154466 Sobic004G154466 Sobic003G227501--Sobic004G154466 Sobic003G348000 Sobic003G348000 Sobic003G227501--Sobic003G348000 Sobic006G035400 Sobic006G035400 Sobic003G227501--Sobic006G035400 Sobic002G171101 Sobic002G171101 Sobic003G227501--Sobic002G171101 Sobic004G102750 Sobic004G102750 Sobic003G227501--Sobic004G102750 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic003G227501--Sobic010G145500 Sobic005G205200 Sobic005G205200 Sobic003G227501--Sobic005G205200 Sobic004G154532--Sobic003G227501 Sobic004G154532--Sobic004G154466 Sobic004G154532--Sobic002G171101 Sobic004G154532--Sobic006G036700 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic004G154532--Sobic009G007200 Sobic004G092350 Sobic004G092350 Sobic004G154532--Sobic004G092350 Sobic004G154532--Sobic003G348000 Sobic005G077200 Sobic005G077200 Sobic004G154532--Sobic005G077200 Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic004G154532--Sobic002G153200 Sobic006G036700--Sobic006G035400 Sobic006G036700--Sobic003G227501 Sobic010G271901 Sobic010G271901 Sobic006G036700--Sobic010G271901 Sobic005G221900 Sobic005G221900 Sobic006G036700--Sobic005G221900 Sobic010G024200 Sobic010G024200 Sobic006G036700--Sobic010G024200 Sobic006G036700--Sobic004G154532 Sobic006G036700--Sobic005G205200 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic006G036700--Sobic010G060800 Sobic006G036700--Sobic010G145500 Sobic004G154466--Sobic004G154532 Sobic004G154466--Sobic003G227501 Sobic005G217000 Sobic005G217000 Sobic004G154466--Sobic005G217000 Sobic010G275700 Sobic010G275700 Sobic004G154466--Sobic010G275700 Sobic001G200000 Sobic001G200000 Sobic004G154466--Sobic001G200000 Sobic004G154466--Sobic006G036700 Sobic004G154466--Sobic002G171101 Sobic002G293500 Sobic002G293500 Sobic004G154466--Sobic002G293500 Sobic003G391200 Sobic003G391200 Sobic004G154466--Sobic003G391200 Sobic003G348000--Sobic003G227501 Sobic003G348000--Sobic004G154532 Sobic004G276900 Sobic004G276900 Sobic003G348000--Sobic004G276900 Sobic004G239700 Sobic004G239700 Sobic003G348000--Sobic004G239700 Sobic003G348000--Sobic005G205200 Sobic008G167600 Sobic008G167600 Sobic003G348000--Sobic008G167600 Sobic001G052600 Sobic001G052600 Sobic003G348000--Sobic001G052600 Sobic002G213300 Sobic002G213300 Sobic003G348000--Sobic002G213300 Sobic002G043800 Sobic002G043800 Sobic003G348000--Sobic002G043800 Sobic006G035400--Sobic006G036700 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic006G035400--Sobic004G161501 Sobic006G035400--Sobic010G060800 Sobic006G035400--Sobic003G227501 Sobic006G035400--Sobic010G024200 Sobic006G035400--Sobic002G153200 Sobic006G035400--Sobic010G145500 Sobic001G268000 Sobic001G268000 Sobic006G035400--Sobic001G268000 Sobic006G035400--Sobic010G271901 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic002G171101--Sobic007G095300 Sobic002G171101--Sobic004G154532 Sobic006G235300 Sobic006G235300 Sobic002G171101--Sobic006G235300 Sobic002G124600 Sobic002G124600 Sobic002G171101--Sobic002G124600 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic002G171101--Sobic005G095000 Sobic010G223200 Sobic010G223200 Sobic002G171101--Sobic010G223200 Sobic002G379750 Sobic002G379750 Sobic002G171101--Sobic002G379750 Sobic007G006200 Sobic007G006200 Sobic002G171101--Sobic007G006200 Sobic002G137850 Sobic002G137850 Sobic002G171101--Sobic002G137850 Sobic007G097300 Sobic007G097300 Sobic004G102750--Sobic007G097300 Sobic004G102750--Sobic003G227501 Sobic004G102750--Sobic009G007200 Sobic004G102750--Sobic004G154532 Sobic004G188500 Sobic004G188500 Sobic004G102750--Sobic004G188500 Sobic004G102750--Sobic003G348000 Sobic003G442601 Sobic003G442601 Sobic004G102750--Sobic003G442601 Sobic004G338701 Sobic004G338701 Sobic004G102750--Sobic004G338701 Sobic004G102750--Sobic002G171101 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic010G145500--Sobic001G223550 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic010G145500--Sobic001G233300 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic010G145500--Sobic005G089400 Sobic010G145500--Sobic010G271901 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic010G145500--Sobic008G101100 Sobic010G121200 Sobic010G121200 Sobic010G145500--Sobic010G121200 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic010G145500--Sobic001G459600 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic010G145500--Sobic003G160100 Sobic001G517800 Sobic001G517800 Sobic010G145500--Sobic001G517800 Sobic005G208200 Sobic005G208200 Sobic005G205200--Sobic005G208200 Sobic005G223600 Sobic005G223600 Sobic005G205200--Sobic005G223600 Sobic005G223925 Sobic005G223925 Sobic005G205200--Sobic005G223925 Sobic005G205200--Sobic010G024200 Sobic005G205200--Sobic005G221900 Sobic008G003800 Sobic008G003800 Sobic005G205200--Sobic008G003800 Sobic005G205200--Sobic006G036700 Sobic005G205200--Sobic003G348000 Sobic005G205200--Sobic010G060800
Octagon: transcription factors


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