Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G111200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PCZ3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
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Barley -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G163001 - -
2 Sobic.003G207500 signal peptide peptidase domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G475100 expressed protein -
4 Sobic.004G324700 - -
5 Sobic.002G031900 RFC1 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 1, expressed -
6 Sobic.005G145550 - -
7 Sobic.001G528500 - -
8 Sobic.005G188300 expressed protein -
9 Sobic.010G135250 - -
10 Sobic.010G057500 expressed protein K11138: telomere-associated protein RIF1
11 Sobic.010G214500 purple acid phosphatase, putative, expressed -
12 Sobic.004G146100 C2 domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G111300 - -
14 Sobic.009G043100 F-box/LRR-repeat protein 14, putative, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
15 Sobic.005G189300 - -
16 Sobic.006G057600 - -
17 Sobic.007G188800 "Candidate orthologue to the wheat Pm40 gene, Disease resistance RGA1"(PubMedID : 27755575)@CC-NBS-LRR, putative, expressed -
18 Sobic.010G186100 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
19 Sobic.001G478500 expressed protein -
20 Sobic.003G251100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic008G111200--Sobic007G163001 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic008G111200--Sobic003G207500 Sobic001G475100 Sobic001G475100 Sobic008G111200--Sobic001G475100 Sobic004G324700 Sobic004G324700 Sobic008G111200--Sobic004G324700 Sobic002G031900 Sobic002G031900 Sobic008G111200--Sobic002G031900 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic008G111200--Sobic005G145550 Sobic001G528500 Sobic001G528500 Sobic008G111200--Sobic001G528500 Sobic005G188300 Sobic005G188300 Sobic008G111200--Sobic005G188300 Sobic010G135250 Sobic010G135250 Sobic008G111200--Sobic010G135250 Sobic007G163001--Sobic003G207500 Sobic007G163001--Sobic005G145550 Sobic003G251100 Sobic003G251100 Sobic007G163001--Sobic003G251100 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic007G163001--Sobic007G188800 Sobic007G163001--Sobic004G324700 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic007G163001--Sobic010G214500 Sobic007G163001--Sobic001G475100 Sobic007G163001--Sobic008G111200 Sobic007G163001--Sobic002G031900 Sobic003G207500--Sobic007G163001 Sobic004G111300 Sobic004G111300 Sobic003G207500--Sobic004G111300 Sobic003G207500--Sobic005G145550 Sobic003G207500--Sobic007G188800 Sobic003G207500--Sobic003G251100 Sobic003G207500--Sobic001G475100 Sobic003G207500--Sobic008G111200 Sobic005G102900 Sobic005G102900 Sobic003G207500--Sobic005G102900 Sobic003G207500--Sobic004G324700 Sobic001G475100--Sobic005G145550 Sobic001G475100--Sobic005G188300 Sobic001G475100--Sobic007G163001 Sobic006G057600 Sobic006G057600 Sobic001G475100--Sobic006G057600 Sobic001G475100--Sobic003G207500 Sobic010G273300 Sobic010G273300 Sobic001G475100--Sobic010G273300 Sobic010G121100 Sobic010G121100 Sobic001G475100--Sobic010G121100 Sobic001G475100--Sobic007G188800 Sobic001G475100--Sobic008G111200 Sobic004G324700--Sobic005G145550 Sobic004G324700--Sobic007G163001 Sobic005G189300 Sobic005G189300 Sobic004G324700--Sobic005G189300 Sobic004G324700--Sobic002G031900 Sobic004G324700--Sobic010G214500 Sobic004G324700--Sobic008G111200 Sobic004G324700--Sobic004G111300 Sobic004G324700--Sobic003G207500 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic004G324700--Sobic003G179350 Sobic002G031900--Sobic005G145550 Sobic002G031900--Sobic004G324700 Sobic002G031900--Sobic007G163001 Sobic010G186100 Sobic010G186100 Sobic002G031900--Sobic010G186100 Sobic002G031900--Sobic008G111200 Sobic002G031900--Sobic001G475100 Sobic002G031900--Sobic003G207500 Sobic008G021400 Sobic008G021400 Sobic002G031900--Sobic008G021400 Sobic002G031900--Sobic010G214500 Sobic005G145550--Sobic005G189300 Sobic005G145550--Sobic007G163001 Sobic005G145550--Sobic004G324700 Sobic005G145550--Sobic001G475100 Sobic005G145550--Sobic003G207500 Sobic005G145550--Sobic002G031900 Sobic005G145550--Sobic007G188800 Sobic005G145550--Sobic003G179350 Sobic005G145550--Sobic004G111300 Sobic001G528400 Sobic001G528400 Sobic001G528500--Sobic001G528400 Sobic001G528500--Sobic008G111200 Sobic004G146100 Sobic004G146100 Sobic001G528500--Sobic004G146100 Sobic001G528500--Sobic010G214500 Sobic001G528500--Sobic003G207500 Sobic006G169500 Sobic006G169500 Sobic001G528500--Sobic006G169500 Sobic009G107080 Sobic009G107080 Sobic001G528500--Sobic009G107080 Sobic010G089800 Sobic010G089800 Sobic001G528500--Sobic010G089800 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic001G528500--Sobic003G351401 Sobic005G188300--Sobic001G475100 Sobic009G043100 Sobic009G043100 Sobic005G188300--Sobic009G043100 Sobic005G188300--Sobic005G145550 Sobic001G340000 Sobic001G340000 Sobic005G188300--Sobic001G340000 Sobic005G188300--Sobic008G111200 Sobic005G188300--Sobic010G273300 Sobic005G188300--Sobic007G163001 Sobic005G188300--Sobic005G189300 Sobic004G324300 Sobic004G324300 Sobic005G188300--Sobic004G324300 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic010G135250--Sobic010G137100 Sobic005G100250 Sobic005G100250 Sobic010G135250--Sobic005G100250 Sobic010G135250--Sobic003G251100 Sobic010G132900 Sobic010G132900 Sobic010G135250--Sobic010G132900 Sobic010G163400 Sobic010G163400 Sobic010G135250--Sobic010G163400 Sobic010G135250--Sobic003G207500 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic010G135250--Sobic010G102366 Sobic010G135250--Sobic007G163001 Sobic010G135250--Sobic008G111200
Octagon: transcription factors


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