Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G003600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RK76
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G095300 cbbY protein-related, putative, expressed -
2 Sobic.001G419600 DnaK family protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G175400 - -
4 Sobic.003G409000 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR3 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
5 Sobic.003G232001 - -
6 Sobic.001G038601 - -
7 Sobic.002G077400 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
8 Sobic.003G180600 - -
9 Sobic.008G029200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@WRKY104, expressed -
10 Sobic.004G284001 - -
11 Sobic.003G174400 - -
12 Sobic.005G150400 - -
13 Sobic.007G098800 formamidopyrimidine-DNA glycosylase, putative, expressed K10563: mutM, formamidopyrimidine-DNA glycosylase
14 Sobic.001G009000 expressed protein -
15 Sobic.009G248801 - -
16 Sobic.006G037900 - -
17 Sobic.007G090451 - -
18 Sobic.007G090403 - -
19 Sobic.003G190100 vacuolar-processing enzyme precursor, putative, expressed K01369: legumain
20 Sobic.001G498700 OsFBO11 - F-box and other domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G003600 Sobic004G003600 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic004G003600--Sobic007G095300 Sobic001G419600 Sobic001G419600 Sobic004G003600--Sobic001G419600 Sobic004G175400 Sobic004G175400 Sobic004G003600--Sobic004G175400 Sobic003G409000 Sobic003G409000 Sobic004G003600--Sobic003G409000 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic004G003600--Sobic003G232001 Sobic001G038601 Sobic001G038601 Sobic004G003600--Sobic001G038601 Sobic002G077400 Sobic002G077400 Sobic004G003600--Sobic002G077400 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic004G003600--Sobic003G180600 Sobic008G029200 Sobic008G029200 Sobic004G003600--Sobic008G029200 Sobic007G095300--Sobic003G180600 Sobic002G171101 Sobic002G171101 Sobic007G095300--Sobic002G171101 Sobic004G284001 Sobic004G284001 Sobic007G095300--Sobic004G284001 Sobic007G095300--Sobic004G003600 Sobic006G037900 Sobic006G037900 Sobic007G095300--Sobic006G037900 Sobic007G095300--Sobic001G038601 Sobic007G095300--Sobic001G419600 Sobic002G137850 Sobic002G137850 Sobic007G095300--Sobic002G137850 Sobic007G095300--Sobic002G077400 Sobic010G024200 Sobic010G024200 Sobic001G419600--Sobic010G024200 Sobic005G221900 Sobic005G221900 Sobic001G419600--Sobic005G221900 Sobic001G419600--Sobic004G003600 Sobic001G419600--Sobic007G095300 Sobic001G419600--Sobic003G232001 Sobic001G419600--Sobic003G180600 Sobic005G205200 Sobic005G205200 Sobic001G419600--Sobic005G205200 Sobic005G073800 Sobic005G073800 Sobic001G419600--Sobic005G073800 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic001G419600--Sobic010G060800 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic004G175400--Sobic009G248801 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic004G175400--Sobic004G086150 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic004G175400--Sobic005G053200 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic004G175400--Sobic001G000501 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic004G175400--Sobic007G090403 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic004G175400--Sobic001G459600 Sobic001G517800 Sobic001G517800 Sobic004G175400--Sobic001G517800 Sobic009G098200 Sobic009G098200 Sobic004G175400--Sobic009G098200 Sobic004G175400--Sobic004G003600 Sobic007G090451 Sobic007G090451 Sobic003G409000--Sobic007G090451 Sobic007G133000 Sobic007G133000 Sobic003G409000--Sobic007G133000 Sobic010G231300 Sobic010G231300 Sobic003G409000--Sobic010G231300 Sobic003G409000--Sobic001G038601 Sobic004G179400 Sobic004G179400 Sobic003G409000--Sobic004G179400 Sobic001G540600 Sobic001G540600 Sobic003G409000--Sobic001G540600 Sobic003G314000 Sobic003G314000 Sobic003G409000--Sobic003G314000 Sobic002G324400 Sobic002G324400 Sobic003G409000--Sobic002G324400 Sobic001G217900 Sobic001G217900 Sobic003G409000--Sobic001G217900 Sobic003G232001--Sobic003G180600 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic003G232001--Sobic009G007200 Sobic003G232001--Sobic001G419600 Sobic003G232001--Sobic007G095300 Sobic007G098800 Sobic007G098800 Sobic003G232001--Sobic007G098800 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic003G232001--Sobic005G081900 Sobic005G150400 Sobic005G150400 Sobic003G232001--Sobic005G150400 Sobic003G232001--Sobic004G003600 Sobic002G027232 Sobic002G027232 Sobic003G232001--Sobic002G027232 Sobic002G117500 Sobic002G117500 Sobic001G038601--Sobic002G117500 Sobic002G124600 Sobic002G124600 Sobic001G038601--Sobic002G124600 Sobic008G166400 Sobic008G166400 Sobic001G038601--Sobic008G166400 Sobic001G038601--Sobic007G095300 Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic001G038601--Sobic002G097700 Sobic010G153201 Sobic010G153201 Sobic001G038601--Sobic010G153201 Sobic003G203300 Sobic003G203300 Sobic001G038601--Sobic003G203300 Sobic001G038601--Sobic003G409000 Sobic005G118400 Sobic005G118400 Sobic001G038601--Sobic005G118400 Sobic006G177900 Sobic006G177900 Sobic002G077400--Sobic006G177900 Sobic001G009000 Sobic001G009000 Sobic002G077400--Sobic001G009000 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic002G077400--Sobic003G190100 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic002G077400--Sobic005G093800 Sobic007G149700 Sobic007G149700 Sobic002G077400--Sobic007G149700 Sobic010G271901 Sobic010G271901 Sobic002G077400--Sobic010G271901 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic002G077400--Sobic002G173100 Sobic001G250000 Sobic001G250000 Sobic002G077400--Sobic001G250000 Sobic010G178401 Sobic010G178401 Sobic002G077400--Sobic010G178401 Sobic003G180600--Sobic009G007200 Sobic003G180600--Sobic003G232001 Sobic003G180600--Sobic007G095300 Sobic003G180600--Sobic005G081900 Sobic003G180600--Sobic002G027232 Sobic005G077200 Sobic005G077200 Sobic003G180600--Sobic005G077200 Sobic003G180600--Sobic008G029200 Sobic003G180600--Sobic007G098800 Sobic003G180600--Sobic006G037900 Sobic008G029200--Sobic003G180600 Sobic008G029200--Sobic005G081900 Sobic008G029200--Sobic002G027232 Sobic008G029200--Sobic007G095300 Sobic008G029200--Sobic006G037900 Sobic005G192400 Sobic005G192400 Sobic008G029200--Sobic005G192400 Sobic006G222000 Sobic006G222000 Sobic008G029200--Sobic006G222000 Sobic006G176000 Sobic006G176000 Sobic008G029200--Sobic006G176000 Sobic008G029200--Sobic004G284001
Octagon: transcription factors


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