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Transcriptome id Sobic.002G171300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QBX8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G108000 - -
2 Sobic.003G146600 pumilio-family RNA binding repeat containing protein, expressed K14790: nucleolar protein 9
3 Sobic.004G224600 expressed protein -
4 Sobic.006G002800 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed K15332: tRNA (uracil-5-)-methyltransferase
5 Sobic.009G211200 tRNAHis guanylyltransferase family protein, expressed K10761: tRNA(His) guanylyltransferase
6 Sobic.005G026400 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G431400 40S ribosomal protein S3a, putative, expressed K02984: RP-S3Ae, small subunit ribosomal protein S3Ae
8 Sobic.002G235200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G102600 pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.004G017400 expressed protein -
11 Sobic.001G393900 FAD binding domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G007100 AAA family ATPase, putative, expressed K14571: RIX7, ribosome biogenesis ATPase
13 Sobic.001G376900 utp14 protein, putative, expressed K14567: U3 small nucleolar RNA-associated protein 14
14 Sobic.006G178100 coiled-coil domain-containing protein 139, putative, expressed K07583: tRNA pseudouridine synthase 10
15 Sobic.010G055700 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K03217: yidC, spoIIIJ, OXA1, YidC/Oxa1 family membrane protein insertase
16 Sobic.008G160000 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G031500 - -
18 Sobic.008G051200 chaperone protein dnaJ, putative, expressed K03686: molecular chaperone DnaJ
19 Sobic.001G401500 programmed cell death protein 2, putative, expressed K14801: pre-rRNA-processing protein TSR4
20 Sobic.008G014801 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G171300 Sobic002G171300 Sobic005G108000 Sobic005G108000 Sobic002G171300--Sobic005G108000 Sobic003G146600 Sobic003G146600 Sobic002G171300--Sobic003G146600 Sobic004G224600 Sobic004G224600 Sobic002G171300--Sobic004G224600 Sobic006G002800 Sobic006G002800 Sobic002G171300--Sobic006G002800 Sobic009G211200 Sobic009G211200 Sobic002G171300--Sobic009G211200 Sobic005G026400 Sobic005G026400 Sobic002G171300--Sobic005G026400 Sobic001G431400 Sobic001G431400 Sobic002G171300--Sobic001G431400 Sobic002G235200 Sobic002G235200 Sobic002G171300--Sobic002G235200 Sobic010G102600 Sobic010G102600 Sobic002G171300--Sobic010G102600 Sobic001G346900 Sobic001G346900 Sobic005G108000--Sobic001G346900 Sobic002G127200 Sobic002G127200 Sobic005G108000--Sobic002G127200 Sobic005G108000--Sobic004G224600 Sobic006G178100 Sobic006G178100 Sobic005G108000--Sobic006G178100 Sobic005G108000--Sobic002G171300 Sobic005G108000--Sobic009G211200 Sobic010G080550 Sobic010G080550 Sobic005G108000--Sobic010G080550 Sobic005G108000--Sobic006G002800 Sobic006G245900 Sobic006G245900 Sobic005G108000--Sobic006G245900 Sobic003G308500 Sobic003G308500 Sobic003G146600--Sobic003G308500 Sobic003G146600--Sobic004G224600 Sobic003G146600--Sobic006G002800 Sobic003G146600--Sobic002G235200 Sobic001G145400 Sobic001G145400 Sobic003G146600--Sobic001G145400 Sobic002G150700 Sobic002G150700 Sobic003G146600--Sobic002G150700 Sobic001G065100 Sobic001G065100 Sobic003G146600--Sobic001G065100 Sobic003G039000 Sobic003G039000 Sobic003G146600--Sobic003G039000 Sobic003G012000 Sobic003G012000 Sobic003G146600--Sobic003G012000 Sobic004G224600--Sobic006G002800 