Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G475200.1
Synonym Sb01g044520
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WUT6
Pfam PF13365
Panther DB PTHR18868 PTHR18868:SF17
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g47030.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G475200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G475000 expressed protein -
2 Sobic.002G071300 - -
3 Sobic.008G021400 cysteine-rich receptor-like protein kinase 7 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.001G475100 expressed protein -
5 Sobic.005G188300 expressed protein -
6 Sobic.004G324300 expressed protein -
7 Sobic.010G273300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.003G388000 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K03350: APC3, anaphase-promoting complex subunit 3
9 Sobic.006G192332 - -
10 Sobic.001G091100 - -
11 Sobic.009G043100 F-box/LRR-repeat protein 14, putative, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
12 Sobic.004G324800 expressed protein -
13 Sobic.001G340000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10696: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1
14 Sobic.008G044900 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@expressed protein -
15 Sobic.003G251100 - -
16 Sobic.001G261484 - -
17 Sobic.007G188800 "Candidate orthologue to the wheat Pm40 gene, Disease resistance RGA1"(PubMedID : 27755575)@CC-NBS-LRR, putative, expressed -
18 Sobic.005G145550 - -
19 Sobic.002G031900 RFC1 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 1, expressed -
20 Sobic.006G057600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G475200 Sobic001G475200 Sobic001G475000 Sobic001G475000 Sobic001G475200--Sobic001G475000 Sobic002G071300 Sobic002G071300 Sobic001G475200--Sobic002G071300 Sobic008G021400 Sobic008G021400 Sobic001G475200--Sobic008G021400 Sobic001G475100 Sobic001G475100 Sobic001G475200--Sobic001G475100 Sobic005G188300 Sobic005G188300 Sobic001G475200--Sobic005G188300 Sobic004G324300 Sobic004G324300 Sobic001G475200--Sobic004G324300 Sobic010G273300 Sobic010G273300 Sobic001G475200--Sobic010G273300 Sobic003G388000 Sobic003G388000 Sobic001G475200--Sobic003G388000 Sobic006G192332 Sobic006G192332 Sobic001G475200--Sobic006G192332 Sobic003G023200 Sobic003G023200 Sobic001G475000--Sobic003G023200 Sobic001G475000--Sobic006G192332 Sobic001G475000--Sobic001G475200 Sobic001G475000--Sobic003G388000 Sobic007G154350 Sobic007G154350 Sobic001G475000--Sobic007G154350 Sobic010G002800 Sobic010G002800 Sobic001G475000--Sobic010G002800 Sobic003G166500 Sobic003G166500 Sobic001G475000--Sobic003G166500 Sobic002G076500 Sobic002G076500 Sobic001G475000--Sobic002G076500 Sobic001G097900 Sobic001G097900 Sobic001G475000--Sobic001G097900 Sobic002G071300--Sobic001G475200 Sobic002G071300--Sobic010G273300 Sobic002G071300--Sobic008G021400 Sobic002G071300--Sobic005G188300 Sobic006G057600 Sobic006G057600 Sobic002G071300--Sobic006G057600 Sobic009G043100 Sobic009G043100 Sobic002G071300--Sobic009G043100 Sobic002G071300--Sobic001G475100 Sobic009G019800 Sobic009G019800 Sobic002G071300--Sobic009G019800 Sobic002G426300 Sobic002G426300 Sobic002G071300--Sobic002G426300 Sobic008G021400--Sobic010G273300 Sobic001G292900 Sobic001G292900 Sobic008G021400--Sobic001G292900 Sobic001G340000 Sobic001G340000 Sobic008G021400--Sobic001G340000 Sobic008G044900 Sobic008G044900 Sobic008G021400--Sobic008G044900 Sobic002G031900 Sobic002G031900 Sobic008G021400--Sobic002G031900 Sobic010G121100 Sobic010G121100 Sobic008G021400--Sobic010G121100 Sobic009G217400 Sobic009G217400 Sobic008G021400--Sobic009G217400 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic008G021400--Sobic005G145550 Sobic008G021400--Sobic001G475200 Sobic001G475100--Sobic005G145550 Sobic001G475100--Sobic005G188300 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic001G475100--Sobic007G163001 Sobic001G475100--Sobic006G057600 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic001G475100--Sobic003G207500 Sobic001G475100--Sobic010G273300 Sobic001G475100--Sobic010G121100 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic001G475100--Sobic007G188800 Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic001G475100--Sobic008G111200 Sobic005G188300--Sobic001G475100 Sobic005G188300--Sobic009G043100 Sobic005G188300--Sobic005G145550 Sobic005G188300--Sobic001G340000 Sobic005G188300--Sobic008G111200 Sobic005G188300--Sobic010G273300 Sobic005G188300--Sobic007G163001 Sobic005G189300 Sobic005G189300 Sobic005G188300--Sobic005G189300 Sobic005G188300--Sobic004G324300 Sobic004G324800 Sobic004G324800 Sobic004G324300--Sobic004G324800 Sobic004G324300--Sobic001G475100 Sobic004G324300--Sobic005G189300 Sobic004G324300--Sobic005G188300 Sobic004G324300--Sobic005G145550 Sobic004G324300--Sobic006G057600 Sobic004G324700 Sobic004G324700 Sobic004G324300--Sobic004G324700 Sobic004G324300--Sobic007G163001 Sobic004G324300--Sobic001G475200 Sobic010G273300--Sobic008G044900 Sobic010G273300--Sobic008G021400 Sobic010G205600 Sobic010G205600 Sobic010G273300--Sobic010G205600 Sobic010G273300--Sobic001G475100 Sobic010G273300--Sobic007G188800 Sobic010G273300--Sobic001G340000 Sobic010G273300--Sobic010G121100 Sobic005G061900 Sobic005G061900 Sobic010G273300--Sobic005G061900 Sobic010G273300--Sobic005G188300 Sobic002G371600 Sobic002G371600 Sobic003G388000--Sobic002G371600 Sobic004G322300 Sobic004G322300 Sobic003G388000--Sobic004G322300 Sobic002G160700 Sobic002G160700 Sobic003G388000--Sobic002G160700 Sobic004G030400 Sobic004G030400 Sobic003G388000--Sobic004G030400 Sobic004G177600 Sobic004G177600 Sobic003G388000--Sobic004G177600 Sobic003G396700 Sobic003G396700 Sobic003G388000--Sobic003G396700 Sobic010G188000 Sobic010G188000 Sobic003G388000--Sobic010G188000 Sobic003G388000--Sobic001G340000 Sobic003G388000--Sobic001G475000 Sobic006G192332--Sobic001G475000 Sobic006G192332--Sobic003G396700 Sobic006G192332--Sobic001G340000 Sobic006G192332--Sobic007G154350 Sobic006G192332--Sobic003G388000 Sobic004G146100 Sobic004G146100 Sobic006G192332--Sobic004G146100 Sobic009G040250 Sobic009G040250 Sobic006G192332--Sobic009G040250 Sobic009G000100 Sobic009G000100 Sobic006G192332--Sobic009G000100 Sobic002G241600 Sobic002G241600 Sobic006G192332--Sobic002G241600
Octagon: transcription factors


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