Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G124900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P8F6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.009G124900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G271700 L-asparaginase precursor protein, putative, expressed K08657: taspase, threonine aspartase, 1
2 Sobic.001G431400 40S ribosomal protein S3a, putative, expressed K02984: RP-S3Ae, small subunit ribosomal protein S3Ae
3 Sobic.007G159200 PWWP domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G032600 - -
5 Sobic.010G038100 OsFBDUF30 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G248100 histone acetyltransferase GCN5, putative, expressed K06062: PCAF, KAT2, histone acetyltransferase
7 Sobic.004G235300 mTERF family protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
8 Sobic.008G045000 expressed protein -
9 Sobic.006G080400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K11851: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30
10 Sobic.004G034700 cleavage and polyadenylation specificity factor, putative, expressed K12830: SF3B3, SAP130, splicing factor 3B subunit 3
11 Sobic.006G067600 histone deacetylase, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
12 Sobic.007G168300 UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase SPINDLY, putative, expressed -
13 Sobic.002G052700 cyclophilin, putative, expressed K09566: peptidyl-prolyl isomerase G (cyclophilin G)
14 Sobic.006G270600 PSF1 - Putative GINS complex subunit, expressed K10732: GINS1, GINS complex subunit 1
15 Sobic.008G080500 expressed protein -
16 Sobic.004G155600 dnaJ domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G342300 expressed protein -
18 Sobic.001G544500 expressed protein -
19 Sobic.001G052400 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14573: NOP4, nucleolar protein 4
20 Sobic.002G171300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G124900 Sobic009G124900 Sobic006G271700 Sobic006G271700 Sobic009G124900--Sobic006G271700 Sobic001G431400 Sobic001G431400 Sobic009G124900--Sobic001G431400 Sobic007G159200 Sobic007G159200 Sobic009G124900--Sobic007G159200 Sobic003G032600 Sobic003G032600 Sobic009G124900--Sobic003G032600 Sobic010G038100 Sobic010G038100 Sobic009G124900--Sobic010G038100 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic009G124900--Sobic001G248100 Sobic004G235300 Sobic004G235300 Sobic009G124900--Sobic004G235300 Sobic008G045000 Sobic008G045000 Sobic009G124900--Sobic008G045000 Sobic006G080400 Sobic006G080400 Sobic009G124900--Sobic006G080400 Sobic006G271700--Sobic009G124900 Sobic004G034700 Sobic004G034700 Sobic006G271700--Sobic004G034700 Sobic006G067600 Sobic006G067600 Sobic006G271700--Sobic006G067600 Sobic006G271700--Sobic001G248100 Sobic001G002600 Sobic001G002600 Sobic006G271700--Sobic001G002600 Sobic009G007700 Sobic009G007700 Sobic006G271700--Sobic009G007700 Sobic001G020000 Sobic001G020000 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Octagon: transcription factors


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