Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G095300.1
Synonym Sb07g009455
Functional annotation cbbY protein-related, putative, expressed
UniProt A0A1B6PGQ1
Pfam -
Panther DB PTHR18901 PTHR18901:SF28
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45170 : Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g43520.1 : cbbY protein-related, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004805
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5B02G014500 , TraesCS5B02G014500 , TraesCS5D02G023500 , TraesCS5A02G016300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G180600 - -
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10 Sobic.008G029200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@WRKY104, expressed -
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18 Sobic.007G098800 formamidopyrimidine-DNA glycosylase, putative, expressed K10563: mutM, formamidopyrimidine-DNA glycosylase
19 Sobic.003G314000 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G143766 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic007G095300--Sobic003G180600 Sobic002G171101 Sobic002G171101 Sobic007G095300--Sobic002G171101 Sobic004G284001 Sobic004G284001 Sobic007G095300--Sobic004G284001 Sobic004G003600 Sobic004G003600 Sobic007G095300--Sobic004G003600 Sobic006G037900 Sobic006G037900 Sobic007G095300--Sobic006G037900 Sobic001G038601 Sobic001G038601 Sobic007G095300--Sobic001G038601 Sobic001G419600 Sobic001G419600 Sobic007G095300--Sobic001G419600 Sobic002G137850 Sobic002G137850 Sobic007G095300--Sobic002G137850 Sobic002G077400 Sobic002G077400 Sobic007G095300--Sobic002G077400 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic003G180600--Sobic009G007200 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic003G180600--Sobic003G232001 Sobic003G180600--Sobic007G095300 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic003G180600--Sobic005G081900 Sobic002G027232 Sobic002G027232 Sobic003G180600--Sobic002G027232 Sobic005G077200 Sobic005G077200 Sobic003G180600--Sobic005G077200 Sobic008G029200 Sobic008G029200 Sobic003G180600--Sobic008G029200 Sobic007G098800 Sobic007G098800 Sobic003G180600--Sobic007G098800 Sobic003G180600--Sobic006G037900 Sobic002G171101--Sobic007G095300 Sobic004G154532 Sobic004G154532 Sobic002G171101--Sobic004G154532 Sobic006G235300 Sobic006G235300 Sobic002G171101--Sobic006G235300 Sobic002G124600 Sobic002G124600 Sobic002G171101--Sobic002G124600 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic002G171101--Sobic005G095000 Sobic010G223200 Sobic010G223200 Sobic002G171101--Sobic010G223200 Sobic002G379750 Sobic002G379750 Sobic002G171101--Sobic002G379750 Sobic007G006200 Sobic007G006200 Sobic002G171101--Sobic007G006200 Sobic002G171101--Sobic002G137850 Sobic004G284001--Sobic007G095300 Sobic004G284001--Sobic006G037900 Sobic004G284001--Sobic002G137850 Sobic010G100300 Sobic010G100300 Sobic004G284001--Sobic010G100300 Sobic002G190300 Sobic002G190300 Sobic004G284001--Sobic002G190300 Sobic002G117500 Sobic002G117500 Sobic004G284001--Sobic002G117500 Sobic004G284001--Sobic003G180600 Sobic002G056500 Sobic002G056500 Sobic004G284001--Sobic002G056500 Sobic005G077300 Sobic005G077300 Sobic004G284001--Sobic005G077300 Sobic004G003600--Sobic007G095300 Sobic004G003600--Sobic001G419600 Sobic004G175400 Sobic004G175400 Sobic004G003600--Sobic004G175400 Sobic003G409000 Sobic003G409000 Sobic004G003600--Sobic003G409000 Sobic004G003600--Sobic003G232001 Sobic004G003600--Sobic001G038601 Sobic004G003600--Sobic002G077400 Sobic004G003600--Sobic003G180600 Sobic004G003600--Sobic008G029200 Sobic006G037900--Sobic004G284001 Sobic006G037900--Sobic007G095300 Sobic004G092350 Sobic004G092350 Sobic006G037900--Sobic004G092350 Sobic006G037900--Sobic002G027232 Sobic006G037900--Sobic003G180600 Sobic006G037900--Sobic002G117500 Sobic006G037900--Sobic002G137850 Sobic006G037900--Sobic005G077200 Sobic006G176000 Sobic006G176000 Sobic006G037900--Sobic006G176000 Sobic001G038601--Sobic002G117500 Sobic001G038601--Sobic002G124600 Sobic008G166400 Sobic008G166400 Sobic001G038601--Sobic008G166400 Sobic001G038601--Sobic007G095300 Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic001G038601--Sobic002G097700 Sobic010G153201 Sobic010G153201 Sobic001G038601--Sobic010G153201 Sobic003G203300 Sobic003G203300 Sobic001G038601--Sobic003G203300 Sobic001G038601--Sobic003G409000 Sobic005G118400 Sobic005G118400 Sobic001G038601--Sobic005G118400 Sobic010G024200 Sobic010G024200 Sobic001G419600--Sobic010G024200 Sobic005G221900 Sobic005G221900 Sobic001G419600--Sobic005G221900 Sobic001G419600--Sobic004G003600 Sobic001G419600--Sobic007G095300 Sobic001G419600--Sobic003G232001 Sobic001G419600--Sobic003G180600 Sobic005G205200 Sobic005G205200 Sobic001G419600--Sobic005G205200 Sobic005G073800 Sobic005G073800 Sobic001G419600--Sobic005G073800 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic001G419600--Sobic010G060800 Sobic002G119100 Sobic002G119100 Sobic002G137850--Sobic002G119100 Sobic004G322600 Sobic004G322600 Sobic002G137850--Sobic004G322600 Sobic002G137850--Sobic004G092350 Sobic010G231300 Sobic010G231300 Sobic002G137850--Sobic010G231300 Sobic006G161500 Sobic006G161500 Sobic002G137850--Sobic006G161500 Sobic004G035100 Sobic004G035100 Sobic002G137850--Sobic004G035100 Sobic003G314000 Sobic003G314000 Sobic002G137850--Sobic003G314000 Sobic009G194500 Sobic009G194500 Sobic002G137850--Sobic009G194500 Sobic002G137850--Sobic002G171101 Sobic006G177900 Sobic006G177900 Sobic002G077400--Sobic006G177900 Sobic001G009000 Sobic001G009000 Sobic002G077400--Sobic001G009000 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic002G077400--Sobic003G190100 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic002G077400--Sobic005G093800 Sobic007G149700 Sobic007G149700 Sobic002G077400--Sobic007G149700 Sobic010G271901 Sobic010G271901 Sobic002G077400--Sobic010G271901 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic002G077400--Sobic002G173100 Sobic001G250000 Sobic001G250000 Sobic002G077400--Sobic001G250000 Sobic010G178401 Sobic010G178401 Sobic002G077400--Sobic010G178401
Octagon: transcription factors


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