Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G142700.3,Sobic.010G142700.2,Sobic.010G142700.4,Sobic.010G142700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YK97
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G431400 40S ribosomal protein S3a, putative, expressed K02984: RP-S3Ae, small subunit ribosomal protein S3Ae
2 Sobic.002G047000 YT521-B, putative, expressed -
3 Sobic.002G231500 phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K01923: phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase
4 Sobic.002G389900 ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G189300 - -
6 Sobic.009G016400 RNA recognition motif containing protein, expressed -
7 Sobic.002G112100 - K14811: ATP-dependent RNA helicase DBP3
8 Sobic.006G057600 - -
9 Sobic.007G197450 - -
10 Sobic.009G045900 tRNA synthetase class II core domain containing protein, expressed K01892: HARS, histidyl-tRNA synthetase
11 Sobic.009G043100 F-box/LRR-repeat protein 14, putative, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
12 Sobic.009G046100 phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain, putative, expressed K01890: FARSB, phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain
13 Sobic.004G256000 NOL1/NOP2/sun family protein, putative, expressed K14835: 25S rRNA (cytosine2870-C5)-methyltransferase
14 Sobic.005G188300 expressed protein -
15 Sobic.002G234300 NOL1/NOP2/sun family protein, putative, expressed K15334: NCL1, multisite-specific tRNA:(cytosine-C5)-methyltransferase
16 Sobic.010G102600 pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.001G003100 T-complex protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G330000 U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, putative, expressed K14769: U3 small nucleolar RNA-associated protein 11
19 Sobic.003G083400 cytoskeletal protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G475100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G142700 Sobic010G142700 Sobic001G431400 Sobic001G431400 Sobic010G142700--Sobic001G431400 Sobic002G047000 Sobic002G047000 Sobic010G142700--Sobic002G047000 Sobic002G231500 Sobic002G231500 Sobic010G142700--Sobic002G231500 Sobic002G389900 Sobic002G389900 Sobic010G142700--Sobic002G389900 Sobic005G189300 Sobic005G189300 Sobic010G142700--Sobic005G189300 Sobic009G016400 Sobic009G016400 Sobic010G142700--Sobic009G016400 Sobic002G112100 Sobic002G112100 Sobic010G142700--Sobic002G112100 Sobic006G057600 Sobic006G057600 Sobic010G142700--Sobic006G057600 Sobic007G197450 Sobic007G197450 Sobic010G142700--Sobic007G197450 Sobic002G171300 Sobic002G171300 Sobic001G431400--Sobic002G171300 Sobic001G431400--Sobic010G142700 Sobic001G431400--Sobic002G047000 Sobic009G124900 Sobic009G124900 Sobic001G431400--Sobic009G124900 Sobic003G032600 Sobic003G032600 Sobic001G431400--Sobic003G032600 Sobic009G045900 Sobic009G045900 Sobic001G431400--Sobic009G045900 Sobic004G315500 Sobic004G315500 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Octagon: transcription factors


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