Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G145550.1,Sobic.005G145550.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJJ5 , A0A1Z5RJT4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G189300 - -
2 Sobic.007G163001 - -
3 Sobic.004G324700 - -
4 Sobic.001G475100 expressed protein -
5 Sobic.003G207500 signal peptide peptidase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G031900 RFC1 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 1, expressed -
7 Sobic.007G188800 "Candidate orthologue to the wheat Pm40 gene, Disease resistance RGA1"(PubMedID : 27755575)@CC-NBS-LRR, putative, expressed -
8 Sobic.003G179350 - -
9 Sobic.004G111300 - -
10 Sobic.005G188300 expressed protein -
11 Sobic.010G214500 purple acid phosphatase, putative, expressed -
12 Sobic.008G111200 - -
13 Sobic.010G121100 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G185300 - -
15 Sobic.009G043100 F-box/LRR-repeat protein 14, putative, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
16 Sobic.003G186900 - K12812: DDX39B, UAP56, ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
17 Sobic.002G424700 ATPOT1, putative, expressed -
18 Sobic.010G273300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
19 Sobic.004G324300 expressed protein -
20 Sobic.008G021400 cysteine-rich receptor-like protein kinase 7 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic005G189300 Sobic005G189300 Sobic005G145550--Sobic005G189300 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic005G145550--Sobic007G163001 Sobic004G324700 Sobic004G324700 Sobic005G145550--Sobic004G324700 Sobic001G475100 Sobic001G475100 Sobic005G145550--Sobic001G475100 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic005G145550--Sobic003G207500 Sobic002G031900 Sobic002G031900 Sobic005G145550--Sobic002G031900 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic005G145550--Sobic007G188800 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic005G145550--Sobic003G179350 Sobic004G111300 Sobic004G111300 Sobic005G145550--Sobic004G111300 Sobic005G189300--Sobic005G145550 Sobic005G189300--Sobic004G324700 Sobic005G189300--Sobic007G163001 Sobic005G189300--Sobic001G475100 Sobic005G189300--Sobic003G179350 Sobic010G142700 Sobic010G142700 Sobic005G189300--Sobic010G142700 Sobic005G189300--Sobic007G188800 Sobic005G149400 Sobic005G149400 Sobic005G189300--Sobic005G149400 Sobic008G051300 Sobic008G051300 Sobic005G189300--Sobic008G051300 Sobic007G163001--Sobic003G207500 Sobic007G163001--Sobic005G145550 Sobic003G251100 Sobic003G251100 Sobic007G163001--Sobic003G251100 Sobic007G163001--Sobic007G188800 Sobic007G163001--Sobic004G324700 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic007G163001--Sobic010G214500 Sobic007G163001--Sobic001G475100 Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic007G163001--Sobic008G111200 Sobic007G163001--Sobic002G031900 Sobic004G324700--Sobic005G145550 Sobic004G324700--Sobic007G163001 Sobic004G324700--Sobic005G189300 Sobic004G324700--Sobic002G031900 Sobic004G324700--Sobic010G214500 Sobic004G324700--Sobic008G111200 Sobic004G324700--Sobic004G111300 Sobic004G324700--Sobic003G207500 Sobic004G324700--Sobic003G179350 Sobic001G475100--Sobic005G145550 Sobic005G188300 Sobic005G188300 Sobic001G475100--Sobic005G188300 Sobic001G475100--Sobic007G163001 Sobic006G057600 Sobic006G057600 Sobic001G475100--Sobic006G057600 Sobic001G475100--Sobic003G207500 Sobic010G273300 Sobic010G273300 Sobic001G475100--Sobic010G273300 Sobic010G121100 Sobic010G121100 Sobic001G475100--Sobic010G121100 Sobic001G475100--Sobic007G188800 Sobic001G475100--Sobic008G111200 Sobic003G207500--Sobic007G163001 Sobic003G207500--Sobic004G111300 Sobic003G207500--Sobic005G145550 Sobic003G207500--Sobic007G188800 Sobic003G207500--Sobic003G251100 Sobic003G207500--Sobic001G475100 Sobic003G207500--Sobic008G111200 Sobic005G102900 Sobic005G102900 Sobic003G207500--Sobic005G102900 Sobic003G207500--Sobic004G324700 Sobic002G031900--Sobic005G145550 Sobic002G031900--Sobic004G324700 Sobic002G031900--Sobic007G163001 Sobic010G186100 Sobic010G186100 Sobic002G031900--Sobic010G186100 Sobic002G031900--Sobic008G111200 Sobic002G031900--Sobic001G475100 Sobic002G031900--Sobic003G207500 Sobic008G021400 Sobic008G021400 Sobic002G031900--Sobic008G021400 Sobic002G031900--Sobic010G214500 Sobic007G188800--Sobic007G163001 Sobic007G188800--Sobic003G207500 Sobic007G188800--Sobic005G145550 Sobic007G188800--Sobic003G251100 Sobic007G188800--Sobic010G273300 Sobic007G188800--Sobic001G475100 Sobic007G188800--Sobic005G102900 Sobic007G188800--Sobic010G214500 Sobic007G188800--Sobic005G189300 Sobic009G219100 Sobic009G219100 Sobic003G179350--Sobic009G219100 Sobic003G306600 Sobic003G306600 Sobic003G179350--Sobic003G306600 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic003G179350--Sobic007G185300 Sobic004G154400 Sobic004G154400 Sobic003G179350--Sobic004G154400 Sobic009G038701 Sobic009G038701 Sobic003G179350--Sobic009G038701 Sobic009G093100 Sobic009G093100 Sobic003G179350--Sobic009G093100 Sobic001G536700 Sobic001G536700 Sobic003G179350--Sobic001G536700 Sobic001G504400 Sobic001G504400 Sobic003G179350--Sobic001G504400 Sobic009G062400 Sobic009G062400 Sobic003G179350--Sobic009G062400 Sobic004G111300--Sobic003G207500 Sobic004G111300--Sobic003G179350 Sobic004G111300--Sobic007G185300 Sobic004G111300--Sobic007G163001 Sobic004G111300--Sobic005G145550 Sobic003G166200 Sobic003G166200 Sobic004G111300--Sobic003G166200 Sobic003G219200 Sobic003G219200 Sobic004G111300--Sobic003G219200 Sobic004G111300--Sobic004G324700 Sobic007G007200 Sobic007G007200 Sobic004G111300--Sobic007G007200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.