Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G163400.7,Sobic.010G163400.5,Sobic.010G163400.6,Sobic.010G163400.8,Sobic.010G163400.2,Sobic.010G163400.3,Sobic.010G163400.4,Sobic.010G163400.9
Synonym CYP38, ATCYP38
Functional annotation peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed
UniProt A0A1W0VTD2 , A0A1W0VTG5 , A0A1W0VTF5 , A0A1W0VTF8 , A0A1W0VTD1 , A0A1W0VTE8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G01480 : cyclophilin 38
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g29370.1 : peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G135250 - -
2 Sobic.004G111300 - -
3 Sobic.007G185300 - -
4 Sobic.003G179350 - -
5 Sobic.002G129400 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G207500 signal peptide peptidase domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G251100 - -
8 Sobic.003G166200 expressed protein -
9 Sobic.010G121100 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G020800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K14270: aminotransferase
11 Sobic.010G137100 - -
12 Sobic.010G132900 - -
13 Sobic.001G542150 - -
14 Sobic.002G031900 RFC1 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 1, expressed -
15 Sobic.010G271901 - -
16 Sobic.007G098800 formamidopyrimidine-DNA glycosylase, putative, expressed K10563: mutM, formamidopyrimidine-DNA glycosylase
17 Sobic.003G186900 - K12812: DDX39B, UAP56, ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
18 Sobic.003G203300 stress regulated protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G124600 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
20 Sobic.010G043100 serine esterase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G163400 Sobic010G163400 Sobic010G135250 Sobic010G135250 Sobic010G163400--Sobic010G135250 Sobic004G111300 Sobic004G111300 Sobic010G163400--Sobic004G111300 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic010G163400--Sobic007G185300 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic010G163400--Sobic003G179350 Sobic002G129400 Sobic002G129400 Sobic010G163400--Sobic002G129400 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic010G163400--Sobic003G207500 Sobic003G251100 Sobic003G251100 Sobic010G163400--Sobic003G251100 Sobic003G166200 Sobic003G166200 Sobic010G163400--Sobic003G166200 Sobic010G121100 Sobic010G121100 Sobic010G163400--Sobic010G121100 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic010G135250--Sobic010G137100 Sobic005G100250 Sobic005G100250 Sobic010G135250--Sobic005G100250 Sobic010G135250--Sobic003G251100 Sobic010G132900 Sobic010G132900 Sobic010G135250--Sobic010G132900 Sobic010G135250--Sobic010G163400 Sobic010G135250--Sobic003G207500 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic010G135250--Sobic010G102366 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic010G135250--Sobic007G163001 Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic010G135250--Sobic008G111200 Sobic004G111300--Sobic003G207500 Sobic004G111300--Sobic003G179350 Sobic004G111300--Sobic007G185300 Sobic004G111300--Sobic007G163001 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic004G111300--Sobic005G145550 Sobic004G111300--Sobic003G166200 Sobic003G219200 Sobic003G219200 Sobic004G111300--Sobic003G219200 Sobic004G324700 Sobic004G324700 Sobic004G111300--Sobic004G324700 Sobic007G007200 Sobic007G007200 Sobic004G111300--Sobic007G007200 Sobic007G185300--Sobic003G179350 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic007G185300--Sobic002G173100 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic007G185300--Sobic003G190100 Sobic003G306600 Sobic003G306600 Sobic007G185300--Sobic003G306600 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic007G185300--Sobic002G244200 Sobic008G081900 Sobic008G081900 Sobic007G185300--Sobic008G081900 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic007G185300--Sobic007G090403 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic007G185300--Sobic005G133600 Sobic002G424700 Sobic002G424700 Sobic007G185300--Sobic002G424700 Sobic009G219100 Sobic009G219100 Sobic003G179350--Sobic009G219100 Sobic003G179350--Sobic003G306600 Sobic003G179350--Sobic007G185300 Sobic004G154400 Sobic004G154400 Sobic003G179350--Sobic004G154400 Sobic009G038701 Sobic009G038701 Sobic003G179350--Sobic009G038701 Sobic009G093100 Sobic009G093100 Sobic003G179350--Sobic009G093100 Sobic001G536700 Sobic001G536700 Sobic003G179350--Sobic001G536700 Sobic001G504400 Sobic001G504400 Sobic003G179350--Sobic001G504400 Sobic009G062400 Sobic009G062400 Sobic003G179350--Sobic009G062400 Sobic007G166200 Sobic007G166200 Sobic002G129400--Sobic007G166200 Sobic002G129400--Sobic008G081900 Sobic002G072400 Sobic002G072400 Sobic002G129400--Sobic002G072400 Sobic002G349100 Sobic002G349100 Sobic002G129400--Sobic002G349100 Sobic002G081400 Sobic002G081400 Sobic002G129400--Sobic002G081400 Sobic002G129400--Sobic009G093100 Sobic003G203300 Sobic003G203300 Sobic002G129400--Sobic003G203300 Sobic006G065100 Sobic006G065100 Sobic002G129400--Sobic006G065100 Sobic001G219700 Sobic001G219700 Sobic002G129400--Sobic001G219700 Sobic003G207500--Sobic007G163001 Sobic003G207500--Sobic004G111300 Sobic003G207500--Sobic005G145550 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic003G207500--Sobic007G188800 Sobic003G207500--Sobic003G251100 Sobic001G475100 Sobic001G475100 Sobic003G207500--Sobic001G475100 Sobic003G207500--Sobic008G111200 Sobic005G102900 Sobic005G102900 Sobic003G207500--Sobic005G102900 Sobic003G207500--Sobic004G324700 Sobic003G251100--Sobic007G163001 Sobic003G251100--Sobic003G207500 Sobic003G251100--Sobic007G188800 Sobic003G251100--Sobic010G135250 Sobic003G251100--Sobic001G475100 Sobic006G268600 Sobic006G268600 Sobic003G251100--Sobic006G268600 Sobic003G251100--Sobic005G102900 Sobic003G251100--Sobic005G145550 Sobic009G014332 Sobic009G014332 Sobic003G251100--Sobic009G014332 Sobic006G259600 Sobic006G259600 Sobic003G166200--Sobic006G259600 Sobic001G333800 Sobic001G333800 Sobic003G166200--Sobic001G333800 Sobic001G207800 Sobic001G207800 Sobic003G166200--Sobic001G207800 Sobic006G090100 Sobic006G090100 Sobic003G166200--Sobic006G090100 Sobic001G258200 Sobic001G258200 Sobic003G166200--Sobic001G258200 Sobic003G166200--Sobic009G093100 Sobic003G186900 Sobic003G186900 Sobic003G166200--Sobic003G186900 Sobic006G221000 Sobic006G221000 Sobic003G166200--Sobic006G221000 Sobic001G303200 Sobic001G303200 Sobic003G166200--Sobic001G303200 Sobic010G121100--Sobic001G475100 Sobic010G273300 Sobic010G273300 Sobic010G121100--Sobic010G273300 Sobic010G121100--Sobic005G145550 Sobic010G205600 Sobic010G205600 Sobic010G121100--Sobic010G205600 Sobic010G121100--Sobic007G185300 Sobic008G021400 Sobic008G021400 Sobic010G121100--Sobic008G021400 Sobic010G121100--Sobic007G163001 Sobic010G121100--Sobic005G102900 Sobic010G121100--Sobic002G424700
Octagon: transcription factors


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