Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G150400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PSL4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G185300 - -
2 Sobic.005G133600 - -
3 Sobic.009G248801 - -
4 Sobic.003G232001 - -
5 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
6 Sobic.001G519900 ribonuclease protein, putative, expressed K12585: DIS3, exosome complex exonuclease DIS3/RRP44
7 Sobic.007G090403 - -
8 Sobic.003G179350 - -
9 Sobic.001G542150 - -
10 Sobic.005G053200 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
11 Sobic.002G031900 RFC1 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 1, expressed -
12 Sobic.002G424700 ATPOT1, putative, expressed -
13 Sobic.002G124600 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
14 Sobic.001G000501 - -
15 Sobic.004G086150 - -
16 Sobic.007G202300 expressed protein -
17 Sobic.002G244200 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
18 Sobic.004G003600 - -
19 Sobic.007G095300 cbbY protein-related, putative, expressed -
20 Sobic.004G284001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G150400 Sobic005G150400 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic005G150400--Sobic007G185300 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic005G150400--Sobic005G133600 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic005G150400--Sobic009G248801 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic005G150400--Sobic003G232001 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic005G150400--Sobic007G010700 Sobic001G519900 Sobic001G519900 Sobic005G150400--Sobic001G519900 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic005G150400--Sobic007G090403 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic005G150400--Sobic003G179350 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic005G150400--Sobic001G542150 Sobic007G185300--Sobic003G179350 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic007G185300--Sobic002G173100 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic007G185300--Sobic003G190100 Sobic003G306600 Sobic003G306600 Sobic007G185300--Sobic003G306600 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic007G185300--Sobic002G244200 Sobic008G081900 Sobic008G081900 Sobic007G185300--Sobic008G081900 Sobic007G185300--Sobic007G090403 Sobic007G185300--Sobic005G133600 Sobic002G424700 Sobic002G424700 Sobic007G185300--Sobic002G424700 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic005G133600--Sobic001G223550 Sobic005G133600--Sobic009G248801 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic005G133600--Sobic008G101100 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic005G133600--Sobic004G253700 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic005G133600--Sobic003G160100 Sobic005G133600--Sobic007G185300 Sobic005G133600--Sobic007G090403 Sobic005G133600--Sobic007G010700 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic005G133600--Sobic005G095000 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic009G248801--Sobic004G086150 Sobic009G248801--Sobic002G244200 Sobic009G248801--Sobic003G160100 Sobic009G248801--Sobic005G095000 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic009G248801--Sobic007G202300 Sobic009G248801--Sobic005G133600 Sobic009G248801--Sobic008G101100 Sobic009G248801--Sobic007G090403 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic009G248801--Sobic008G166550 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic003G232001--Sobic003G180600 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic003G232001--Sobic009G007200 Sobic001G419600 Sobic001G419600 Sobic003G232001--Sobic001G419600 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic003G232001--Sobic007G095300 Sobic007G098800 Sobic007G098800 Sobic003G232001--Sobic007G098800 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic003G232001--Sobic005G081900 Sobic003G232001--Sobic005G150400 Sobic004G003600 Sobic004G003600 Sobic003G232001--Sobic004G003600 Sobic002G027232 Sobic002G027232 Sobic003G232001--Sobic002G027232 Sobic004G070500 Sobic004G070500 Sobic007G010700--Sobic004G070500 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic007G010700--Sobic005G053200 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic007G010700--Sobic001G000501 Sobic007G010700--Sobic004G253700 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic007G010700--Sobic004G034600 Sobic007G010700--Sobic005G133600 Sobic003G061200 Sobic003G061200 Sobic007G010700--Sobic003G061200 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic007G010700--Sobic002G249300 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic007G010700--Sobic005G089400 Sobic001G373900 Sobic001G373900 Sobic001G519900--Sobic001G373900 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic001G519900--Sobic004G334300 Sobic002G308700 Sobic002G308700 Sobic001G519900--Sobic002G308700 Sobic003G186000 Sobic003G186000 Sobic001G519900--Sobic003G186000 Sobic005G162500 Sobic005G162500 Sobic001G519900--Sobic005G162500 Sobic004G356700 Sobic004G356700 Sobic001G519900--Sobic004G356700 Sobic001G375100 Sobic001G375100 Sobic001G519900--Sobic001G375100 Sobic001G192000 Sobic001G192000 Sobic001G519900--Sobic001G192000 Sobic006G259800 Sobic006G259800 Sobic001G519900--Sobic006G259800 Sobic005G068700 Sobic005G068700 Sobic007G090403--Sobic005G068700 Sobic007G090403--Sobic002G244200 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic007G090403--Sobic006G219600 Sobic001G062900 Sobic001G062900 Sobic007G090403--Sobic001G062900 Sobic005G149200 Sobic005G149200 Sobic007G090403--Sobic005G149200 Sobic001G133000 Sobic001G133000 Sobic007G090403--Sobic001G133000 Sobic009G123900 Sobic009G123900 Sobic007G090403--Sobic009G123900 Sobic006G065100 Sobic006G065100 Sobic007G090403--Sobic006G065100 Sobic009G215500 Sobic009G215500 Sobic007G090403--Sobic009G215500 Sobic009G219100 Sobic009G219100 Sobic003G179350--Sobic009G219100 Sobic003G179350--Sobic003G306600 Sobic003G179350--Sobic007G185300 Sobic004G154400 Sobic004G154400 Sobic003G179350--Sobic004G154400 Sobic009G038701 Sobic009G038701 Sobic003G179350--Sobic009G038701 Sobic009G093100 Sobic009G093100 Sobic003G179350--Sobic009G093100 Sobic001G536700 Sobic001G536700 Sobic003G179350--Sobic001G536700 Sobic001G504400 Sobic001G504400 Sobic003G179350--Sobic001G504400 Sobic009G062400 Sobic009G062400 Sobic003G179350--Sobic009G062400 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic001G542150--Sobic001G233300 Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic001G542150--Sobic002G153200 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic001G542150--Sobic002G143766 Sobic001G542150--Sobic009G007200 Sobic001G176501 Sobic001G176501 Sobic001G542150--Sobic001G176501 Sobic003G174400 Sobic003G174400 Sobic001G542150--Sobic003G174400 Sobic001G542150--Sobic002G249300 Sobic004G057500 Sobic004G057500 Sobic001G542150--Sobic004G057500 Sobic001G542150--Sobic005G150400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.