Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G146100.1
Synonym NTMC2T5.2, NTMC2TYPE5.2
Functional annotation C2 domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A194YPQ7
Pfam -
Panther DB PTHR10774 PTHR10774:SF82
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19830 : Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g58230.1 : C2 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G091200 - -
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12 Sobic.009G093800 - -
13 Sobic.006G150001 - -
14 Sobic.001G262800 - -
15 Sobic.005G159801 - -
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18 Sobic.002G236500 OsPOP19 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed -
19 Sobic.010G089800 expressed protein -
20 Sobic.003G217200 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G146100 Sobic004G146100 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic004G146100--Sobic001G091200 Sobic006G192332 Sobic006G192332 Sobic004G146100--Sobic006G192332 Sobic001G528500 Sobic001G528500 Sobic004G146100--Sobic001G528500 Sobic003G396700 Sobic003G396700 Sobic004G146100--Sobic003G396700 Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic004G146100--Sobic008G111200 Sobic003G388000 Sobic003G388000 Sobic004G146100--Sobic003G388000 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic004G146100--Sobic001G273000 Sobic002G393332 Sobic002G393332 Sobic004G146100--Sobic002G393332 Sobic006G057600 Sobic006G057600 Sobic004G146100--Sobic006G057600 Sobic001G091200--Sobic004G146100 Sobic003G208500 Sobic003G208500 Sobic001G091200--Sobic003G208500 Sobic001G091200--Sobic003G388000 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic001G091200--Sobic005G159801 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic001G091200--Sobic001G260300 Sobic001G475000 Sobic001G475000 Sobic001G091200--Sobic001G475000 Sobic001G091200--Sobic001G273000 Sobic008G168700 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Octagon: transcription factors


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