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Transcriptome id Sobic.006G192332.1
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UniProt A0A1Z5RF56
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KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G475000 expressed protein -
2 Sobic.003G396700 DCL2, putative, expressed K11592: DICER1, endoribonuclease Dicer
3 Sobic.001G340000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10696: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1
4 Sobic.007G154350 - -
5 Sobic.003G388000 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K03350: APC3, anaphase-promoting complex subunit 3
6 Sobic.004G146100 C2 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.009G040250 - -
8 Sobic.009G000100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transcriptional repressor, putative, expressed K11644: paired amphipathic helix protein Sin3a
9 Sobic.002G241600 - -
10 Sobic.003G256800 RNA polymerase III subunit RPC82 family protein, putative, expressed K03023: RPC3, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3
11 Sobic.010G007900 - -
12 Sobic.003G023200 DNA repair protein Rad51, putative, expressed K10870: RAD51L2, RAD51-like protein 2
13 Sobic.010G186100 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
14 Sobic.001G475200 expressed protein -
15 Sobic.001G097900 expressed protein -
16 Sobic.005G061900 - K10896: fanconi anemia group M protein
17 Sobic.001G091200 - -
18 Sobic.009G254100 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12818: DHX8, ATP-dependent RNA helicase DHX8/PRP22
19 Sobic.002G076500 protein Kinase-associated protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
20 Sobic.002G095100 RNA-binding region RNP-1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G192332 Sobic006G192332 Sobic001G475000 Sobic001G475000 Sobic006G192332--Sobic001G475000 Sobic003G396700 Sobic003G396700 Sobic006G192332--Sobic003G396700 Sobic001G340000 Sobic001G340000 Sobic006G192332--Sobic001G340000 Sobic007G154350 Sobic007G154350 Sobic006G192332--Sobic007G154350 Sobic003G388000 Sobic003G388000 Sobic006G192332--Sobic003G388000 Sobic004G146100 Sobic004G146100 Sobic006G192332--Sobic004G146100 Sobic009G040250 Sobic009G040250 Sobic006G192332--Sobic009G040250 Sobic009G000100 Sobic009G000100 Sobic006G192332--Sobic009G000100 Sobic002G241600 Sobic002G241600 Sobic006G192332--Sobic002G241600 Sobic003G023200 Sobic003G023200 Sobic001G475000--Sobic003G023200 Sobic001G475000--Sobic006G192332 Sobic001G475200 Sobic001G475200 Sobic001G475000--Sobic001G475200 Sobic001G475000--Sobic003G388000 Sobic001G475000--Sobic007G154350 Sobic010G002800 Sobic010G002800 Sobic001G475000--Sobic010G002800 Sobic003G166500 Sobic003G166500 Sobic001G475000--Sobic003G166500 Sobic002G076500 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Octagon: transcription factors


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