Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G424700.1
Synonym AtPOT1b, Sb02g043540
Functional annotation ATPOT1, putative, expressed
UniProt C5X6B0 , B7T1K8
Pfam PF02765
Panther DB PTHR14513
NCBI CDD KOG4757; Predicted telomere binding protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding GO:0000784nuclear chromosome, telomeric region GO:0000723telomere maintenance


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G06310 : Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g39280.1 : ATPOT1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057378 , Zm00025a056260
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G145000 expressed protein K14376: poly(A) polymerase
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Gene co-expression network
sample Sobic002G424700 Sobic002G424700 Sobic001G145000 Sobic001G145000 Sobic002G424700--Sobic001G145000 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic002G424700--Sobic004G334300 Sobic004G244900 Sobic004G244900 Sobic002G424700--Sobic004G244900 Sobic001G519900 Sobic001G519900 Sobic002G424700--Sobic001G519900 Sobic007G103100 Sobic007G103100 Sobic002G424700--Sobic007G103100 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic002G424700--Sobic007G185300 Sobic002G275700 Sobic002G275700 Sobic002G424700--Sobic002G275700 Sobic005G072100 Sobic005G072100 Sobic002G424700--Sobic005G072100 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic002G424700--Sobic007G090403 Sobic001G145000--Sobic002G424700 Sobic001G145000--Sobic004G334300 Sobic001G145000--Sobic002G275700 Sobic001G145000--Sobic004G244900 Sobic005G142800 Sobic005G142800 Sobic001G145000--Sobic005G142800 Sobic001G145000--Sobic007G103100 Sobic001G527800 Sobic001G527800 Sobic001G145000--Sobic001G527800 Sobic010G123600 Sobic010G123600 Sobic001G145000--Sobic010G123600 Sobic002G316600 Sobic002G316600 Sobic001G145000--Sobic002G316600 Sobic003G186000 Sobic003G186000 Sobic004G334300--Sobic003G186000 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic004G334300--Sobic008G001200 Sobic001G457800 Sobic001G457800 Sobic004G334300--Sobic001G457800 Sobic006G040500 Sobic006G040500 Sobic004G334300--Sobic006G040500 Sobic004G334300--Sobic010G123600 Sobic002G308700 Sobic002G308700 Sobic004G334300--Sobic002G308700 Sobic005G162500 Sobic005G162500 Sobic004G334300--Sobic005G162500 Sobic004G334300--Sobic004G244900 Sobic004G276400 Sobic004G276400 Sobic004G334300--Sobic004G276400 Sobic004G244900--Sobic001G457800 Sobic004G244900--Sobic004G334300 Sobic003G119600 Sobic003G119600 Sobic004G244900--Sobic003G119600 Sobic003G155100 Sobic003G155100 Sobic004G244900--Sobic003G155100 Sobic004G244900--Sobic008G001200 Sobic004G356700 Sobic004G356700 Sobic004G244900--Sobic004G356700 Sobic009G201300 Sobic009G201300 Sobic004G244900--Sobic009G201300 Sobic004G244900--Sobic002G275700 Sobic003G168100 Sobic003G168100 Sobic004G244900--Sobic003G168100 Sobic001G373900 Sobic001G373900 Sobic001G519900--Sobic001G373900 Sobic001G519900--Sobic004G334300 Sobic001G519900--Sobic002G308700 Sobic001G519900--Sobic003G186000 Sobic001G519900--Sobic005G162500 Sobic001G519900--Sobic004G356700 Sobic001G375100 Sobic001G375100 Sobic001G519900--Sobic001G375100 Sobic001G192000 Sobic001G192000 Sobic001G519900--Sobic001G192000 Sobic006G259800 Sobic006G259800 Sobic001G519900--Sobic006G259800 Sobic007G103100--Sobic002G316600 Sobic007G103100--Sobic003G186000 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic007G103100--Sobic001G194200 Sobic004G291900 Sobic004G291900 Sobic007G103100--Sobic004G291900 Sobic007G103100--Sobic004G276400 Sobic007G103100--Sobic001G527800 Sobic003G205200 Sobic003G205200 Sobic007G103100--Sobic003G205200 Sobic007G103100--Sobic002G275700 Sobic006G055200 Sobic006G055200 Sobic007G103100--Sobic006G055200 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic007G185300--Sobic003G179350 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic007G185300--Sobic002G173100 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic007G185300--Sobic003G190100 Sobic003G306600 Sobic003G306600 Sobic007G185300--Sobic003G306600 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic007G185300--Sobic002G244200 Sobic008G081900 Sobic008G081900 Sobic007G185300--Sobic008G081900 Sobic007G185300--Sobic007G090403 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic007G185300--Sobic005G133600 Sobic007G185300--Sobic002G424700 Sobic002G275700--Sobic001G192000 Sobic002G275700--Sobic001G194200 Sobic002G275700--Sobic007G103100 Sobic006G041600 Sobic006G041600 Sobic002G275700--Sobic006G041600 Sobic009G255700 Sobic009G255700 Sobic002G275700--Sobic009G255700 Sobic003G195000 Sobic003G195000 Sobic002G275700--Sobic003G195000 Sobic001G289800 Sobic001G289800 Sobic002G275700--Sobic001G289800 Sobic002G275700--Sobic001G527800 Sobic003G196300 Sobic003G196300 Sobic002G275700--Sobic003G196300 Sobic003G434700 Sobic003G434700 Sobic005G072100--Sobic003G434700 Sobic003G067100 Sobic003G067100 Sobic005G072100--Sobic003G067100 Sobic009G129100 Sobic009G129100 Sobic005G072100--Sobic009G129100 Sobic005G072100--Sobic003G168100 Sobic002G127550 Sobic002G127550 Sobic005G072100--Sobic002G127550 Sobic005G072100--Sobic002G316600 Sobic005G072100--Sobic001G145000 Sobic003G234900 Sobic003G234900 Sobic005G072100--Sobic003G234900 Sobic005G072100--Sobic004G244900 Sobic005G068700 Sobic005G068700 Sobic007G090403--Sobic005G068700 Sobic007G090403--Sobic002G244200 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic007G090403--Sobic006G219600 Sobic001G062900 Sobic001G062900 Sobic007G090403--Sobic001G062900 Sobic005G149200 Sobic005G149200 Sobic007G090403--Sobic005G149200 Sobic001G133000 Sobic001G133000 Sobic007G090403--Sobic001G133000 Sobic009G123900 Sobic009G123900 Sobic007G090403--Sobic009G123900 Sobic006G065100 Sobic006G065100 Sobic007G090403--Sobic006G065100 Sobic009G215500 Sobic009G215500 Sobic007G090403--Sobic009G215500
Octagon: transcription factors


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