Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G132900.2,Sobic.010G132900.3,Sobic.010G132900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YIW0 , C6JRN7 , A0A194YIY0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g01970.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G135250 - -
2 Sobic.005G100250 - -
3 Sobic.010G137100 - -
4 Sobic.010G163400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed -
5 Sobic.010G102366 - -
6 Sobic.001G201900 folylpolyglutamate synthetase, putative, expressed K01930: folylpolyglutamate synthase
7 Sobic.005G145550 - -
8 Sobic.003G351401 - -
9 Sobic.003G261566 - -
10 Sobic.005G149400 maf, putative, expressed K06287: septum formation protein
11 Sobic.001G475100 expressed protein -
12 Sobic.005G188300 expressed protein -
13 Sobic.004G267900 expressed protein K10756: replication factor C subunit 3/5
14 Sobic.004G324700 - -
15 Sobic.008G044900 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@expressed protein -
16 Sobic.004G340300 dehydrogenase, putative, expressed K09753: cinnamoyl-CoA reductase
17 Sobic.005G213100 - -
18 Sobic.005G189300 - -
19 Sobic.K031800 inositol-1-monophosphatase, putative, expressed K01082: cysQ, MET22, 3'(2'), 5'-bisphosphate nucleotidase
20 Sobic.007G163001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G132900 Sobic010G132900 Sobic010G135250 Sobic010G135250 Sobic010G132900--Sobic010G135250 Sobic005G100250 Sobic005G100250 Sobic010G132900--Sobic005G100250 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic010G132900--Sobic010G137100 Sobic010G163400 Sobic010G163400 Sobic010G132900--Sobic010G163400 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic010G132900--Sobic010G102366 Sobic001G201900 Sobic001G201900 Sobic010G132900--Sobic001G201900 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic010G132900--Sobic005G145550 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic010G132900--Sobic003G351401 Sobic003G261566 Sobic003G261566 Sobic010G132900--Sobic003G261566 Sobic010G135250--Sobic010G137100 Sobic010G135250--Sobic005G100250 Sobic003G251100 Sobic003G251100 Sobic010G135250--Sobic003G251100 Sobic010G135250--Sobic010G132900 Sobic010G135250--Sobic010G163400 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic010G135250--Sobic003G207500 Sobic010G135250--Sobic010G102366 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic010G135250--Sobic007G163001 Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic010G135250--Sobic008G111200 Sobic005G100250--Sobic010G135250 Sobic005G100250--Sobic010G132900 Sobic003G032600 Sobic003G032600 Sobic005G100250--Sobic003G032600 Sobic010G028501 Sobic010G028501 Sobic005G100250--Sobic010G028501 Sobic009G089101 Sobic009G089101 Sobic005G100250--Sobic009G089101 Sobic005G213100 Sobic005G213100 Sobic005G100250--Sobic005G213100 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic005G100250--Sobic009G093800 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic005G100250--Sobic003G134700 Sobic005G100250--Sobic003G351401 Sobic010G137100--Sobic010G102366 Sobic010G137100--Sobic010G135250 Sobic002G286300 Sobic002G286300 Sobic010G137100--Sobic002G286300 Sobic010G137100--Sobic003G207500 Sobic004G340300 Sobic004G340300 Sobic010G137100--Sobic004G340300 Sobic010G137100--Sobic010G132900 Sobic010G137100--Sobic010G163400 Sobic001G182850 Sobic001G182850 Sobic010G137100--Sobic001G182850 Sobic010G137100--Sobic003G251100 Sobic010G163400--Sobic010G135250 Sobic004G111300 Sobic004G111300 Sobic010G163400--Sobic004G111300 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic010G163400--Sobic007G185300 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic010G163400--Sobic003G179350 Sobic002G129400 Sobic002G129400 Sobic010G163400--Sobic002G129400 Sobic010G163400--Sobic003G207500 Sobic010G163400--Sobic003G251100 Sobic003G166200 Sobic003G166200 Sobic010G163400--Sobic003G166200 Sobic010G121100 Sobic010G121100 Sobic010G163400--Sobic010G121100 Sobic010G102366--Sobic010G137100 Sobic010G102366--Sobic003G134700 Sobic010G102366--Sobic010G135250 Sobic004G350800 Sobic004G350800 Sobic010G102366--Sobic004G350800 Sobic010G102366--Sobic004G340300 Sobic010G102366--Sobic010G132900 Sobic010G102366--Sobic003G351401 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic010G102366--Sobic003G112001 Sobic010G102366--Sobic002G286300 Sobic002G407000 Sobic002G407000 Sobic001G201900--Sobic002G407000 Sobic008G119250 Sobic008G119250 Sobic001G201900--Sobic008G119250 Sobic007G113600 Sobic007G113600 Sobic001G201900--Sobic007G113600 Sobic001G178100 Sobic001G178100 Sobic001G201900--Sobic001G178100 Sobic005G111700 Sobic005G111700 Sobic001G201900--Sobic005G111700 Sobic001G513800 Sobic001G513800 Sobic001G201900--Sobic001G513800 Sobic004G064300 Sobic004G064300 Sobic001G201900--Sobic004G064300 Sobic001G116500 Sobic001G116500 Sobic001G201900--Sobic001G116500 Sobic003G403300 Sobic003G403300 Sobic001G201900--Sobic003G403300 Sobic005G189300 Sobic005G189300 Sobic005G145550--Sobic005G189300 Sobic005G145550--Sobic007G163001 Sobic004G324700 Sobic004G324700 Sobic005G145550--Sobic004G324700 Sobic001G475100 Sobic001G475100 Sobic005G145550--Sobic001G475100 Sobic005G145550--Sobic003G207500 Sobic002G031900 Sobic002G031900 Sobic005G145550--Sobic002G031900 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic005G145550--Sobic007G188800 Sobic005G145550--Sobic003G179350 Sobic005G145550--Sobic004G111300 Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic003G351401--Sobic005G163866 Sobic003G351401--Sobic010G135250 Sobic003G351401--Sobic007G188800 Sobic003G351401--Sobic010G102366 Sobic001G528500 Sobic001G528500 Sobic003G351401--Sobic001G528500 Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic003G351401--Sobic001G312400 Sobic003G351401--Sobic003G207500 Sobic003G351401--Sobic009G089101 Sobic003G351401--Sobic003G112001 Sobic010G273300 Sobic010G273300 Sobic003G261566--Sobic010G273300 Sobic003G261566--Sobic010G135250 Sobic003G261566--Sobic010G132900 Sobic003G258500 Sobic003G258500 Sobic003G261566--Sobic003G258500 Sobic003G261566--Sobic003G134700 Sobic003G261566--Sobic005G100250 Sobic003G261566--Sobic003G112001 Sobic003G261566--Sobic001G475100 Sobic003G261566--Sobic010G102366
Octagon: transcription factors


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