Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G188300.3,Sobic.005G188300.7,Sobic.005G188300.9,Sobic.005G188300.10,Sobic.005G188300.12,Sobic.005G188300.8,Sobic.005G188300.6,Sobic.005G188300.5,Sobic.005G188300.2,Sobic.005G188300.11,Sobic.005G188300.1,Sobic.005G188300.4
Synonym Sb05g024570
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RJW5 , A0A1B6PTF7 , A0A1Z5RJB2 , C5Y6F5 , A0A1Z5RJE2
Pfam -
Panther DB PTHR36773
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G63390 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g40200.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029337
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G475100 expressed protein -
2 Sobic.009G043100 F-box/LRR-repeat protein 14, putative, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
3 Sobic.005G145550 - -
4 Sobic.001G340000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10696: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1
5 Sobic.008G111200 - -
6 Sobic.010G273300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
7 Sobic.007G163001 - -
8 Sobic.005G189300 - -
9 Sobic.004G324300 expressed protein -
10 Sobic.006G057600 - -
11 Sobic.004G324700 - -
12 Sobic.010G142700 - -
13 Sobic.003G207500 signal peptide peptidase domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G061900 - K10896: fanconi anemia group M protein
15 Sobic.001G475200 expressed protein -
16 Sobic.010G244900 auxin efflux carrier, putative, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
17 Sobic.008G032900 digestive organ expansion factor, putative, expressed K14774: UTP25, U3 small nucleolar RNA-associated protein 25
18 Sobic.008G152000 biotin--protein ligase, putative, expressed K03801: lipoyl(octanoyl) transferase
19 Sobic.001G288700 armadillo/beta-catenin-like repeat containing protein, expressed -
20 Sobic.004G018000 bifunctional protein folD, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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