Sobic004G224600--Sobic003G146600 Sobic001G376900 Sobic001G376900 Sobic004G224600--Sobic001G376900 Sobic006G125500 Sobic006G125500 Sobic004G224600--Sobic006G125500 Sobic004G224600--Sobic002G235200 Sobic009G246500 Sobic009G246500 Sobic004G224600--Sobic009G246500 Sobic003G042400 Sobic003G042400 Sobic004G224600--Sobic003G042400 Sobic004G224600--Sobic001G145400 Sobic006G086600 Sobic006G086600 Sobic004G224600--Sobic006G086600 Sobic006G002800--Sobic003G308500 Sobic006G002800--Sobic004G224600 Sobic006G002800--Sobic002G150700 Sobic006G002800--Sobic001G145400 Sobic006G002800--Sobic003G146600 Sobic010G007100 Sobic010G007100 Sobic006G002800--Sobic010G007100 Sobic004G321700 Sobic004G321700 Sobic006G002800--Sobic004G321700 Sobic009G234700 Sobic009G234700 Sobic006G002800--Sobic009G234700 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic006G002800--Sobic008G147200 Sobic001G429600 Sobic001G429600 Sobic009G211200--Sobic001G429600 Sobic006G125900 Sobic006G125900 Sobic009G211200--Sobic006G125900 Sobic009G211200--Sobic004G224600 Sobic001G401500 Sobic001G401500 Sobic009G211200--Sobic001G401500 Sobic002G105101 Sobic002G105101 Sobic009G211200--Sobic002G105101 Sobic009G101200 Sobic009G101200 Sobic009G211200--Sobic009G101200 Sobic009G211200--Sobic006G002800 Sobic009G211200--Sobic005G108000 Sobic001G393900 Sobic001G393900 Sobic009G211200--Sobic001G393900 Sobic002G398700 Sobic002G398700 Sobic005G026400--Sobic002G398700 Sobic005G026400--Sobic003G146600 Sobic005G026400--Sobic004G224600 Sobic005G026400--Sobic002G235200 Sobic005G026400--Sobic003G308500 Sobic002G356200 Sobic002G356200 Sobic005G026400--Sobic002G356200 Sobic005G026400--Sobic003G012000 Sobic003G143800 Sobic003G143800 Sobic005G026400--Sobic003G143800 Sobic001G015400 Sobic001G015400 Sobic005G026400--Sobic001G015400 Sobic001G431400--Sobic002G171300 Sobic010G142700 Sobic010G142700 Sobic001G431400--Sobic010G142700 Sobic002G047000 Sobic002G047000 Sobic001G431400--Sobic002G047000 Sobic009G124900 Sobic009G124900 Sobic001G431400--Sobic009G124900 Sobic003G032600 Sobic003G032600 Sobic001G431400--Sobic003G032600 Sobic009G045900 Sobic009G045900 Sobic001G431400--Sobic009G045900 Sobic004G315500 Sobic004G315500 Sobic001G431400--Sobic004G315500 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic001G431400--Sobic001G248100 Sobic009G134900 Sobic009G134900 Sobic001G431400--Sobic009G134900 Sobic002G235200--Sobic006G086600 Sobic001G089600 Sobic001G089600 Sobic002G235200--Sobic001G089600 Sobic002G235200--Sobic001G145400 Sobic010G059500 Sobic010G059500 Sobic002G235200--Sobic010G059500 Sobic002G235200--Sobic003G146600 Sobic006G166200 Sobic006G166200 Sobic002G235200--Sobic006G166200 Sobic003G036400 Sobic003G036400 Sobic002G235200--Sobic003G036400 Sobic004G320500 Sobic004G320500 Sobic002G235200--Sobic004G320500 Sobic002G235200--Sobic004G224600 Sobic008G014801 Sobic008G014801 Sobic010G102600--Sobic008G014801 Sobic010G102600--Sobic001G089600 Sobic010G102600--Sobic004G320500 Sobic001G453400 Sobic001G453400 Sobic010G102600--Sobic001G453400 Sobic001G493700 Sobic001G493700 Sobic010G102600--Sobic001G493700 Sobic005G122700 Sobic005G122700 Sobic010G102600--Sobic005G122700 Sobic010G115400 Sobic010G115400 Sobic010G102600--Sobic010G115400 Sobic010G003400 Sobic010G003400 Sobic010G102600--Sobic010G003400 Sobic003G166750 Sobic003G166750 Sobic010G102600--Sobic003G166750
Octagon: transcription factors


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