Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G135250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VSV2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g47240.3 : STE_MEKK_ste11_MAP3K.17 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G137100 - -
2 Sobic.005G100250 - -
3 Sobic.003G251100 - -
4 Sobic.010G132900 - -
5 Sobic.010G163400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed -
6 Sobic.003G207500 signal peptide peptidase domain containing protein, expressed -
7 Sobic.010G102366 - -
8 Sobic.007G163001 - -
9 Sobic.008G111200 - -
10 Sobic.004G267900 expressed protein K10756: replication factor C subunit 3/5
11 Sobic.001G475100 expressed protein -
12 Sobic.010G273300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
13 Sobic.003G351401 - -
14 Sobic.008G044900 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@expressed protein -
15 Sobic.007G188800 "Candidate orthologue to the wheat Pm40 gene, Disease resistance RGA1"(PubMedID : 27755575)@CC-NBS-LRR, putative, expressed -
16 Sobic.005G188300 expressed protein -
17 Sobic.002G405200 AMP deaminase, putative, expressed K01488: add, adenosine deaminase
18 Sobic.003G032600 - -
19 Sobic.005G145550 - -
20 Sobic.001G528500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G135250 Sobic010G135250 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic010G135250--Sobic010G137100 Sobic005G100250 Sobic005G100250 Sobic010G135250--Sobic005G100250 Sobic003G251100 Sobic003G251100 Sobic010G135250--Sobic003G251100 Sobic010G132900 Sobic010G132900 Sobic010G135250--Sobic010G132900 Sobic010G163400 Sobic010G163400 Sobic010G135250--Sobic010G163400 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic010G135250--Sobic003G207500 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic010G135250--Sobic010G102366 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic010G135250--Sobic007G163001 Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic010G135250--Sobic008G111200 Sobic010G137100--Sobic010G102366 Sobic010G137100--Sobic010G135250 Sobic002G286300 Sobic002G286300 Sobic010G137100--Sobic002G286300 Sobic010G137100--Sobic003G207500 Sobic004G340300 Sobic004G340300 Sobic010G137100--Sobic004G340300 Sobic010G137100--Sobic010G132900 Sobic010G137100--Sobic010G163400 Sobic001G182850 Sobic001G182850 Sobic010G137100--Sobic001G182850 Sobic010G137100--Sobic003G251100 Sobic005G100250--Sobic010G135250 Sobic005G100250--Sobic010G132900 Sobic003G032600 Sobic003G032600 Sobic005G100250--Sobic003G032600 Sobic010G028501 Sobic010G028501 Sobic005G100250--Sobic010G028501 Sobic009G089101 Sobic009G089101 Sobic005G100250--Sobic009G089101 Sobic005G213100 Sobic005G213100 Sobic005G100250--Sobic005G213100 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic005G100250--Sobic009G093800 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic005G100250--Sobic003G134700 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic005G100250--Sobic003G351401 Sobic003G251100--Sobic007G163001 Sobic003G251100--Sobic003G207500 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic003G251100--Sobic007G188800 Sobic003G251100--Sobic010G135250 Sobic001G475100 Sobic001G475100 Sobic003G251100--Sobic001G475100 Sobic006G268600 Sobic006G268600 Sobic003G251100--Sobic006G268600 Sobic005G102900 Sobic005G102900 Sobic003G251100--Sobic005G102900 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic003G251100--Sobic005G145550 Sobic009G014332 Sobic009G014332 Sobic003G251100--Sobic009G014332 Sobic010G132900--Sobic010G135250 Sobic010G132900--Sobic005G100250 Sobic010G132900--Sobic010G137100 Sobic010G132900--Sobic010G163400 Sobic010G132900--Sobic010G102366 Sobic001G201900 Sobic001G201900 Sobic010G132900--Sobic001G201900 Sobic010G132900--Sobic005G145550 Sobic010G132900--Sobic003G351401 Sobic003G261566 Sobic003G261566 Sobic010G132900--Sobic003G261566 Sobic010G163400--Sobic010G135250 Sobic004G111300 Sobic004G111300 Sobic010G163400--Sobic004G111300 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic010G163400--Sobic007G185300 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic010G163400--Sobic003G179350 Sobic002G129400 Sobic002G129400 Sobic010G163400--Sobic002G129400 Sobic010G163400--Sobic003G207500 Sobic010G163400--Sobic003G251100 Sobic003G166200 Sobic003G166200 Sobic010G163400--Sobic003G166200 Sobic010G121100 Sobic010G121100 Sobic010G163400--Sobic010G121100 Sobic003G207500--Sobic007G163001 Sobic003G207500--Sobic004G111300 Sobic003G207500--Sobic005G145550 Sobic003G207500--Sobic007G188800 Sobic003G207500--Sobic003G251100 Sobic003G207500--Sobic001G475100 Sobic003G207500--Sobic008G111200 Sobic003G207500--Sobic005G102900 Sobic004G324700 Sobic004G324700 Sobic003G207500--Sobic004G324700 Sobic010G102366--Sobic010G137100 Sobic010G102366--Sobic003G134700 Sobic010G102366--Sobic010G135250 Sobic004G350800 Sobic004G350800 Sobic010G102366--Sobic004G350800 Sobic010G102366--Sobic004G340300 Sobic010G102366--Sobic010G132900 Sobic010G102366--Sobic003G351401 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic010G102366--Sobic003G112001 Sobic010G102366--Sobic002G286300 Sobic007G163001--Sobic003G207500 Sobic007G163001--Sobic005G145550 Sobic007G163001--Sobic003G251100 Sobic007G163001--Sobic007G188800 Sobic007G163001--Sobic004G324700 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic007G163001--Sobic010G214500 Sobic007G163001--Sobic001G475100 Sobic007G163001--Sobic008G111200 Sobic002G031900 Sobic002G031900 Sobic007G163001--Sobic002G031900 Sobic008G111200--Sobic007G163001 Sobic008G111200--Sobic003G207500 Sobic008G111200--Sobic001G475100 Sobic008G111200--Sobic004G324700 Sobic008G111200--Sobic002G031900 Sobic008G111200--Sobic005G145550 Sobic001G528500 Sobic001G528500 Sobic008G111200--Sobic001G528500 Sobic005G188300 Sobic005G188300 Sobic008G111200--Sobic005G188300 Sobic008G111200--Sobic010G135250
Octagon: transcription factors


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