Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G431400.2
Synonym Sb01g040570
Functional annotation 40S ribosomal protein S3a, putative, expressed
UniProt A0A1Z5SAK7
Pfam PF01015
Panther DB PTHR11830
NCBI CDD KOG1628; 40S ribosomal protein S3A
KEGG Orthology K02984; RP-S3Ae, small subunit ribosomal protein S3Ae
Gene Ontology GO:0003735; structural constituent of ribosome GO:0005622intracellular GO:0005840ribosome GO:0006412translation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G04840 : Ribosomal protein S3Ae
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g21798.1 : 40S ribosomal protein S3a, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001174 , Zm00025a053152
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G070370.3 , HORVU4Hr1G070370.1 , HORVU4Hr1G070370.5 , HORVU4Hr1G070370.4 , HORVU4Hr1G070370.2
Wheat TraesCS4A02G044700 , TraesCS4B02G260600 , TraesCS4D02G260400
Populus -


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19 Sobic.004G224600 expressed protein -
20 Sobic.007G134100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G431400 Sobic001G431400 Sobic002G171300 Sobic002G171300 Sobic001G431400--Sobic002G171300 Sobic010G142700 Sobic010G142700 Sobic001G431400--Sobic010G142700 Sobic002G047000 Sobic002G047000 Sobic001G431400--Sobic002G047000 Sobic009G124900 Sobic009G124900 Sobic001G431400--Sobic009G124900 Sobic003G032600 Sobic003G032600 Sobic001G431400--Sobic003G032600 Sobic009G045900 Sobic009G045900 Sobic001G431400--Sobic009G045900 Sobic004G315500 Sobic004G315500 Sobic001G431400--Sobic004G315500 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic001G431400--Sobic001G248100 Sobic009G134900 Sobic009G134900 Sobic001G431400--Sobic009G134900 Sobic005G108000 Sobic005G108000 Sobic002G171300--Sobic005G108000 Sobic003G146600 Sobic003G146600 Sobic002G171300--Sobic003G146600 Sobic004G224600 Sobic004G224600 Sobic002G171300--Sobic004G224600 Sobic006G002800 Sobic006G002800 Sobic002G171300--Sobic006G002800 Sobic009G211200 Sobic009G211200 Sobic002G171300--Sobic009G211200 Sobic005G026400 Sobic005G026400 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Octagon: transcription factors


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