Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G542150.1,Sobic.001G542150.3,Sobic.001G542150.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SC10 , A0A1Z5SC34
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G233300 - -
2 Sobic.002G153200 - -
3 Sobic.002G143766 - -
4 Sobic.009G007200 expressed protein -
5 Sobic.001G176501 - -
6 Sobic.003G174400 - -
7 Sobic.002G249300 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
8 Sobic.004G057500 OsMADS1 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
9 Sobic.005G150400 - -
10 Sobic.001G000501 - -
11 Sobic.003G174301 - -
12 Sobic.009G014332 - -
13 Sobic.010G163400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed -
14 Sobic.004G130964 - -
15 Sobic.005G077300 - -
16 Sobic.005G149700 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
17 Sobic.003G180600 - -
18 Sobic.004G034600 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G145500 expressed protein -
20 Sobic.001G459600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic001G542150--Sobic001G233300 Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic001G542150--Sobic002G153200 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic001G542150--Sobic002G143766 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic001G542150--Sobic009G007200 Sobic001G176501 Sobic001G176501 Sobic001G542150--Sobic001G176501 Sobic003G174400 Sobic003G174400 Sobic001G542150--Sobic003G174400 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic001G542150--Sobic002G249300 Sobic004G057500 Sobic004G057500 Sobic001G542150--Sobic004G057500 Sobic005G150400 Sobic005G150400 Sobic001G542150--Sobic005G150400 Sobic001G233300--Sobic002G153200 Sobic001G233300--Sobic002G143766 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic001G233300--Sobic001G223550 Sobic001G233300--Sobic002G249300 Sobic001G233300--Sobic001G542150 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic001G233300--Sobic010G145500 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G233300--Sobic004G034600 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic001G233300--Sobic005G149700 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic001G233300--Sobic001G000501 Sobic002G153200--Sobic002G143766 Sobic002G153200--Sobic009G007200 Sobic002G153200--Sobic001G233300 Sobic002G153200--Sobic001G542150 Sobic005G077300 Sobic005G077300 Sobic002G153200--Sobic005G077300 Sobic002G153200--Sobic001G000501 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic002G153200--Sobic004G161501 Sobic004G150700 Sobic004G150700 Sobic002G153200--Sobic004G150700 Sobic004G154532 Sobic004G154532 Sobic002G153200--Sobic004G154532 Sobic002G143766--Sobic002G153200 Sobic002G143766--Sobic001G233300 Sobic002G143766--Sobic009G007200 Sobic002G143766--Sobic001G542150 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic002G143766--Sobic003G180600 Sobic002G143766--Sobic005G077300 Sobic002G143766--Sobic001G000501 Sobic002G143766--Sobic004G154532 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic002G143766--Sobic007G095300 Sobic009G007200--Sobic003G180600 Sobic009G007200--Sobic002G153200 Sobic009G007200--Sobic002G143766 Sobic009G007200--Sobic004G154532 Sobic009G007200--Sobic005G077300 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic009G007200--Sobic003G232001 Sobic005G077200 Sobic005G077200 Sobic009G007200--Sobic005G077200 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic009G007200--Sobic005G081900 Sobic009G007200--Sobic007G095300 Sobic001G176501--Sobic003G174400 Sobic001G176501--Sobic002G249300 Sobic010G135900 Sobic010G135900 Sobic001G176501--Sobic010G135900 Sobic001G496100 Sobic001G496100 Sobic001G176501--Sobic001G496100 Sobic003G174301 Sobic003G174301 Sobic001G176501--Sobic003G174301 Sobic001G176501--Sobic004G034600 Sobic009G006400 Sobic009G006400 Sobic001G176501--Sobic009G006400 Sobic001G176501--Sobic001G000501 Sobic001G176501--Sobic005G149700 Sobic003G174400--Sobic001G176501 Sobic003G174400--Sobic002G249300 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic003G174400--Sobic001G459600 Sobic003G174400--Sobic004G034600 Sobic003G174400--Sobic005G149700 Sobic003G174400--Sobic010G135900 Sobic003G174400--Sobic001G000501 Sobic003G174400--Sobic003G174301 Sobic003G174400--Sobic001G496100 Sobic002G249300--Sobic004G034600 Sobic002G249300--Sobic003G174301 Sobic002G249300--Sobic001G223550 Sobic002G249300--Sobic005G149700 Sobic009G011600 Sobic009G011600 Sobic002G249300--Sobic009G011600 Sobic002G249300--Sobic001G233300 Sobic001G252000 Sobic001G252000 Sobic002G249300--Sobic001G252000 Sobic002G249300--Sobic001G496100 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic002G249300--Sobic007G010700 Sobic005G102900 Sobic005G102900 Sobic004G057500--Sobic005G102900 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic004G057500--Sobic005G133600 Sobic010G227800 Sobic010G227800 Sobic004G057500--Sobic010G227800 Sobic001G519900 Sobic001G519900 Sobic004G057500--Sobic001G519900 Sobic001G279601 Sobic001G279601 Sobic004G057500--Sobic001G279601 Sobic004G057500--Sobic003G174301 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic004G057500--Sobic005G053200 Sobic002G128200 Sobic002G128200 Sobic004G057500--Sobic002G128200 Sobic004G057500--Sobic005G149700 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic005G150400--Sobic007G185300 Sobic005G150400--Sobic005G133600 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic005G150400--Sobic009G248801 Sobic005G150400--Sobic003G232001 Sobic005G150400--Sobic007G010700 Sobic005G150400--Sobic001G519900 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic005G150400--Sobic007G090403 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic005G150400--Sobic003G179350 Sobic005G150400--Sobic001G542150
Octagon: transcription factors


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