Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G007200.1
Synonym Sb09g000840
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YY39
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g03210.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G180600 - -
2 Sobic.002G153200 - -
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4 Sobic.004G154532 - -
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10 Sobic.001G542150 - -
11 Sobic.004G161501 - -
12 Sobic.004G102750 - -
13 Sobic.006G036700 - -
14 Sobic.006G222000 MBTB6 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.001G233300 - -
16 Sobic.006G035400 - -
17 Sobic.002G171101 - -
18 Sobic.003G227501 - -
19 Sobic.010G060800 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -
20 Sobic.001G000501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic009G007200--Sobic003G180600 Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic009G007200--Sobic002G153200 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic009G007200--Sobic002G143766 Sobic004G154532 Sobic004G154532 Sobic009G007200--Sobic004G154532 Sobic005G077300 Sobic005G077300 Sobic009G007200--Sobic005G077300 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic009G007200--Sobic003G232001 Sobic005G077200 Sobic005G077200 Sobic009G007200--Sobic005G077200 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic009G007200--Sobic005G081900 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic009G007200--Sobic007G095300 Sobic003G180600--Sobic009G007200 Sobic003G180600--Sobic003G232001 Sobic003G180600--Sobic007G095300 Sobic003G180600--Sobic005G081900 Sobic002G027232 Sobic002G027232 Sobic003G180600--Sobic002G027232 Sobic003G180600--Sobic005G077200 Sobic008G029200 Sobic008G029200 Sobic003G180600--Sobic008G029200 Sobic007G098800 Sobic007G098800 Sobic003G180600--Sobic007G098800 Sobic006G037900 Sobic006G037900 Sobic003G180600--Sobic006G037900 Sobic002G153200--Sobic002G143766 Sobic002G153200--Sobic009G007200 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic002G153200--Sobic001G233300 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic002G153200--Sobic001G542150 Sobic002G153200--Sobic005G077300 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic002G153200--Sobic001G000501 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic002G153200--Sobic004G161501 Sobic004G150700 Sobic004G150700 Sobic002G153200--Sobic004G150700 Sobic002G153200--Sobic004G154532 Sobic002G143766--Sobic002G153200 Sobic002G143766--Sobic001G233300 Sobic002G143766--Sobic009G007200 Sobic002G143766--Sobic001G542150 Sobic002G143766--Sobic003G180600 Sobic002G143766--Sobic005G077300 Sobic002G143766--Sobic001G000501 Sobic002G143766--Sobic004G154532 Sobic002G143766--Sobic007G095300 Sobic003G227501 Sobic003G227501 Sobic004G154532--Sobic003G227501 Sobic004G154466 Sobic004G154466 Sobic004G154532--Sobic004G154466 Sobic002G171101 Sobic002G171101 Sobic004G154532--Sobic002G171101 Sobic006G036700 Sobic006G036700 Sobic004G154532--Sobic006G036700 Sobic004G154532--Sobic009G007200 Sobic004G092350 Sobic004G092350 Sobic004G154532--Sobic004G092350 Sobic003G348000 Sobic003G348000 Sobic004G154532--Sobic003G348000 Sobic004G154532--Sobic005G077200 Sobic004G154532--Sobic002G153200 Sobic005G077300--Sobic002G153200 Sobic005G077300--Sobic009G007200 Sobic005G077300--Sobic002G143766 Sobic005G077300--Sobic003G180600 Sobic005G077300--Sobic005G077200 Sobic004G284001 Sobic004G284001 Sobic005G077300--Sobic004G284001 Sobic005G077300--Sobic005G081900 Sobic005G077300--Sobic006G037900 Sobic005G077300--Sobic001G542150 Sobic003G232001--Sobic003G180600 Sobic003G232001--Sobic009G007200 Sobic001G419600 Sobic001G419600 Sobic003G232001--Sobic001G419600 Sobic003G232001--Sobic007G095300 Sobic003G232001--Sobic007G098800 Sobic003G232001--Sobic005G081900 Sobic005G150400 Sobic005G150400 Sobic003G232001--Sobic005G150400 Sobic004G003600 Sobic004G003600 Sobic003G232001--Sobic004G003600 Sobic003G232001--Sobic002G027232 Sobic005G077200--Sobic002G027232 Sobic005G077200--Sobic003G180600 Sobic005G077200--Sobic006G037900 Sobic005G077200--Sobic004G154532 Sobic005G077200--Sobic009G007200 Sobic005G077200--Sobic005G077300 Sobic005G077200--Sobic005G081900 Sobic008G187632 Sobic008G187632 Sobic005G077200--Sobic008G187632 Sobic002G137850 Sobic002G137850 Sobic005G077200--Sobic002G137850 Sobic006G222000 Sobic006G222000 Sobic005G081900--Sobic006G222000 Sobic005G081900--Sobic002G027232 Sobic006G241100 Sobic006G241100 Sobic005G081900--Sobic006G241100 Sobic005G081900--Sobic003G180600 Sobic005G081900--Sobic008G029200 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic005G081900--Sobic010G060800 Sobic006G225700 Sobic006G225700 Sobic005G081900--Sobic006G225700 Sobic005G081900--Sobic009G007200 Sobic005G081900--Sobic005G077200 Sobic007G095300--Sobic003G180600 Sobic007G095300--Sobic002G171101 Sobic007G095300--Sobic004G284001 Sobic007G095300--Sobic004G003600 Sobic007G095300--Sobic006G037900 Sobic001G038601 Sobic001G038601 Sobic007G095300--Sobic001G038601 Sobic007G095300--Sobic001G419600 Sobic007G095300--Sobic002G137850 Sobic002G077400 Sobic002G077400 Sobic007G095300--Sobic002G077400
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